184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1640 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1640  hypothetical protein  100 
 
 
567 aa  1111    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52354  normal  0.806841 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1642  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  52.75 
 
 
566 aa  466  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0882  family 2 glycosyl transferase  49.29 
 
 
557 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0635  family 2 glycosyl transferase  53.66 
 
 
513 aa  409  1e-113  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.317 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1645  glycosyltransferase-like protein  45.66 
 
 
573 aa  387  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.514144  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0619  glycosyl transferase family 2  43.47 
 
 
551 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1648  glycosyltransferase-like protein  46.4 
 
 
538 aa  317  3e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.323978  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0883  family 2 glycosyl transferase  48.59 
 
 
524 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4583  glycosyl transferase family protein  44.35 
 
 
547 aa  292  1e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.474593  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2271  glycosyl transferase family 2  39.28 
 
 
555 aa  261  3e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.464934  normal  0.787256 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1639  glycosyltransferase  37.26 
 
 
512 aa  221  3e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  32.76 
 
 
333 aa  93.6  9e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2341  glycosyl transferase family protein  23.71 
 
 
684 aa  71.6  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4308  glycosyl transferase family 2  29.15 
 
 
641 aa  61.6  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3671  glycosyl transferase family 2  30.08 
 
 
300 aa  60.8  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.488131 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4447  glycosyl transferase family 2  32.07 
 
 
419 aa  58.9  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.133329  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2111  glycosyl transferase family 2  31.63 
 
 
236 aa  58.2  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  29.01 
 
 
1077 aa  57.8  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1571  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
342 aa  57.8  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  1.79772e-16 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.23 
 
 
327 aa  57.8  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.23 
 
 
327 aa  57.8  0.0000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  25.23 
 
 
327 aa  57.4  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2742  glycosyl transferase family 2  27.93 
 
 
267 aa  57.4  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.569397  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  25.23 
 
 
327 aa  57.4  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2740  glycosyl transferase family 2  27.6 
 
 
266 aa  56.6  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.394138  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0379  glycosyl transferase family protein  33.08 
 
 
891 aa  56.2  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.77 
 
 
327 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  24.77 
 
 
327 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3960  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.23 
 
 
327 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0389703  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
361 aa  55.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  33.01 
 
 
374 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0746  glycosyl transferase family 2  28 
 
 
352 aa  55.1  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0487138  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1816  glycosyl transferase family 2  31.37 
 
 
333 aa  54.3  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  31.28 
 
 
672 aa  54.3  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  29.32 
 
 
326 aa  54.3  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0595  glycosyl transferase family protein  33.61 
 
 
402 aa  53.9  0.000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1578  cell wall membrane glycosyltransferase  33.33 
 
 
349 aa  53.9  0.000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1836  glycosyl transferase family 2  28.93 
 
 
235 aa  53.5  0.000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.25121  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5383  glycosyl transferase family 2  29.75 
 
 
304 aa  53.5  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1040  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 
380 aa  53.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2064  glycosyl transferase family protein  27.24 
 
 
322 aa  52.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.346015  normal  0.195007 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0212  glycosyl transferase  36.54 
 
 
382 aa  52.4  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000843162  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  43.01 
 
 
477 aa  52.8  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0335  glycosyl transferase family 2  37.23 
 
 
346 aa  52.4  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0219  glycosyl transferase family protein  20.72 
 
 
247 aa  52.4  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0550  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
391 aa  52.8  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000102779  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0808  glycosyl transferase family 2  30.3 
 
 
334 aa  52.4  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000227461  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0918  glycosyl transferase family 2  41.11 
 
 
276 aa  52.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0337  glycosyl transferase family 2  36.84 
 
 
349 aa  52.4  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1618  glycosyl transferase family protein  37.36 
 
 
304 aa  51.6  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0763689  normal  0.102871 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0301  glycosyltransferase  28.62 
 
 
309 aa  51.6  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.4815  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2431  glycosyl transferase family 2  33.79 
 
 
397 aa  51.2  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  26.97 
 
 
289 aa  51.2  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26650  predicted glycosyltransferase  29.96 
 
 
474 aa  51.2  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.755615 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1586  glycosyl transferase family protein  25.21 
 
 
444 aa  51.2  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.807446  normal  0.639173 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3703  putative glycosyl transferase  41.11 
 
 
276 aa  50.8  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1078  glycosyl transferase family protein  35.34 
 
 
232 aa  50.8  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0892634  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2573  glycosyl transferase family 2  31.91 
 
 
338 aa  50.4  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  31.25 
 
 
326 aa  50.4  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  25.74 
 
 
398 aa  50.4  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  26.89 
 
 
305 aa  50.4  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  31.63 
 
 
326 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  33.68 
 
 
528 aa  50.1  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  25.91 
 
 
347 aa  50.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1420  glycosyl transferase family protein  38.95 
 
 
261 aa  49.7  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3227  glycosyl transferase family protein  37.23 
 
 
339 aa  50.1  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000210219  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10710  membrane sugar transferase  28.25 
 
 
470 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.456153 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3194  glycosyl transferase family 2  28.85 
 
 
455 aa  50.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4471  glycosyl transferase family 2  26.36 
 
 
353 aa  50.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  27.07 
 
 
328 aa  49.3  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0394  glycosyl transferase family 2  33.54 
 
 
364 aa  48.9  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2010  glycosyl transferase family protein  34.41 
 
 
305 aa  49.3  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.887395 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1186  glycosyl transferase family protein  31.43 
 
 
305 aa  49.7  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16631  glycosyl transferase family protein  27.69 
 
 
314 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.505772 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5890  glycosyl transferase family 2  35.46 
 
 
301 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1578  glycosyl transferase family 2  23.39 
 
 
336 aa  49.3  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  8.854379999999999e-20 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2746  glycosyl transferase family 2  40.66 
 
 
260 aa  49.3  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0802  glycosyl transferase family 2  38.3 
 
 
338 aa  49.3  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.865033  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  31.18 
 
 
326 aa  48.5  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  33.33 
 
 
326 aa  48.9  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0839  glycosyltransferase-like protein  26.09 
 
 
822 aa  48.1  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1256  glycosyl transferase family protein  29.02 
 
 
240 aa  48.1  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000223583  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0706  glycosyl transferase group 2 family protein  34.31 
 
 
334 aa  48.1  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.912597  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0883  glycosyl transferase family protein  27.92 
 
 
310 aa  48.1  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.178472 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1730  glycosyl transferase family protein  36.51 
 
 
420 aa  48.5  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.461107  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0155  glycosyl transferase family 2  21.43 
 
 
298 aa  48.1  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  32.35 
 
 
386 aa  48.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0119  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
232 aa  47.8  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  33.55 
 
 
422 aa  48.1  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0715  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.31 
 
 
334 aa  47.8  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.887983  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07881  glycosyl transferase family protein  26.25 
 
 
310 aa  47.8  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.111057  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1842  glycosyl transferase family 2  29.2 
 
 
884 aa  47.8  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3738  glycosyl transferase family 2  34.58 
 
 
279 aa  47.8  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.924645  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0221  glycosyl transferase family protein  33.67 
 
 
368 aa  47.8  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1381  glycosyl transferase family protein  25.28 
 
 
326 aa  47.8  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  30.48 
 
 
509 aa  47.4  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0340  glycosyl transferase family 2  28.94 
 
 
270 aa  47.4  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.167181  normal  0.387021 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  33.79 
 
 
544 aa  47.4  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1811  glycosyl transferase family 2  22.73 
 
 
280 aa  47.4  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1465  cell wall membrane glycosyltransferase  35.11 
 
 
391 aa  47.4  0.0008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>