227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1639 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1639  glycosyltransferase  100 
 
 
512 aa  1015    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2271  glycosyl transferase family 2  45.95 
 
 
555 aa  369  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.464934  normal  0.787256 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0619  glycosyl transferase family 2  35.68 
 
 
551 aa  228  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1642  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  38.05 
 
 
566 aa  228  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0882  family 2 glycosyl transferase  37.77 
 
 
557 aa  219  1e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4583  glycosyl transferase family protein  39.52 
 
 
547 aa  211  3e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.474593  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1640  hypothetical protein  38.39 
 
 
567 aa  209  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52354  normal  0.806841 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1645  glycosyltransferase-like protein  35.49 
 
 
573 aa  206  9e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.514144  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0635  family 2 glycosyl transferase  36.86 
 
 
513 aa  193  6e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.317 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0883  family 2 glycosyl transferase  38.63 
 
 
524 aa  189  7e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1648  glycosyltransferase-like protein  34.45 
 
 
538 aa  182  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.323978  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4447  glycosyl transferase family 2  31.38 
 
 
419 aa  89  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.133329  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  29.34 
 
 
333 aa  65.1  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2341  glycosyl transferase family protein  23.87 
 
 
684 aa  65.1  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0337  glycosyl transferase family 2  34.21 
 
 
349 aa  63.9  0.000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  26.98 
 
 
235 aa  63.5  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0335  glycosyl transferase family 2  34.21 
 
 
346 aa  63.5  0.000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1816  glycosyl transferase family 2  24.44 
 
 
333 aa  62.8  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0769  glycosyl transferase family 2  27.71 
 
 
352 aa  63.2  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1665  glycosyl transferase family 2  33.88 
 
 
401 aa  62.4  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10111  glycosyl transferase family protein  27.59 
 
 
310 aa  62  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0906885 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19720  predicted glycosyltransferase  28.81 
 
 
461 aa  62  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  37.78 
 
 
477 aa  60.1  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0550  glycosyl transferase family protein  31.53 
 
 
391 aa  60.1  0.00000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000102779  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26650  predicted glycosyltransferase  29.43 
 
 
474 aa  58.9  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.755615 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02586  glycosyl transferase  31.68 
 
 
292 aa  57.4  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00173399  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5657  glycosyl transferase family 2  21.55 
 
 
303 aa  56.2  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.49465 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3045  glycosyl transferase family protein  38.95 
 
 
305 aa  55.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.144194  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0487  glycosyl transferase family protein  23.63 
 
 
284 aa  55.5  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.843285 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  32.26 
 
 
333 aa  55.1  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1147  glycosyl transferase family 2  35.87 
 
 
338 aa  54.7  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.466774  hitchhiker  0.00852999 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1618  glycosyl transferase family protein  33.66 
 
 
304 aa  54.3  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0763689  normal  0.102871 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0754  glycosyl transferase family 2  29.03 
 
 
691 aa  54.3  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.235056 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0354  glycosyl transferase family 2  25.46 
 
 
331 aa  54.3  0.000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0340  glycosyl transferase family 2  24 
 
 
270 aa  53.9  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.167181  normal  0.387021 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  21.3 
 
 
337 aa  53.9  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5890  glycosyl transferase family 2  39.56 
 
 
301 aa  53.9  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1461  glycosyl transferase family 2  29.2 
 
 
239 aa  53.9  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0760  glycosyl transferase family protein  22.88 
 
 
303 aa  53.5  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0715  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.17 
 
 
334 aa  53.5  0.000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.887983  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.25 
 
 
295 aa  53.1  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2075  glycosyl transferase family protein  26.97 
 
 
303 aa  53.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00350475  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0706  glycosyl transferase group 2 family protein  30 
 
 
334 aa  52.8  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.912597  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
1035 aa  52.8  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2767  glycosyl transferase family protein  27.96 
 
 
303 aa  52.8  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2255  glycosyl transferase family 2  28.23 
 
 
305 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0243  glycosyl transferase family protein  28.89 
 
 
573 aa  52.8  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0249  glycosyl transferase family protein  28.89 
 
 
573 aa  52.8  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1842  glycosyl transferase family 2  38.74 
 
 
884 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  24.89 
 
 
328 aa  52.4  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4464  glycosyl transferase family 2  26.32 
 
 
335 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0595  glycosyl transferase family protein  26.01 
 
 
402 aa  52.4  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1428  glycosyltransferase-like protein  28.97 
 
 
323 aa  52.4  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.221347  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1299  glycosyl transferase family protein  27.01 
 
 
470 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0628268 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0167  glycosyl transferase family 2  26.18 
 
 
365 aa  52.4  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00277804  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  37.89 
 
 
320 aa  52  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2573  glycosyl transferase family 2  30.91 
 
 
338 aa  52  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2935  family 2 glycosyl transferase  25.76 
 
 
272 aa  51.6  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.231634 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3925  glycosyl transferase family 2  35.77 
 
 
379 aa  51.6  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207175  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3194  glycosyl transferase family 2  27.92 
 
 
455 aa  51.2  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1248  glycosyltransferase  29 
 
 
310 aa  51.2  0.00004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0573246  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0674  glycosyl transferase family 2  38.32 
 
 
382 aa  51.2  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00780318 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1388  glycosyl transferase family protein  29.03 
 
 
324 aa  51.6  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1221  glycosyltransferase  27.9 
 
 
310 aa  50.8  0.00005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.628351  normal  0.475099 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0883  glycosyl transferase family protein  32.74 
 
 
310 aa  50.8  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.178472 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4840  hyaluronan synthase  27.93 
 
 
478 aa  50.8  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.55692  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2211  glycosyl transferase family protein  34.74 
 
 
357 aa  50.4  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.276702  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0943  glycosyl transferase family 2  27.33 
 
 
351 aa  50.4  0.00008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.799144  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  23.29 
 
 
326 aa  50.1  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0860  b-glycosyltransferase  31.31 
 
 
314 aa  50.1  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0642732 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0793  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
390 aa  50.1  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568999  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2222  glycosyl transferase family 2  35.19 
 
 
384 aa  50.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  32.62 
 
 
386 aa  49.7  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1454  glycosyl transferase family 2  25.11 
 
 
399 aa  49.7  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.959687  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13831  hypothetical protein  25.27 
 
 
302 aa  50.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.906412  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3180  glycosyl transferase family 2  26.85 
 
 
322 aa  49.7  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.816568  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1078  glycosyl transferase family protein  31.52 
 
 
232 aa  49.7  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0892634  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6724  glycosyl transferase family protein  26.7 
 
 
316 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1880  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.89 
 
 
336 aa  48.9  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  28.89 
 
 
316 aa  49.3  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3362  glycosyl transferase family 2  27.32 
 
 
425 aa  49.3  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000110111  normal  0.0175779 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1225  family 2 glycosyl transferase  27.57 
 
 
236 aa  48.9  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0119  glycosyl transferase family protein  29.35 
 
 
232 aa  49.3  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4940  glycosyl transferase family protein  27.1 
 
 
336 aa  48.5  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0183  glycosyl transferase family protein  26.72 
 
 
395 aa  48.9  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00790444  normal  0.140907 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1040  glycosyl transferase family 2  53.66 
 
 
380 aa  48.9  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  28.7 
 
 
327 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0984  glycosyl transferase family 2  31.63 
 
 
393 aa  48.1  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00499556  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  25.96 
 
 
509 aa  48.5  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.7 
 
 
327 aa  48.5  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  28.7 
 
 
327 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2081  glycosyl transferase  27.39 
 
 
316 aa  48.5  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.797991  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2174  polysaccharide-forming b-glycosyltransferase-like protein  23.18 
 
 
376 aa  48.5  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.486335 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  28.7 
 
 
327 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3897  glycosyl transferase family 2  22.22 
 
 
501 aa  48.5  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3960  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.7 
 
 
327 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0389703  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3806  glycosyl transferase family protein  22.65 
 
 
605 aa  48.5  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.7 
 
 
327 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.7 
 
 
327 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4885  glycosyl transferase family 2  26.86 
 
 
344 aa  47.8  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0343644 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>