More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5657 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_5657  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
303 aa  627  1e-179  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.49465 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2255  glycosyl transferase family 2  26.78 
 
 
305 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1618  glycosyl transferase family protein  25.19 
 
 
304 aa  73.2  0.000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0763689  normal  0.102871 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5590  glycosyl transferase family 2  25.09 
 
 
328 aa  72.4  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.399759 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  24.55 
 
 
1486 aa  69.7  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  21.35 
 
 
337 aa  68.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  23.97 
 
 
305 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  25.19 
 
 
1152 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  25.19 
 
 
1152 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0399  glycosyl transferase family 2  23.17 
 
 
454 aa  67.4  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  25.83 
 
 
333 aa  67  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4885  glycosyl transferase family 2  21.98 
 
 
344 aa  66.6  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0343644 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1956  glycosyl transferase family 2  24.9 
 
 
310 aa  66.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179656  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3808  glycosyl transferase family 2  21.98 
 
 
344 aa  66.6  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.761497  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  25.29 
 
 
836 aa  65.9  0.0000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0518  family 2 glycosyl transferase  25.81 
 
 
754 aa  65.9  0.0000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00714685  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1274  glycosyl transferase family 2  22.46 
 
 
303 aa  65.1  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.655162  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3281  glycosyl transferase family 2  26.67 
 
 
307 aa  64.3  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3110  glycosyl transferase family 2  20.07 
 
 
325 aa  64.3  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3678  glycosyl transferase family 2  23.93 
 
 
289 aa  63.9  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.335394 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0340  glycosyl transferase family 2  24.11 
 
 
270 aa  64.3  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.167181  normal  0.387021 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1221  glycosyltransferase  23.7 
 
 
310 aa  63.5  0.000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.628351  normal  0.475099 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  23.75 
 
 
477 aa  62.8  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2949  glycosyl transferase family 2  24.28 
 
 
392 aa  63.2  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  23.51 
 
 
1106 aa  62.4  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1248  glycosyltransferase  23.1 
 
 
310 aa  61.6  0.00000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0573246  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2081  glycosyl transferase  22.88 
 
 
316 aa  62  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.797991  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2680  glycosyl transferase family protein  23.95 
 
 
426 aa  62  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0841  glycosyl transferase family 2  22.62 
 
 
337 aa  60.8  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  24.24 
 
 
1077 aa  61.2  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5040  glycosyl transferase family 2  23.11 
 
 
323 aa  60.8  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.476681  normal  0.0567661 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  22.04 
 
 
525 aa  60.5  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1794  glycosyl transferase family 2  24.26 
 
 
315 aa  60.5  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0519  glycosyl transferase family 2  23.33 
 
 
260 aa  60.1  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2811  glycosyl transferase family 2  22.26 
 
 
307 aa  59.7  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.104457 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2355  glycosyltransferase  26.36 
 
 
320 aa  59.7  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  22.13 
 
 
700 aa  59.3  0.00000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2533  glycosyl transferase family protein  25.11 
 
 
281 aa  59.3  0.00000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2889  glycosyltransferase-like  27.24 
 
 
316 aa  58.9  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0943  glycosyl transferase family 2  26.23 
 
 
351 aa  58.9  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.799144  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1200  glycosyl transferase family 2  25.11 
 
 
237 aa  58.9  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4393  glycosyl transferase family protein  23.5 
 
 
291 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.023883  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2462  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
421 aa  58.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.278728  normal  0.420923 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2063  glycosyl transferase family 2  23.9 
 
 
321 aa  58.9  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1272  glycosyl transferase family 2  23.55 
 
 
306 aa  58.9  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.294715  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08131  glycosyl transferase family protein  25.33 
 
 
303 aa  58.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3344  glycosyl transferase family protein  25.1 
 
 
274 aa  58.2  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.27907 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0760  glycosyl transferase family protein  24.08 
 
 
303 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0487  glycosyl transferase family protein  23.95 
 
 
284 aa  58.2  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.843285 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0058  glycosyl transferase family 2  33.61 
 
 
337 aa  58.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.246717 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  24.17 
 
 
994 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2408  glycosyl transferase family 2  23.83 
 
 
1334 aa  57.4  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3115  glycosyl transferase family 2  25.42 
 
 
235 aa  57.4  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  24.27 
 
 
528 aa  57  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02465  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  22.36 
 
 
309 aa  57  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.248238  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1651  glycosyl transferase family 2  24.58 
 
 
313 aa  57  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2935  family 2 glycosyl transferase  23.5 
 
 
272 aa  57  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.231634 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  23.71 
 
 
581 aa  57  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1586  glycosyl transferase family protein  21.69 
 
 
444 aa  56.6  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.807446  normal  0.639173 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0787  glycosyl transferase family 2  23.26 
 
 
353 aa  56.6  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.163096  normal  0.605145 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1529  glycosyl transferase family 2  21.56 
 
 
748 aa  56.2  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1639  glycosyltransferase  21.65 
 
 
512 aa  56.2  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3248  glycosyl transferase family 2  28.33 
 
 
323 aa  56.2  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
328 aa  56.2  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5246  glycosyl transferase family protein  20.52 
 
 
348 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0170348 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0926  glycosyl transferase family 2  23.33 
 
 
310 aa  55.8  0.0000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4384  glycosyl transferase family protein  21.48 
 
 
328 aa  55.8  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4531  family 2 glycosyl transferase  22.04 
 
 
310 aa  55.5  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  22.92 
 
 
2401 aa  55.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2064  glycosyl transferase family protein  22.92 
 
 
322 aa  55.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.346015  normal  0.195007 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4247  glycosyl transferase family 2  23.21 
 
 
312 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1552  glycosyl transferase family 2  20.96 
 
 
299 aa  55.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1299  glycosyl transferase family protein  23.65 
 
 
470 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0628268 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0156  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
310 aa  54.3  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3149  glycosyl transferase family protein  20.52 
 
 
753 aa  54.3  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1198  glycosyl transferase family protein  32.11 
 
 
318 aa  54.3  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4142  glycosyl transferase family 2  26.86 
 
 
313 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000221538 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0907  glycosyl transferase family protein  21.88 
 
 
415 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00249013  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1427  glycosyl transferase, group 2 family protein  22.61 
 
 
338 aa  54.3  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3045  glycosyl transferase family protein  29.05 
 
 
305 aa  53.9  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.144194  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0011  glycosyl transferase family 2  28.69 
 
 
291 aa  53.9  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000912491 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3457  b-glycosyltransferase  23.48 
 
 
302 aa  53.9  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0284988 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3433  glycosyl transferase family protein  24.9 
 
 
309 aa  54.3  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.503328 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3930  glycosyl transferase family 2  26.75 
 
 
413 aa  54.3  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.555455  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1147  glycosyl transferase family 2  23.14 
 
 
338 aa  53.9  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.466774  hitchhiker  0.00852999 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  23.21 
 
 
746 aa  54.3  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4887  family 2 glycosyl transferase  21.12 
 
 
312 aa  53.5  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  23.24 
 
 
703 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4626  glycosyl transferase family 2  24.69 
 
 
742 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.18553  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10710  membrane sugar transferase  23.73 
 
 
470 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.456153 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0300  glycosyl transferase family protein  21.31 
 
 
322 aa  53.1  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0721  glycosyl transferase family 2  32.14 
 
 
297 aa  53.1  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.315795  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  22.36 
 
 
1067 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  22.22 
 
 
340 aa  53.1  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3254  glycosyl transferase, group 2 family protein  21.12 
 
 
314 aa  52.8  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.106646  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2370  glycosyltransferase  24.32 
 
 
319 aa  52.8  0.000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0636  family 2 glycosyl transferase  28.32 
 
 
785 aa  52.8  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.678698 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1097  glycosyl transferase family protein  21.36 
 
 
326 aa  51.6  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000713189  normal  0.938252 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08321  glycosyl transferase family protein  23.59 
 
 
305 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.389273  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16631  glycosyl transferase family protein  21.77 
 
 
314 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.505772 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>