More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2075 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2075  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 303 aa  599  1e-170  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00350475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  32.54 
 
 		 333 aa  91.3  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1813  glycosyl transferase family 2  28.02 
 
 		 272 aa  90.1  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0746  glycosyl transferase family 2  28.27 
 
 		 352 aa  87.8  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0487138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1571  glycosyl transferase family 2  25.72 
 
 		 342 aa  85.9  8e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.79772e-16 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  36.15 
 
 		 305 aa  79.7  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3392  glycosyl transferase, family 2  26.15 
 
 		 303 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0282022  hitchhiker  0.0000000856485 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0478  glycosyl transferase family 2  26.64 
 
 		 335 aa  70.9  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677803  normal  0.931373 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2255  glycosyl transferase family 2  34.75 
 
 		 305 aa  69.7  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1510  glycosyl transferase, group 2 family protein  38 
 
 		 310 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.932376  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0379  glycosyl transferase family protein  29.06 
 
 		 891 aa  66.6  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1880  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.32 
 
 		 336 aa  65.9  0.0000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3671  glycosyl transferase family 2  36.84 
 
 		 300 aa  65.9  0.0000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.488131 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3194  glycosyl transferase family 2  29.32 
 
 		 455 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  34.69 
 
 		 428 aa  65.1  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2341  glycosyl transferase family protein  25.77 
 
 		 684 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1639  glycosyltransferase  26.32 
 
 		 512 aa  64.3  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2010  glycosyl transferase family protein  38 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.887395 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0340  glycosyl transferase family 2  42 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.167181  normal  0.387021 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2935  family 2 glycosyl transferase  31.95 
 
 		 272 aa  62.8  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.231634 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1842  glycosyl transferase family 2  26.61 
 
 		 884 aa  62.4  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08131  glycosyl transferase family protein  22.71 
 
 		 303 aa  62.4  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4195  glycosyl transferase family 2  26.46 
 
 		 345 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.859941 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2763  glycosyl transferase family protein  35.25 
 
 		 324 aa  61.2  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.32347  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4143  glycosyl transferase family protein  37.72 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.89997 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08121  glycosyl transferase family protein  23.11 
 
 		 303 aa  60.8  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  38.53 
 
 		 477 aa  60.1  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0760  glycosyl transferase family protein  22.22 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4583  glycosyl transferase family protein  28.72 
 
 		 547 aa  60.1  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.474593  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2934  family 2 glycosyl transferase  38.32 
 
 		 295 aa  59.7  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.349608 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1840  glycosyl transferase family 2  35.09 
 
 		 710 aa  59.7  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0202284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0487  glycosyl transferase family protein  24.23 
 
 		 284 aa  58.5  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.843285 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4885  glycosyl transferase family 2  26.07 
 
 		 344 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0343644 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2811  glycosyl transferase family 2  23.81 
 
 		 307 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.104457 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3808  glycosyl transferase family 2  26.07 
 
 		 344 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.761497  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0619  glycosyl transferase family 2  26.94 
 
 		 551 aa  58.9  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3495  glycosyl transferase family 2  36.54 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1221  glycosyltransferase  25.98 
 
 		 310 aa  58.2  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.628351  normal  0.475099 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1791  b-glycosyltransferase  31.63 
 
 		 344 aa  58.2  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.780002 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  33.9 
 
 		 361 aa  57.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05340  Glycosyl transferase, family 2  33.91 
 
 		 321 aa  57  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000520172  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2225  glycosyl transferase family 2  34.17 
 
 		 717 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.432582 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3457  b-glycosyltransferase  22.9 
 
 		 302 aa  57  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0284988 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  30.48 
 
 		 398 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  31.15 
 
 		 289 aa  57  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1949  glycosyl transferase family protein  32.43 
 
 		 717 aa  57  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0907  glycosyl transferase family protein  27.38 
 
 		 415 aa  57  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00249013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1147  glycosyl transferase family 2  33.61 
 
 		 338 aa  56.6  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.466774  hitchhiker  0.00852999 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2580  glycosyl transferase family 2  22.78 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000593359  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2704  glycosyl transferase family 2  36.61 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00294002 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3305  glycosyl transferase family protein  35.64 
 
 		 342 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.240811 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02586  glycosyl transferase  37.25 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00173399  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1274  glycosyl transferase family 2  24.44 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.655162  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2574  N-glycosyltransferase  38.68 
 
 		 412 aa  56.2  0.0000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0472996 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2111  glycosyl transferase family 2  39.6 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1264  N-glycosyltransferase  38.68 
 
 		 412 aa  56.2  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.498109 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  25.93 
 
 		 1644 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  25.93 
 
 		 1644 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  30.19 
 
 		 327 aa  55.8  0.0000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2807  putative glycosyl transferase  29.56 
 
 		 332 aa  55.8  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0445722 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.19 
 
 		 327 aa  55.8  0.0000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1186  glycosyl transferase family protein  34.69 
 
 		 305 aa  55.8  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.19 
 
 		 327 aa  55.8  0.0000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  30.19 
 
 		 327 aa  55.8  0.0000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01024  predicted glycosyl transferase  38.68 
 
 		 441 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2621  glycosyl transferase family 2  38.68 
 
 		 441 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.252252  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01031  hypothetical protein  38.68 
 
 		 441 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0118  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.67 
 
 		 351 aa  55.1  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000526958 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0655  glycosyl transferase  36.96 
 
 		 346 aa  55.5  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0670645  normal  0.883616 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4035  glycosyl transferase family protein  36.79 
 
 		 344 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1193  glycosyl transferase family 2  33.63 
 
 		 871 aa  55.8  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0365546 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3791  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  31.45 
 
 		 317 aa  55.5  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  31.19 
 
 		 374 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1142  N-glycosyltransferase  38.68 
 
 		 441 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0608  glycosyl transferase family protein  24.31 
 
 		 262 aa  55.5  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3223  glycosyl transferase family protein  36.08 
 
 		 729 aa  55.8  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1645  glycosyl transferase family 2  35.59 
 
 		 253 aa  55.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1137  N-glycosyltransferase  38.68 
 
 		 441 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0308707  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0636  family 2 glycosyl transferase  38.46 
 
 		 785 aa  55.5  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.678698 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3463  glycosyl transferase family protein  25.2 
 
 		 332 aa  55.1  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0230104  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4524  glycosyl transferase family protein  26.6 
 
 		 308 aa  54.7  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500037  normal  0.110607 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2004  glycosyl transferase family 2  27.72 
 
 		 280 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3169  glycosyl transferase family 2  37.62 
 
 		 344 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  30.1 
 
 		 327 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1994  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 383 aa  54.7  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.713499 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.1 
 
 		 327 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  26.46 
 
 		 525 aa  55.1  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3336  glycosyl transferase family protein  34.23 
 
 		 1268 aa  54.7  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2999  glycosyl transferase family 2  24.81 
 
 		 988 aa  54.3  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1697  glycosyl transferase family 2  35.9 
 
 		 366 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.696391  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3224  glycosyl transferase family 2  33.64 
 
 		 367 aa  54.3  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.210562  normal  0.0177543 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1213  glycosyl transferase family protein  26.24 
 
 		 683 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1247  glycosyl transferase family 2  23.41 
 
 		 259 aa  54.3  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30120  Glycosyl transferase, family 2 protein  33.64 
 
 		 328 aa  54.3  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  26.67 
 
 		 333 aa  53.9  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1441  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  29.13 
 
 		 322 aa  53.9  0.000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.692478  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0518  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 341 aa  53.9  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  29.63 
 
 		 326 aa  53.5  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 340 aa  53.5  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  30.48 
 
 		 1250 aa  53.5  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>