122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3451 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3451  hypothetical protein  100 
 
 		 300 aa  599  1e-170  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3517  hypothetical protein  92.67 
 
 		 337 aa  532  1e-150  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000347699 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3835  hypothetical protein  58.53 
 
 		 334 aa  366  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0621  hypothetical protein  57.53 
 
 		 321 aa  333  1e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0768751  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2894  hypothetical protein  57.48 
 
 		 316 aa  314  9.999999999999999e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0314909 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2586  hypothetical protein  50.83 
 
 		 317 aa  262  4.999999999999999e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2755  hypothetical protein  54.2 
 
 		 313 aa  262  4.999999999999999e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00513543  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0697  glycosyl transferase family 2  30.11 
 
 		 331 aa  145  1e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.561487  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  27.56 
 
 		 477 aa  98.2  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1878  glycosyl transferase family 2  25.51 
 
 		 597 aa  87  3e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  26.47 
 
 		 337 aa  84  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3183  glycosyl transferase family 2  28.68 
 
 		 358 aa  79.7  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000292304  decreased coverage  0.0000016442 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  29.89 
 
 		 924 aa  79  0.00000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0508  glycosyl transferase family protein  29.09 
 
 		 351 aa  72.8  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.239818  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1880  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.9 
 
 		 336 aa  71.2  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3875  glycosyl transferase family 2  28.85 
 
 		 331 aa  71.2  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1349  glycosyltransferase  28.12 
 
 		 343 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.589568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3180  glycosyl transferase family 2  26.79 
 
 		 322 aa  67  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.816568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4523  glycosyl transferase family protein  32.07 
 
 		 336 aa  66.2  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2541  putative glycosyl transferase  27.73 
 
 		 341 aa  65.5  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1791  b-glycosyltransferase  23.29 
 
 		 344 aa  65.1  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.780002 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  23.96 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  22.43 
 
 		 528 aa  64.7  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0211  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 		 623 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4113  glycosyl transferase family 2  27.04 
 
 		 343 aa  64.3  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.902695  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2011  glycosyl transferase family 2  25.77 
 
 		 335 aa  63.5  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.814426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1818  glycosyl transferase family protein  27.11 
 
 		 335 aa  63.5  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1661  glycosyl transferase family protein  23.97 
 
 		 316 aa  63.5  0.000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05860  glycosyl transferase  25.79 
 
 		 351 aa  62.8  0.000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000181902 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0718  family 2 glycosyl transferase  27.13 
 
 		 352 aa  62.4  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00805458 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  26.38 
 
 		 333 aa  60.8  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2191  glycosyl transferase family 2  30.85 
 
 		 331 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2253  glycosyl transferase family 2  30.85 
 
 		 331 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.628199  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2111  glycosyl transferase family 2  32.9 
 
 		 236 aa  58.5  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3195  glycosyl transferase family 2  27.47 
 
 		 394 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1147  glycosyl transferase family 2  25.57 
 
 		 338 aa  58.9  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.466774  hitchhiker  0.00852999 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1366  glycosyl transferase family protein  33.12 
 
 		 331 aa  58.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.959052  normal  0.0372616 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0228  glycosyl transferase family protein  21.88 
 
 		 333 aa  57.8  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000082788  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2856  family 2 glycosyl transferase  30.13 
 
 		 326 aa  57.4  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08480  glycosyl transferase  26.48 
 
 		 324 aa  57.4  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.525807 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0722  succinoglycan biosynthesis protein ExoA  26.83 
 
 		 353 aa  56.6  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0466  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 		 302 aa  55.8  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0600433  unclonable  0.0000113237 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1029  glycosyl transferase family protein  28.81 
 
 		 360 aa  56.2  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0540  glycosyl transferase family 2  32.24 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5927  succinoglycan biosynthesis protein  25.49 
 
 		 341 aa  55.8  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0838  glycosyl transferase family 2  24.51 
 
 		 368 aa  55.8  0.0000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.341692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3463  glycosyl transferase family protein  24.24 
 
 		 332 aa  54.3  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0230104  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4957  glycosyl transferase family protein  24.28 
 
 		 330 aa  54.7  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.083679 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3149  glycosyl transferase family protein  30.67 
 
 		 753 aa  54.3  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0136  glycosyl transferase family protein  25.65 
 
 		 311 aa  53.5  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0443669  normal  0.762685 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4805  glycosyl transferase family protein  30.04 
 
 		 339 aa  53.1  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1038  glycosyl transferase family protein  25.35 
 
 		 355 aa  52.8  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.378242  normal  0.03094 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0851  glycosyl transferase family protein  32.41 
 
 		 1152 aa  52.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1299  glycosyl transferase family protein  27.07 
 
 		 470 aa  52.4  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0628268 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7649  glycosyl transferase family 2  25.79 
 
 		 352 aa  52.4  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1097  glycosyl transferase family protein  30.67 
 
 		 326 aa  52  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000713189  normal  0.938252 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0839  glycosyltransferase-like protein  26.81 
 
 		 822 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1580  glycosyl transferase family protein  30.36 
 
 		 598 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.47169 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2462  glycosyl transferase family 2  22.01 
 
 		 421 aa  51.2  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.278728  normal  0.420923 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1063  glycosyl transferase family 2  28.07 
 
 		 307 aa  51.2  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.991977 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  28.78 
 
 		 748 aa  51.2  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2675  family 2 glycosyl transferase  30.51 
 
 		 315 aa  51.2  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.384822 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0434  glycosyl transferase family 2  30.17 
 
 		 460 aa  50.8  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4699  glycosyl transferase family 2  24.19 
 
 		 308 aa  50.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.252181  normal  0.0261338 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0354  glycosyl transferase family 2  21.48 
 
 		 331 aa  50.8  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2969  glycosyl transferase family 2  28.49 
 
 		 327 aa  50.1  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0913  glycosyl transferase, group 2 family protein  21.32 
 
 		 341 aa  49.7  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000688111  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  27.45 
 
 		 328 aa  49.7  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1776  glycosyl transferase family 2  24.85 
 
 		 311 aa  49.3  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2877  glycosyl transferase family 2  28.18 
 
 		 327 aa  49.3  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.257964  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0203  glycosyl transferase, group 2 family protein  22.56 
 
 		 331 aa  48.5  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.97495  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0657  glycosyl transferase family protein  24.6 
 
 		 331 aa  48.9  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3392  glycosyl transferase family protein  24 
 
 		 287 aa  48.5  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2677  glycosyl transferase family protein  26.67 
 
 		 1267 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4622  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 355 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0686248 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1850  glycosyl transferase family 2  24.12 
 
 		 362 aa  48.5  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  25.93 
 
 		 461 aa  47.8  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5057  glycosyl transferase family protein  26.29 
 
 		 470 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0519  glycosyl transferase family 2  23.6 
 
 		 260 aa  47.8  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_191  group 2 glycosyl transferase  22.51 
 
 		 322 aa  47.4  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.941219  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4093  glycosyl transferase family 2  26.63 
 
 		 296 aa  47.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.206516  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0428  glycosyl transferase family 2  26.32 
 
 		 438 aa  47.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7656  glycosyl transferase family 2  24.73 
 
 		 313 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3588  glycosyl transferase family 2  39.39 
 
 		 337 aa  47.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.690536  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2471  glycosyl transferase family 2  24.26 
 
 		 311 aa  47  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1427  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.26 
 
 		 338 aa  46.6  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1959  glycosyl transferase family protein  29.19 
 
 		 329 aa  46.6  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.465626 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1781  glycosyl transferase family 2  27.72 
 
 		 326 aa  46.6  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.456914  normal  0.601286 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0604  putative glycosyl transferase  26.19 
 
 		 340 aa  46.2  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.781878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1274  glycosyl transferase family 2  23.23 
 
 		 303 aa  46.6  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.655162  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1794  glycosyl transferase family 2  21.72 
 
 		 315 aa  46.2  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09478  putative glycosyltransferase  22.42 
 
 		 309 aa  46.2  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.544273  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  29.08 
 
 		 703 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0399  glycosyl transferase family 2  27.64 
 
 		 454 aa  46.2  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3324  glycosyl transferase family protein  23.36 
 
 		 487 aa  45.8  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.624929 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3998  glycosyl transferase family protein  27.45 
 
 		 310 aa  45.8  0.0009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.756459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2849  glycosyl transferase family protein  29.53 
 
 		 824 aa  45.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0926  glycosyl transferase family 2  26.67 
 
 		 310 aa  45.4  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4280  hypothetical protein  30 
 
 		 1171 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  28.66 
 
 		 746 aa  45.4  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>