128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3517 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_3517  hypothetical protein  100 
 
 
337 aa  674    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000347699 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3451  hypothetical protein  92.67 
 
 
300 aa  531  1e-150  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3835  hypothetical protein  60.44 
 
 
334 aa  392  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0621  hypothetical protein  57.79 
 
 
321 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0768751  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2894  hypothetical protein  56.42 
 
 
316 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0314909 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2586  hypothetical protein  51.55 
 
 
317 aa  288  1e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2755  hypothetical protein  50.96 
 
 
313 aa  272  5.000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00513543  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0697  glycosyl transferase family 2  29.93 
 
 
331 aa  150  2e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.561487  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  29.2 
 
 
477 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1878  glycosyl transferase family 2  25.51 
 
 
597 aa  86.3  6e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  26.71 
 
 
337 aa  84.3  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  24.89 
 
 
528 aa  82  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3183  glycosyl transferase family 2  26.57 
 
 
358 aa  81.3  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000292304  decreased coverage  0.0000016442 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  29.14 
 
 
924 aa  77.4  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1349  glycosyltransferase  28.52 
 
 
343 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.589568  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0508  glycosyl transferase family protein  29.09 
 
 
351 aa  72.8  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.239818  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2011  glycosyl transferase family 2  26.3 
 
 
335 aa  72  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.814426  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1880  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.9 
 
 
336 aa  70.9  0.00000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3875  glycosyl transferase family 2  28.85 
 
 
331 aa  70.1  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  24.72 
 
 
305 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0718  family 2 glycosyl transferase  27.99 
 
 
352 aa  67.8  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00805458 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4113  glycosyl transferase family 2  27.24 
 
 
343 aa  66.6  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.902695  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0211  glycosyl transferase family protein  28.79 
 
 
623 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3180  glycosyl transferase family 2  23.03 
 
 
322 aa  66.2  0.0000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.816568  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1791  b-glycosyltransferase  24.12 
 
 
344 aa  65.1  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.780002 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2191  glycosyl transferase family 2  30.35 
 
 
331 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2253  glycosyl transferase family 2  30.35 
 
 
331 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.628199  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4523  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
336 aa  64.7  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131272  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05860  glycosyl transferase  25.29 
 
 
351 aa  64.7  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000181902 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2541  putative glycosyl transferase  27.06 
 
 
341 aa  63.2  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1029  glycosyl transferase family protein  28.18 
 
 
360 aa  63.2  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1661  glycosyl transferase family protein  22.39 
 
 
316 aa  62.4  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  26.32 
 
 
333 aa  62  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0228  glycosyl transferase family protein  21.79 
 
 
333 aa  61.6  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000082788  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1818  glycosyl transferase family protein  25.7 
 
 
335 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1366  glycosyl transferase family protein  33.95 
 
 
331 aa  60.1  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.959052  normal  0.0372616 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7649  glycosyl transferase family 2  25.82 
 
 
352 aa  59.7  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2111  glycosyl transferase family 2  32.1 
 
 
236 aa  59.3  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2856  family 2 glycosyl transferase  29.03 
 
 
326 aa  58.5  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4805  glycosyl transferase family protein  27.8 
 
 
339 aa  58.2  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0540  glycosyl transferase family 2  32.89 
 
 
310 aa  58.5  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3195  glycosyl transferase family 2  25.31 
 
 
394 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08480  glycosyl transferase  25.69 
 
 
324 aa  57.8  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.525807 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0722  succinoglycan biosynthesis protein ExoA  26.13 
 
 
353 aa  56.6  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1299  glycosyl transferase family protein  27.07 
 
 
470 aa  56.2  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0628268 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1147  glycosyl transferase family 2  24.34 
 
 
338 aa  56.2  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.466774  hitchhiker  0.00852999 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0466  glycosyl transferase family protein  27.92 
 
 
302 aa  56.2  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0600433  unclonable  0.0000113237 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2255  glycosyl transferase family 2  23.48 
 
 
305 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3149  glycosyl transferase family protein  27.69 
 
 
753 aa  55.1  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3463  glycosyl transferase family protein  23.48 
 
 
332 aa  55.1  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0230104  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4957  glycosyl transferase family protein  24.64 
 
 
330 aa  54.7  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.083679 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1776  glycosyl transferase family 2  24.68 
 
 
311 aa  54.7  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0354  glycosyl transferase family 2  21.77 
 
 
331 aa  55.1  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0913  glycosyl transferase, group 2 family protein  21.26 
 
 
341 aa  53.9  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000688111  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2969  glycosyl transferase family 2  29.28 
 
 
327 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0839  glycosyltransferase-like protein  24.49 
 
 
822 aa  53.9  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0851  glycosyl transferase family protein  33.11 
 
 
1152 aa  53.9  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4464  glycosyl transferase family 2  27.8 
 
 
335 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5927  succinoglycan biosynthesis protein  25.49 
 
 
341 aa  53.9  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2877  glycosyl transferase family 2  29.28 
 
 
327 aa  53.1  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.257964  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  24.52 
 
 
328 aa  53.1  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2471  glycosyl transferase family 2  24.15 
 
 
311 aa  53.1  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0838  glycosyl transferase family 2  24.42 
 
 
368 aa  52.8  0.000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.341692  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1038  glycosyl transferase family protein  25.96 
 
 
355 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.378242  normal  0.03094 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1959  glycosyl transferase family protein  26.97 
 
 
329 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.465626 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  29.29 
 
 
748 aa  51.6  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4699  glycosyl transferase family 2  24.19 
 
 
308 aa  51.6  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.252181  normal  0.0261338 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5057  glycosyl transferase family protein  25.68 
 
 
470 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2462  glycosyl transferase family 2  22.03 
 
 
421 aa  50.8  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.278728  normal  0.420923 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0604  putative glycosyl transferase  27.24 
 
 
340 aa  50.1  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.781878  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4622  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
355 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0686248 
 
 
-
 
NC_002936  DET0203  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.08 
 
 
331 aa  50.1  0.00006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.97495  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1063  glycosyl transferase family 2  27.65 
 
 
307 aa  49.7  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.991977 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0657  glycosyl transferase family protein  25.91 
 
 
331 aa  49.3  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1274  glycosyl transferase family 2  28.34 
 
 
303 aa  49.7  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.655162  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3588  glycosyl transferase family 2  42.59 
 
 
337 aa  49.3  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.690536  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_191  group 2 glycosyl transferase  23.04 
 
 
322 aa  48.9  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.941219  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1580  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
598 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.47169 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1097  glycosyl transferase family protein  26.34 
 
 
326 aa  48.9  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000713189  normal  0.938252 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0518  family 2 glycosyl transferase  27.27 
 
 
754 aa  48.9  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00714685  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0043  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  21.13 
 
 
282 aa  48.9  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0434  glycosyl transferase family 2  29.05 
 
 
460 aa  48.1  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2675  family 2 glycosyl transferase  29.94 
 
 
315 aa  48.5  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.384822 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4093  glycosyl transferase family 2  25.25 
 
 
296 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.206516  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3324  glycosyl transferase family protein  22.26 
 
 
487 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.624929 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2341  glycosyl transferase family protein  27.74 
 
 
236 aa  47  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3998  glycosyl transferase family protein  26.16 
 
 
310 aa  47  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.756459  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  26.88 
 
 
403 aa  46.6  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10710  membrane sugar transferase  25 
 
 
470 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.456153 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0137  glycosyl transferase family protein  27.38 
 
 
296 aa  46.6  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.145337  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0136  glycosyl transferase family protein  23.81 
 
 
311 aa  46.6  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0443669  normal  0.762685 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1794  glycosyl transferase family 2  22.89 
 
 
315 aa  46.6  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  27.08 
 
 
1077 aa  46.6  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2949  glycosyl transferase family 2  25.38 
 
 
392 aa  46.6  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4195  glycosyl transferase family 2  26.77 
 
 
345 aa  46.6  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.859941 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7656  glycosyl transferase family 2  24.73 
 
 
313 aa  46.2  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4928  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
513 aa  45.8  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3671  glycosyl transferase family 2  34.15 
 
 
300 aa  45.4  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.488131 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3720  glycosyl transferase family protein  30.61 
 
 
1193 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  25.94 
 
 
703 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>