220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2718 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2718  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 325 aa  654    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.543733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2577  glycosyl transferase family protein  94.77 
 
 		 325 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3137  glycosyl transferase, group 2 family protein  94.46 
 
 		 325 aa  596  1e-169  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46761  normal  0.406504 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2908  glycosyl transferase family protein  78.15 
 
 		 325 aa  501  1e-141  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.928359 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5290  glycosyl transferase family 2  57.1 
 
 		 334 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1005  putative glycosyl transferase, group 2 family protein  60.25 
 
 		 328 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.626376 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2397  glycosyl transferase family protein  61.06 
 
 		 332 aa  359  4e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4255  glycosyl transferase family protein  59.19 
 
 		 330 aa  352  4e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2550  glycosyl transferase family 2  48.63 
 
 		 340 aa  305  7e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.324951 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3565  glycosyl transferase family 2  48.63 
 
 		 340 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0316  glycosyl transferase family protein  45.23 
 
 		 320 aa  264  1e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.982236 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2373  glycosyl transferase family protein  42.22 
 
 		 329 aa  200  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.20536  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1427  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.08 
 
 		 338 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2877  glycosyl transferase family 2  39.33 
 
 		 327 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.257964  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2969  glycosyl transferase family 2  35.58 
 
 		 327 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1850  glycosyl transferase family 2  31.74 
 
 		 362 aa  151  1e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1703  glycosyl transferase family 2  38.01 
 
 		 353 aa  146  5e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1813  glycosyl transferase family protein  35.38 
 
 		 362 aa  142  8e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1376  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.09 
 
 		 369 aa  137  2e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.866808 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2046  glycosyl transferase family 2  32.23 
 
 		 341 aa  79.7  0.00000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0484  glycosyl transferase family 2  30.26 
 
 		 314 aa  71.2  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0383  glycosyl transferase family protein  25.27 
 
 		 331 aa  70.5  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2880  glycosyl transferase family protein  26.04 
 
 		 331 aa  67.4  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.764984  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  27.71 
 
 		 924 aa  66.6  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4359  glycosyl transferase family protein  26.92 
 
 		 332 aa  66.6  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.947946 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0149  glycosyl transferase family 2  27.3 
 
 		 357 aa  63.5  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.473763 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3178  glycosyl transferase family protein  26.06 
 
 		 329 aa  62.4  0.000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0452  putative glycosyl transferase  23.46 
 
 		 332 aa  62.4  0.000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2471  glycosyl transferase family 2  26.81 
 
 		 311 aa  62.4  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1776  glycosyl transferase family 2  26.38 
 
 		 311 aa  60.5  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  27.13 
 
 		 317 aa  60.5  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0792  glycosyl transferase family protein  28.88 
 
 		 376 aa  59.3  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.77414 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  28.12 
 
 		 477 aa  57.4  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1225  family 2 glycosyl transferase  27.45 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1794  glycosyl transferase family 2  25.11 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  23.36 
 
 		 337 aa  55.8  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0487  glycosyl transferase family protein  24.25 
 
 		 284 aa  55.8  0.0000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.843285 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3594  glycosyl transferase family 2  26.95 
 
 		 290 aa  55.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0820  glycosyl transferase family protein  25.23 
 
 		 308 aa  55.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1887  glycosyl transferase family protein  26.34 
 
 		 360 aa  54.7  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.95114  normal  0.84589 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1385  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 377 aa  55.1  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4195  glycosyl transferase family 2  27.86 
 
 		 345 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.859941 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0353  glycosyl transferase family 2  21.71 
 
 		 312 aa  53.9  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000439981  normal  0.42611 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11310  predicted glycosyltransferase  31.08 
 
 		 296 aa  53.9  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.410703  normal  0.289206 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3554  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 329 aa  53.5  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.200701  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0074  glycosyl transferase family protein  32.2 
 
 		 252 aa  53.5  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.221966 
 
 
-
 
NC_003296  RS00815  hypothetical protein  36.28 
 
 		 362 aa  53.1  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.491334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  27.73 
 
 		 1340 aa  53.5  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4393  glycosyl transferase family protein  30.26 
 
 		 291 aa  53.1  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.023883  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  25.53 
 
 		 328 aa  53.1  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0300  glycosyl transferase family protein  24.11 
 
 		 322 aa  52.8  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1651  glycosyl transferase family 2  25.97 
 
 		 313 aa  52.8  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0248  glycosyl transferase family 2  26.34 
 
 		 348 aa  52.4  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.617572 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6387  glycosyl transferase family 2  22.75 
 
 		 340 aa  52.4  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0741751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00046  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  29.41 
 
 		 255 aa  52.8  0.000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1836  glycosyl transferase family 2  28.93 
 
 		 235 aa  52  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.25121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2052  glycosyl transferase family protein  30.83 
 
 		 255 aa  52  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3181  glycosyl transferase family 2  29.74 
 
 		 345 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.255598  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2190  glycosyl transferase family 2  28.02 
 
 		 450 aa  51.6  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  28.64 
 
 		 268 aa  51.2  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3501  glycosyl transferase family 2  28.81 
 
 		 310 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.222757  normal  0.064344 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3595  glycosyl transferase family 2  31.39 
 
 		 331 aa  51.2  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2111  glycosyl transferase family 2  31.96 
 
 		 236 aa  50.8  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0402  glycosyl transferase family 2  22.44 
 
 		 359 aa  51.2  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.20489 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4803  alpha-1,6-rhamnosyltransferase MigA  27.75 
 
 		 300 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  24.89 
 
 		 311 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0588  glycosyl transferase family 2  23.48 
 
 		 255 aa  50.4  0.00004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00392203  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4160  glycosyl transferase family 2  25.74 
 
 		 289 aa  50.4  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0085  glycosyl transferase family 2  26.56 
 
 		 308 aa  50.1  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0285695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  23 
 
 		 528 aa  50.1  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1409  glycosyl transferase family protein  37.31 
 
 		 585 aa  50.1  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0082  O antigen biosynthesis rhamnosyltransferase, putative  26.56 
 
 		 308 aa  50.1  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.19572  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5890  glycosyl transferase family 2  29.12 
 
 		 301 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5418  glycosyl transferase family protein  23.33 
 
 		 363 aa  49.7  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348353  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4382  glycosyl transferase family 2  28.42 
 
 		 258 aa  49.7  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0715238  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4286  glycosyl transferase family protein  26.16 
 
 		 303 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.131233 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1372  glycosyl transferase family protein  28.79 
 
 		 633 aa  49.7  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.371979  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2305  glycosyl transferase family 2  24.28 
 
 		 291 aa  49.3  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.064621 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  26.16 
 
 		 283 aa  49.3  0.00009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0252  glycosyl transferase family 2  39.22 
 
 		 308 aa  49.3  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3256  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.93 
 
 		 219 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0789044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  24.78 
 
 		 305 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2138  glycosyl transferase family protein  26.03 
 
 		 308 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.177505  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2078  glycosyl transferase family protein  43.4 
 
 		 255 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149982  normal  0.0473511 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0657  glycosyl transferase family 2  27.23 
 
 		 307 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1099  hypothetical protein  22.32 
 
 		 336 aa  49.3  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.299802 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55180  glycosyl transferase  25.6 
 
 		 299 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.678126  hitchhiker  0.00000000000937683 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0590  glycosyl transferase family 2  27.05 
 
 		 329 aa  48.9  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1401  glycosyl transferase family protein  35.82 
 
 		 798 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11300  predicted glycosyltransferase  26.15 
 
 		 264 aa  48.5  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.438529  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0256  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 279 aa  47.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2354  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.45 
 
 		 308 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.218636  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0177  putative glycosyl transferase  35.96 
 
 		 268 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4093  glycosyl transferase family 2  35.21 
 
 		 257 aa  48.5  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3336  glycosyl transferase family protein  36.92 
 
 		 1268 aa  48.5  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0380  glycosyl transferase family protein  30.16 
 
 		 538 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.885586 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1566  glycosyl transferase family protein  32.77 
 
 		 333 aa  48.1  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0681  glycosyl transferase family 2  35.29 
 
 		 254 aa  48.1  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3892  glycosyl transferase family protein  38.89 
 
 		 255 aa  48.5  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2505  glycosyl transferase family protein  28.43 
 
 		 219 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>