225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2373 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_2373  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
329 aa  631  1e-180  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.20536  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2908  glycosyl transferase family protein  44.2 
 
 
325 aa  229  4e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.928359 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0316  glycosyl transferase family protein  43.12 
 
 
320 aa  226  3e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.982236 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3137  glycosyl transferase, group 2 family protein  42.14 
 
 
325 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46761  normal  0.406504 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2577  glycosyl transferase family protein  43.3 
 
 
325 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5290  glycosyl transferase family 2  36.2 
 
 
334 aa  212  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2718  glycosyl transferase family protein  42.59 
 
 
325 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.543733  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4255  glycosyl transferase family protein  39.75 
 
 
330 aa  201  9.999999999999999e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1005  putative glycosyl transferase, group 2 family protein  43.03 
 
 
328 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.626376 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2397  glycosyl transferase family protein  40.81 
 
 
332 aa  191  1e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2550  glycosyl transferase family 2  38.98 
 
 
340 aa  179  7e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.324951 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3565  glycosyl transferase family 2  38.19 
 
 
340 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1427  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.53 
 
 
338 aa  154  1e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2877  glycosyl transferase family 2  41.26 
 
 
327 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.257964  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2969  glycosyl transferase family 2  41.7 
 
 
327 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1850  glycosyl transferase family 2  32.55 
 
 
362 aa  143  5e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1813  glycosyl transferase family protein  33.91 
 
 
362 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1703  glycosyl transferase family 2  37.5 
 
 
353 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1376  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.06 
 
 
369 aa  132  6e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.866808 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0149  glycosyl transferase family 2  27.62 
 
 
357 aa  74.7  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.473763 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  25.58 
 
 
320 aa  68.9  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2046  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 
341 aa  68.2  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  22.87 
 
 
337 aa  65.5  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  29.28 
 
 
299 aa  62.8  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  23.48 
 
 
528 aa  60.5  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  28.17 
 
 
337 aa  59.3  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  25.56 
 
 
924 aa  58.2  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  27.91 
 
 
318 aa  58.2  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0383  glycosyl transferase family protein  23.58 
 
 
331 aa  58.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4393  glycosyl transferase family protein  29.29 
 
 
291 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.023883  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2933  family 2 glycosyl transferase  30.08 
 
 
284 aa  57  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.593138  normal  0.360179 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0338  glycosyl transferase family 2  29.96 
 
 
288 aa  55.8  0.0000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.378739 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4160  glycosyl transferase family 2  29.21 
 
 
289 aa  55.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11300  predicted glycosyltransferase  31.28 
 
 
264 aa  55.1  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.438529  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  28.02 
 
 
477 aa  54.7  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1225  family 2 glycosyl transferase  29.47 
 
 
236 aa  54.3  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11310  predicted glycosyltransferase  32.65 
 
 
296 aa  54.3  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.410703  normal  0.289206 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0169  glycosyl transferase  35.77 
 
 
291 aa  53.9  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3178  glycosyl transferase family protein  24.39 
 
 
329 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1579  glycosyl transferase family 2  39.32 
 
 
299 aa  53.5  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.034375 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2477  glycosyl transferase family protein  38.95 
 
 
270 aa  53.5  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00815  hypothetical protein  35.65 
 
 
362 aa  53.1  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.491334  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10710  membrane sugar transferase  27.35 
 
 
470 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.456153 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0756  glycosyl transferase family protein  33.06 
 
 
260 aa  52.8  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00258657  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3624  glycosyl transferase family 2  36.8 
 
 
319 aa  52.8  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.519026 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1299  glycosyl transferase family protein  28.09 
 
 
470 aa  52  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0628268 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3595  glycosyl transferase family 2  31.9 
 
 
331 aa  51.6  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5057  glycosyl transferase family protein  29.36 
 
 
470 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2677  glycosyl transferase family protein  35.25 
 
 
1267 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3501  glycosyl transferase family 2  35.83 
 
 
310 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.222757  normal  0.064344 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4382  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 
258 aa  50.8  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0715238  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1760  glycosyl transferase family 2  31.73 
 
 
392 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1887  glycosyl transferase family protein  26.13 
 
 
360 aa  50.8  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.95114  normal  0.84589 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6344  glycosyl transferase family 2  35.43 
 
 
822 aa  50.8  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0187449  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1341  glycosyl transferase family 2  30.37 
 
 
272 aa  50.8  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000344524  normal  0.888688 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1736  glycosyl transferase family 2  31.73 
 
 
392 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  31.2 
 
 
311 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  24.64 
 
 
722 aa  50.4  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3109  glycosyl transferase family protein  31.13 
 
 
327 aa  50.4  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1816  glycosyl transferase family 2  21.95 
 
 
333 aa  50.4  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0484  glycosyl transferase family 2  25.13 
 
 
314 aa  50.1  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1836  glycosyl transferase family 2  31.22 
 
 
235 aa  49.7  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.25121  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5252  glycosyl transferase family protein  28.87 
 
 
327 aa  50.1  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.035706 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2305  glycosyl transferase family 2  36 
 
 
291 aa  49.7  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.064621 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0619  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.5 
 
 
311 aa  49.3  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773869  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3812  glycosyl transferase family 2  29.21 
 
 
307 aa  49.3  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0477  glycosyl transferase family protein  37.67 
 
 
299 aa  49.3  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.527373  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4889  glycosyl transferase family 2  29.21 
 
 
307 aa  49.3  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0764718 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  29.75 
 
 
324 aa  48.9  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0339  TPR repeat-containing protein  37.25 
 
 
400 aa  49.3  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.698701  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  27.8 
 
 
283 aa  48.5  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  29.24 
 
 
298 aa  49.3  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1004  glycosyl transferase family protein  30.04 
 
 
470 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  33.08 
 
 
836 aa  48.9  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3118  glycosyl transferase family protein  38.21 
 
 
334 aa  48.5  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1021  glycosyl transferase family protein  30.04 
 
 
470 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1031  glycosyl transferase family protein  30.04 
 
 
470 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0821008  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  26.62 
 
 
329 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3553  glycosyl transferase family 2  36.13 
 
 
456 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  30.22 
 
 
1340 aa  48.1  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2651  glycosyl transferase family protein  26.22 
 
 
303 aa  47.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.216407  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0560  glycosyl transferase family protein  32.31 
 
 
225 aa  48.1  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  23.89 
 
 
841 aa  48.1  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1389  glycosyl transferase family 2  37.93 
 
 
226 aa  48.5  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4359  glycosyl transferase family protein  25.87 
 
 
332 aa  48.1  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.947946 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4803  alpha-1,6-rhamnosyltransferase MigA  25.09 
 
 
300 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1981  glycosyl transferase family 2  29.91 
 
 
391 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.804142 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0640  glycosyl transferase family 2  35.77 
 
 
321 aa  48.1  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3324  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 
487 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.624929 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2081  glycosyl transferase  25.44 
 
 
316 aa  47.8  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.797991  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0082  O antigen biosynthesis rhamnosyltransferase, putative  31.94 
 
 
308 aa  47.8  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.19572  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26171  TPR repeat-containing glycosyl transferase  38.04 
 
 
427 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.599832 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3115  glycosyl transferase family 2  32.21 
 
 
235 aa  47.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0085  glycosyl transferase family 2  31.94 
 
 
308 aa  47.8  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0285695  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2078  glycosyl transferase family protein  40.91 
 
 
255 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149982  normal  0.0473511 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2190  glycosyl transferase family 2  24.7 
 
 
450 aa  47.4  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  30.1 
 
 
752 aa  47  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  29.23 
 
 
312 aa  47.4  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  24.61 
 
 
305 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2052  glycosyl transferase family protein  34.91 
 
 
255 aa  47  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>