More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4160 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4160  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
289 aa  601  1.0000000000000001e-171  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11310  predicted glycosyltransferase  40.71 
 
 
296 aa  221  9e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.410703  normal  0.289206 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3594  glycosyl transferase family 2  42.07 
 
 
290 aa  208  9e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1617  family 2 glycosyl transferase  42.55 
 
 
292 aa  207  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5644  glycosyl transferase family protein  37.14 
 
 
307 aa  205  6e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.223754  normal  0.273017 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4393  glycosyl transferase family protein  39.5 
 
 
291 aa  205  8e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.023883  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3812  glycosyl transferase family 2  41.26 
 
 
307 aa  205  8e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4889  glycosyl transferase family 2  41.26 
 
 
307 aa  205  8e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0764718 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1981  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.9 
 
 
295 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.620324  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3162  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.06 
 
 
315 aa  199  6e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1381  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.06 
 
 
302 aa  199  6e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.247424  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3033  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.06 
 
 
315 aa  199  6e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186654  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2267  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.06 
 
 
315 aa  199  6e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.58247  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1003  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.06 
 
 
315 aa  199  6e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1292  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.06 
 
 
315 aa  199  6e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0477  glycosyl transferase family protein  43.16 
 
 
299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.527373  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6392  glycosyl transferase family protein  35.71 
 
 
307 aa  196  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863517  normal  0.0945582 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1578  glycosyl transferase family 2  41.34 
 
 
291 aa  194  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0681892 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11300  predicted glycosyltransferase  41.2 
 
 
264 aa  194  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.438529  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1579  glycosyl transferase family 2  37.72 
 
 
299 aa  192  5e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.034375 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1377  glycosyl transferase family protein  35.71 
 
 
287 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.750548  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6452  glycosyl transferase family protein  35.71 
 
 
287 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3595  glycosyl transferase family 2  36.43 
 
 
331 aa  191  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5252  glycosyl transferase family protein  40.6 
 
 
327 aa  189  4e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.035706 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6044  glycosyl transferase family protein  35 
 
 
307 aa  189  5e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0866965  normal  0.274179 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5448  glycosyl transferase family protein  37.23 
 
 
308 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420602 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3216  glycosyl transferase family 2  24.9 
 
 
302 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2031  family 2 glycosyl transferase  28.85 
 
 
274 aa  79  0.00000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  27.35 
 
 
324 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3347  glycosyl transferase family protein  28.46 
 
 
308 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3181  glycosyl transferase family 2  27.52 
 
 
345 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.255598  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2934  glycosyl transferase family 2  25.22 
 
 
378 aa  72.4  0.000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607022  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0757  glycosyl transferase family protein  26.74 
 
 
358 aa  71.6  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5481  glycosyl transferase family protein  26.14 
 
 
310 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  26.5 
 
 
340 aa  70.1  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  26.15 
 
 
298 aa  68.9  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  25.42 
 
 
924 aa  68.9  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2355  glycosyltransferase  25.68 
 
 
320 aa  67.8  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3254  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.39 
 
 
314 aa  67.4  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.106646  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  24.9 
 
 
841 aa  67  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0139  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 
319 aa  66.6  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412068  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0256  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
279 aa  66.6  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  28.93 
 
 
312 aa  65.9  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  27.38 
 
 
311 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3343  glycosyl transferase family protein  26.64 
 
 
318 aa  65.1  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.178674  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2397  glycosyl transferase family protein  27.01 
 
 
332 aa  64.3  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  28.33 
 
 
329 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  27.06 
 
 
1035 aa  64.7  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  26.29 
 
 
838 aa  63.9  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4025  glycosyl transferase family protein  25.58 
 
 
346 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  26.26 
 
 
1120 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5500  glycosyl transferase family 2  28.87 
 
 
308 aa  62.8  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359708  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  27.87 
 
 
544 aa  62.8  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  24.66 
 
 
324 aa  62.4  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  26.27 
 
 
340 aa  62  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2486  glycosyl transferase family 2  24.66 
 
 
231 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0169  glycosyl transferase  28.27 
 
 
291 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0792  glycosyl transferase family protein  27.57 
 
 
376 aa  62  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.77414 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 
528 aa  61.6  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3118  glycosyl transferase family protein  27.66 
 
 
334 aa  61.2  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3501  glycosyl transferase family 2  24.51 
 
 
310 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.222757  normal  0.064344 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2879  glycosyl transferase family protein  26.74 
 
 
328 aa  60.5  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677444 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1341  glycosyl transferase family 2  25.53 
 
 
272 aa  60.8  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000344524  normal  0.888688 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  25.5 
 
 
310 aa  60.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3380  glycosyl transferase family protein  26.27 
 
 
224 aa  59.7  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0456561 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  25.23 
 
 
1162 aa  59.7  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6344  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
822 aa  59.7  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0187449  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4024  glycosyl transferase family protein  26.17 
 
 
322 aa  59.3  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  29.05 
 
 
289 aa  59.3  0.00000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  24.45 
 
 
313 aa  58.9  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  28.78 
 
 
320 aa  58.9  0.00000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  22.46 
 
 
294 aa  58.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2969  glycosyl transferase family 2  27.45 
 
 
327 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2700  glycosyl transferase family 2  28.29 
 
 
584 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00534164 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2877  glycosyl transferase family 2  26.96 
 
 
327 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.257964  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  35.71 
 
 
337 aa  57.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  26.67 
 
 
841 aa  57.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3624  glycosyl transferase family 2  24.81 
 
 
319 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.519026 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  26.6 
 
 
1118 aa  58.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  24.88 
 
 
293 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2651  glycosyl transferase family protein  24.8 
 
 
303 aa  57  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.216407  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  24.48 
 
 
283 aa  57  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  24.49 
 
 
1099 aa  56.6  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1579  glycosyl transferase family protein  24.22 
 
 
318 aa  57  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  25.91 
 
 
268 aa  56.6  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1381  glycosyl transferase family protein  32.6 
 
 
326 aa  56.6  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2462  glycosyl transferase family 2  27.95 
 
 
421 aa  56.6  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.278728  normal  0.420923 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0096  glycosyl transferase family 2  26.46 
 
 
382 aa  56.6  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.86731 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2102  glycosyl transferase family protein  24.05 
 
 
489 aa  56.6  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4145  glycosyl transferase family protein  24 
 
 
334 aa  56.2  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.417391 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  23.83 
 
 
299 aa  56.2  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2281  glycosyl transferase family 2  25.41 
 
 
282 aa  56.2  0.0000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.733627  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  26.05 
 
 
337 aa  56.2  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0031  glycosyl transferase family 2  30.94 
 
 
636 aa  56.2  0.0000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.188799 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  28 
 
 
477 aa  56.2  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4699  glycosyl transferase family 2  25.22 
 
 
308 aa  56.2  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.252181  normal  0.0261338 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4618  glycosyl transferase family protein  29.32 
 
 
322 aa  56.2  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0203998 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0518  family 2 glycosyl transferase  24.05 
 
 
754 aa  55.8  0.0000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00714685  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3791  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  26.05 
 
 
317 aa  55.8  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3362  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
235 aa  55.8  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0060739  normal  0.350588 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>