More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5180 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5180  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
322 aa  664    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.48188  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4800  glycosyl transferase family 2  47.99 
 
 
330 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0196264 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3837  glycosyl transferase family 2  44.57 
 
 
276 aa  244  9.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.567699 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2348  glycosyl transferase family protein  37.33 
 
 
316 aa  185  7e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1184  glycosyl transferase family protein  42.13 
 
 
801 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2389  glycosyl transferase family protein  36.05 
 
 
596 aa  172  7.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.062581  hitchhiker  0.00000855128 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11553  sugar transferase  36.55 
 
 
357 aa  157  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11550  sugar transferase  36.86 
 
 
336 aa  147  3e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0769  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  39.35 
 
 
329 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0318  glycosyl transferase family protein  31 
 
 
285 aa  130  4.0000000000000003e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0743987  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3441  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.72 
 
 
311 aa  119  6e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.49643  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3223  glycosyl transferase family protein  32.38 
 
 
311 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0595343  normal  0.234562 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1419  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.33 
 
 
345 aa  113  4.0000000000000004e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.958306  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3180  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.12 
 
 
298 aa  112  6e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1697  glycosyl transferase family protein  34.36 
 
 
336 aa  105  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.591253  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3723  hypothetical protein  31.51 
 
 
333 aa  103  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4043  glycosyl transferase family protein  32.42 
 
 
319 aa  92  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.87992 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3070  glycosyl transferase family protein  41.46 
 
 
317 aa  92  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.976972  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6233  glycosyl transferase family 2  29.67 
 
 
316 aa  85.9  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121855  normal  0.472399 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  28.73 
 
 
326 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1962  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.84 
 
 
312 aa  82  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1728  glycosyl transferase family 2  38.17 
 
 
573 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.230858 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  25.9 
 
 
1035 aa  80.9  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3408  glycosyl transferase family protein  37.88 
 
 
352 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  35.56 
 
 
727 aa  79.3  0.00000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4042  glycosyl transferase family protein  33.08 
 
 
358 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.625584  normal  0.900283 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  30.6 
 
 
347 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0631  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.81 
 
 
321 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
318 aa  77.8  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44450  Glycosyl transferase, family 2 protein  40.83 
 
 
340 aa  77  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  28.83 
 
 
300 aa  76.6  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  33.99 
 
 
313 aa  75.9  0.0000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29980  Glycosyl transferase, family 2 protein  28.26 
 
 
325 aa  75.5  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.191299  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2949  glycosyl transferase family 2  32.86 
 
 
329 aa  74.7  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.384487  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1811  glycosyl transferase family protein  37.7 
 
 
294 aa  74.7  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0703738  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  30.18 
 
 
230 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3057  glycosyl transferase family protein  28.93 
 
 
318 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2504  glycosyl transferase family protein  36.67 
 
 
373 aa  73.9  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.695425  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0071  glycosyl transferase family 2  31.06 
 
 
334 aa  73.6  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0258597 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0960  glycosyl transferase family 2  35.71 
 
 
338 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0106239  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  26.88 
 
 
320 aa  73.2  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1967  glycosyl transferase family protein  35 
 
 
300 aa  72.8  0.000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3678  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  38.64 
 
 
466 aa  72.8  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3797  glycosyl transferase family 2  27.63 
 
 
329 aa  72.8  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.5387  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3748  glycosyl transferase family 2  27.63 
 
 
329 aa  72.4  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  28.7 
 
 
326 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2592  glycosyltransferase domain-containing protein  36.36 
 
 
308 aa  72  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2372  glycosyl transferase family 2  32.14 
 
 
379 aa  72  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1720  N-acetylgalactosaminyl-proteoglycan 3-beta-glucuronosyltransferase  27.68 
 
 
255 aa  71.2  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.674928  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1307  glycosyl transferase family protein  34.42 
 
 
335 aa  71.6  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0704  glycosyl transferase family 2  26.81 
 
 
462 aa  71.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.439605  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0622  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.78 
 
 
341 aa  70.9  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  35.34 
 
 
363 aa  70.9  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2176  glycosyl transferase family protein  36.3 
 
 
324 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0528602  hitchhiker  0.0000162414 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2943  glycosyl transferase family 2  26.62 
 
 
332 aa  70.1  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2176  glycosyl transferase family protein  36.45 
 
 
455 aa  70.1  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1931  glycosyl transferase family protein  37.19 
 
 
347 aa  70.1  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.211826  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  26.81 
 
 
235 aa  69.7  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  28.26 
 
 
326 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1130  glycosyl transferase family 2  31.44 
 
 
332 aa  69.7  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4274  glycosyl transferase family 2  37.14 
 
 
249 aa  69.7  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.467766  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1212  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  38.78 
 
 
946 aa  69.7  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.333736  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6429  glycosyl transferase family 2  26.47 
 
 
316 aa  69.7  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596703  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5223  glycosyl transferase family protein  30.14 
 
 
321 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  28.26 
 
 
326 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2481  family 2 glycosyl transferase  29.86 
 
 
340 aa  69.3  0.00000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530685  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0522  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  27.8 
 
 
729 aa  69.3  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.010649 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  30.3 
 
 
390 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1070  glycosyl transferase family 2  25.89 
 
 
337 aa  68.9  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0299214 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5561  glycosyl transferase domain-containing protein  29.48 
 
 
321 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1402  glycosyl transferase family 2  25.6 
 
 
372 aa  67.8  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000124327  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2881  glycosyl transferase family protein  34.13 
 
 
271 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3275  glycosyl transferase family 2  29.57 
 
 
362 aa  67.4  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.355424  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3784  glycosyl transferase family protein  26.25 
 
 
320 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0888  b-glycosyltransferase  39.66 
 
 
333 aa  67.8  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0236559  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4474  glycosyl transferase family protein  38.21 
 
 
235 aa  67  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0455914 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2105  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.15 
 
 
254 aa  67  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0121105  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  33.8 
 
 
321 aa  67  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  30.88 
 
 
338 aa  67  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3721  glycosyl transferase family protein  29.03 
 
 
338 aa  67  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0314  glycosyl transferase family 2  26.99 
 
 
348 aa  66.6  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5289  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  26.2 
 
 
326 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1239  cell wall membrane glycosyltransferase  34.21 
 
 
344 aa  66.6  0.0000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  34.33 
 
 
347 aa  66.6  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  24.67 
 
 
331 aa  66.6  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0148  glycosyl transferase family protein  28.05 
 
 
350 aa  66.6  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.341853  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1270  general glycosylation pathway protein  27.7 
 
 
309 aa  65.9  0.0000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.553122  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
302 aa  66.2  0.0000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1730  glycosyl transferase family 2  34.31 
 
 
326 aa  65.9  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal  0.188207 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3095  glycosyl transferase family protein  31.06 
 
 
320 aa  65.9  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.23695  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  27 
 
 
344 aa  65.9  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0593  general glycosylation pathway protein  27.8 
 
 
309 aa  65.9  0.0000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.422601  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0556  glycosyl transferase family protein  31.85 
 
 
349 aa  65.9  0.0000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.532544  normal  0.84686 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0633  glycosyl transferase family 2  26.55 
 
 
345 aa  65.1  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.810954  normal  0.460894 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0237  putative glycosyl transferase  29.55 
 
 
334 aa  65.1  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000312549  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4987  glycosyl transferase family protein  38.21 
 
 
235 aa  65.9  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278061  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4593  glycosyl transferase family 2  33.62 
 
 
1032 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3928  glycosyl transferase family 2  26.29 
 
 
305 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  23.91 
 
 
1250 aa  65.5  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2195  glycosyl transferase family 2  23.77 
 
 
351 aa  65.5  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.496313  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>