40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_26380 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_26380  predicted glycosyltransferase  100 
 
 
570 aa  1124    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2423  glycosyl transferase, family 2  29.42 
 
 
674 aa  197  6e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.121377 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5649  glycosyltransferases-like protein  31.39 
 
 
653 aa  190  7e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.137997  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1402  putative glycosyltransferase  29.35 
 
 
659 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1160  glycosyltransferases-like protein  30.63 
 
 
648 aa  184  3e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.417829  normal  0.267906 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0636  glycosyltransferase-like protein  33.82 
 
 
658 aa  184  5.0000000000000004e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2693  glycosyl transferase family protein  28.67 
 
 
671 aa  181  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.316585  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3887  glycosyl transferase family 2  30.79 
 
 
669 aa  175  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00718752 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2574  glycosyltransferase-like protein  30.31 
 
 
656 aa  173  7.999999999999999e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13842  bifunctional UDP-galactofuranosyl transferase glfT  31.34 
 
 
637 aa  170  5e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.888345  normal  0.478345 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5107  glycosyltransferases-like protein  30.85 
 
 
641 aa  167  5e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.351774  normal  0.369198 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5400  glycosyltransferases-like protein  30.85 
 
 
641 aa  167  5e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.128175 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5019  glycosyltransferases-like protein  30.85 
 
 
641 aa  167  5e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.867763  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08870  predicted glycosyltransferase  31.22 
 
 
659 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.313185 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0162  putative galactofuranosyltransferase  30.76 
 
 
651 aa  165  3e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20840  predicted glycosyltransferase  30.57 
 
 
723 aa  155  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01420  predicted glycosyltransferase  29.23 
 
 
624 aa  155  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0968148 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4324  glycosyltransferase  31.76 
 
 
620 aa  150  7e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.77529  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1219  glycosyl transferase family protein  30.09 
 
 
678 aa  142  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4320  glycosyltransferase  30.25 
 
 
639 aa  141  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0205  glycosyltransferase-like protein  30.39 
 
 
650 aa  137  4e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.101411  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0517  family 2 glycosyl transferase  27.09 
 
 
621 aa  86.3  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00397833  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3217  glycosyl transferase family 2  26.03 
 
 
455 aa  72  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4003  hypothetical protein  21.88 
 
 
635 aa  67.8  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.738232  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2102  glycosyl transferase family protein  22.96 
 
 
489 aa  65.9  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0784  putative glycosyltransferase, cell wall biogenesis  27.24 
 
 
592 aa  57.4  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.138448  normal  0.0467489 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0881  putative glycosyltransferase, cell wall biogenesis  26.92 
 
 
592 aa  57.4  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.22195  normal  0.346157 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0848  putative glycosyltransferase, cell wall biogenesis  26.92 
 
 
592 aa  56.6  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0412528  decreased coverage  0.00000137113 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  24 
 
 
314 aa  49.3  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2651  glycosyl transferase family protein  33.01 
 
 
303 aa  49.7  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.216407  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  27.5 
 
 
679 aa  48.1  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4361  glycosyl transferase family 2  20.97 
 
 
302 aa  47.8  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.972233 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1400  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
306 aa  47.8  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  32.14 
 
 
330 aa  47  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3779  glycosyl transferase family protein  24.33 
 
 
318 aa  45.8  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2743  glycosyl transferase family 2  25.82 
 
 
297 aa  45.1  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  40.91 
 
 
1523 aa  44.7  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3095  glycosyl transferase family 2  29.13 
 
 
337 aa  44.7  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0262384  normal  0.253171 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0313  rhamnosyl transferase related protein  33.33 
 
 
342 aa  43.5  0.01  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0691397 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0362  glycosyl transferase family protein  24.23 
 
 
364 aa  43.5  0.01  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.279909  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>