114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_0393 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_0393  rhamnosyltransferase  100 
 
 
286 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0875  rhamnosyltransferase  100 
 
 
286 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0846  rhamnosyltransferase  97.55 
 
 
299 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0700283 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0882  rhamnosyltransferase  60.84 
 
 
298 aa  371  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2315  rhamnosyltransferase  59.51 
 
 
303 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.10741 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0541  rhamnosyltransferase  38.78 
 
 
300 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.524826  normal  0.174898 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2177  rhamnosyltransferase  37.59 
 
 
323 aa  181  1e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0964  glycosyl transferase family protein  32.76 
 
 
297 aa  158  1e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.281177  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0629  rhamnosyltransferase  35.49 
 
 
308 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3205  rhamnosyltransferase  34.57 
 
 
288 aa  140  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.363372  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3054  glycosyltransferase-like protein  34.01 
 
 
303 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2996  rhamnosyltransferase  33.09 
 
 
321 aa  131  1.0000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.230677  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1610  glycosyl transferase family protein  34.96 
 
 
295 aa  116  5e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.151878  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03053  Rhamnosyltransferase  29.9 
 
 
292 aa  115  6e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.753306  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49760  rhamnosyltransferase 2  30.74 
 
 
325 aa  113  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0288  glycosyl transferase family protein  33 
 
 
329 aa  110  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0633  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.72 
 
 
287 aa  108  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1578  rhamnosyltransferase  33.21 
 
 
318 aa  104  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.700972 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3502  rhamnosyltransferase  33.72 
 
 
301 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.099616 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3302  rhamnosyltransferase  34.98 
 
 
301 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.512041 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4930  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.48 
 
 
289 aa  96.7  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.356982 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3625  rhamnosyltransferase  34.35 
 
 
309 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.896499  normal  0.372836 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5030  rhamnosyltransferase  33.09 
 
 
312 aa  93.6  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.990279  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3397  rhamnosyltransferase  28.52 
 
 
294 aa  93.2  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.385877  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6405  rhamnosyltransferase  27.85 
 
 
294 aa  92  9e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6638  rhamnosyltransferase  27.85 
 
 
294 aa  92  9e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.204482  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5332  glycosyl transferase family protein  31.02 
 
 
321 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.010432  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6236  rhamnosyltransferase  27.85 
 
 
294 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240243  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1079  rhamnosyltransferase family protein  30.26 
 
 
321 aa  90.5  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0415995  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1877  rhamnosyltransferase family protein  30.26 
 
 
321 aa  90.5  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.303567  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5218  rhamnosyltransferase  32.14 
 
 
305 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4505  rhamnosyltransferase  32.49 
 
 
312 aa  88.6  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.661015  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0728  rhamnosyltransferase  28.75 
 
 
331 aa  86.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1829  rhamnosyltransferase  28.75 
 
 
331 aa  86.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0371  rhamnosyltransferase II  28.75 
 
 
331 aa  85.9  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110599  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0462  rhamnosyltransferase II  28.75 
 
 
331 aa  85.9  7e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.103528  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0923  rhamnosyltransferase family protein  28.75 
 
 
331 aa  85.9  7e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0852562  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2097  rhamnosyltransferase II  28.75 
 
 
331 aa  85.9  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0099449  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0459  rhamnosyltransferase family protein  28.75 
 
 
331 aa  85.9  7e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0720  rhamnosyltransferase II  28.75 
 
 
331 aa  85.9  7e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000325438  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0687  dTDP-rhamnosyl transferase rfbf protein  30.92 
 
 
309 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0814  rhamnosyltransferase  28.71 
 
 
335 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0467732  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1917  rhamnosyltransferase II  28.71 
 
 
335 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0281332  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0560  rhamnosyltransferase  31.34 
 
 
312 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0189  dTDP-rhamnosyl transferase rfbf protein  28.43 
 
 
331 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1016  rhamnosyltransferase II  28.43 
 
 
331 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.940523  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1419  rhamnosyltransferase family protein  28.43 
 
 
331 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.646273  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1990  rhamnosyltransferase II  28.43 
 
 
331 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00265591  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5951  rhamnosyltransferase  30.48 
 
 
302 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0831298  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3275  rhamnosyltransferase  29.96 
 
 
312 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0196034  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5093  rhamnosyltransferase  29.96 
 
 
312 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.491648  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  28.62 
 
 
305 aa  81.3  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  27.11 
 
 
300 aa  80.1  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  27.94 
 
 
303 aa  79.7  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8190  glycosyl transferase family 2  29.35 
 
 
307 aa  78.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5189  rhamnosyltransferase  29.59 
 
 
312 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.46583  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2565  glycosyl transferase family 2  32.14 
 
 
322 aa  77.4  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8183  glycosyl transferase family 2  29.3 
 
 
295 aa  75.1  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.123553  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2685  glycosyl transferase family protein  32.11 
 
 
299 aa  74.7  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8185  glycosyl transferase family 2  27.15 
 
 
301 aa  72.8  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1148  glycosyltransferase  26.41 
 
 
293 aa  68.2  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000022742  hitchhiker  0.00000000318064 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2648  glycosyl transferase family protein  26.45 
 
 
304 aa  65.1  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.747467  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2416  glycosyl transferase family 2  28.63 
 
 
309 aa  65.1  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.518239 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1200  WbwY  26.16 
 
 
315 aa  63.9  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.771047  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3033  glycosyl transferase family protein  25.45 
 
 
308 aa  60.5  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.244321  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3217  glycosyl transferase family 2  23.6 
 
 
455 aa  60.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0409  glycosyl transferase family 2  29.7 
 
 
315 aa  58.9  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.535242  hitchhiker  0.0010651 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0233  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.7 
 
 
315 aa  58.9  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.885705  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2407  glycosyl transferase family protein  28.64 
 
 
312 aa  57.8  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.116461  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3185  glycosyl transferase family protein  23.08 
 
 
297 aa  57.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3119  glycosyl transferase family protein  29.29 
 
 
282 aa  56.6  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1411  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.66 
 
 
282 aa  55.8  0.0000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2031  family 2 glycosyl transferase  29.29 
 
 
274 aa  53.5  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6727  glycosyl transferase family protein  25.42 
 
 
319 aa  53.1  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0965  glycosyl transferase family protein  24.41 
 
 
275 aa  52  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.253321  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2104  glycosyl transferase family protein  25.87 
 
 
302 aa  51.6  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0353  glycosyl transferase family 2  25.56 
 
 
317 aa  51.2  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0820  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
308 aa  50.8  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2030  glycosyl transferase family 2  22.59 
 
 
303 aa  49.3  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.952561  hitchhiker  0.000668775 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1795  glycosyl transferase family protein  30.67 
 
 
306 aa  48.9  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  27.83 
 
 
298 aa  48.5  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6266  glycosyl transferase family 2  23.91 
 
 
288 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  26.21 
 
 
616 aa  48.5  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0185  glycosyl transferase family 2  21.33 
 
 
305 aa  48.9  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0197048  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0313  rhamnosyl transferase related protein  24.88 
 
 
342 aa  47.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0691397 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1310  glycosyl transferase family protein  20.65 
 
 
342 aa  47.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  29.9 
 
 
293 aa  47  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2683  glycosyl transferase family 2  23.92 
 
 
361 aa  47  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1341  glycosyl transferase family 2  33.55 
 
 
272 aa  46.6  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000344524  normal  0.888688 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0238  glycosyltransferase  19.11 
 
 
342 aa  46.6  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00200202  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4256  glycosyl transferase family protein  24.88 
 
 
336 aa  46.6  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.586342  normal  0.139884 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3852  glycosyl transferase family 2  22.75 
 
 
321 aa  46.2  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  23.56 
 
 
314 aa  46.2  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1579  glycosyl transferase family protein  25.45 
 
 
318 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3720  putative glycosyl transferase  26.05 
 
 
302 aa  46.2  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2102  glycosyl transferase family protein  21.72 
 
 
489 aa  45.8  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4473  glycosyl transferase family protein  24.66 
 
 
340 aa  45.8  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.966057  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3709  glycosyl transferase family 2  21.43 
 
 
307 aa  45.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530664  normal  0.0910127 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1068  glycosyl transferase group 1  28.86 
 
 
658 aa  45.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114697  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1565  glycosyl transferase family 2  23.81 
 
 
970 aa  45.4  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000603283  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>