71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1578 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1578  rhamnosyltransferase  100 
 
 
318 aa  608  1e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.700972 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3502  rhamnosyltransferase  57.19 
 
 
301 aa  278  7e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.099616 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3625  rhamnosyltransferase  56.61 
 
 
309 aa  275  8e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.896499  normal  0.372836 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3302  rhamnosyltransferase  55.67 
 
 
301 aa  268  1e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.512041 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5332  glycosyl transferase family protein  38.57 
 
 
321 aa  151  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.010432  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5218  rhamnosyltransferase  36.3 
 
 
305 aa  125  7e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5951  rhamnosyltransferase  36.08 
 
 
302 aa  124  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0831298  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2315  rhamnosyltransferase  33.67 
 
 
303 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.10741 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0846  rhamnosyltransferase  33.97 
 
 
299 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0700283 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0875  rhamnosyltransferase  33.21 
 
 
286 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0393  rhamnosyltransferase  33.21 
 
 
286 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1610  glycosyl transferase family protein  33.47 
 
 
295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.151878  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0541  rhamnosyltransferase  30.61 
 
 
300 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.524826  normal  0.174898 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0882  rhamnosyltransferase  31.23 
 
 
298 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03053  Rhamnosyltransferase  29.07 
 
 
292 aa  103  5e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.753306  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2177  rhamnosyltransferase  28.51 
 
 
323 aa  94.7  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0633  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.08 
 
 
287 aa  94  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0629  rhamnosyltransferase  31.2 
 
 
308 aa  89.4  8e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3054  glycosyltransferase-like protein  27.27 
 
 
303 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8183  glycosyl transferase family 2  29.82 
 
 
295 aa  80.9  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.123553  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0687  dTDP-rhamnosyl transferase rfbf protein  32.68 
 
 
309 aa  80.9  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4930  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.58 
 
 
289 aa  80.5  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.356982 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2996  rhamnosyltransferase  26.22 
 
 
321 aa  80.1  0.00000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.230677  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3205  rhamnosyltransferase  27.19 
 
 
288 aa  79  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.363372  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8185  glycosyl transferase family 2  29.88 
 
 
301 aa  77  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0560  rhamnosyltransferase  29.22 
 
 
312 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5189  rhamnosyltransferase  28.57 
 
 
312 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.46583  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0964  glycosyl transferase family protein  24.15 
 
 
297 aa  73.6  0.000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.281177  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5030  rhamnosyltransferase  29.24 
 
 
312 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.990279  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2565  glycosyl transferase family 2  30.84 
 
 
322 aa  69.7  0.00000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3397  rhamnosyltransferase  29.33 
 
 
294 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.385877  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5093  rhamnosyltransferase  27.92 
 
 
312 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.491648  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3275  rhamnosyltransferase  27.92 
 
 
312 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0196034  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6236  rhamnosyltransferase  29.05 
 
 
294 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240243  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4505  rhamnosyltransferase  27.36 
 
 
312 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.661015  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0288  glycosyl transferase family protein  29.26 
 
 
329 aa  67  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6638  rhamnosyltransferase  29.34 
 
 
294 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.204482  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6405  rhamnosyltransferase  29.34 
 
 
294 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8190  glycosyl transferase family 2  28.69 
 
 
307 aa  66.2  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49760  rhamnosyltransferase 2  30.49 
 
 
325 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1877  rhamnosyltransferase family protein  26.47 
 
 
321 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.303567  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1079  rhamnosyltransferase family protein  26.47 
 
 
321 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0415995  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0814  rhamnosyltransferase  26.69 
 
 
335 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0467732  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1917  rhamnosyltransferase II  26.69 
 
 
335 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0281332  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1411  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.56 
 
 
282 aa  61.6  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1829  rhamnosyltransferase  26.35 
 
 
331 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0728  rhamnosyltransferase  26.35 
 
 
331 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0462  rhamnosyltransferase II  26.35 
 
 
331 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.103528  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0720  rhamnosyltransferase II  26.35 
 
 
331 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000325438  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0459  rhamnosyltransferase family protein  26.35 
 
 
331 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0923  rhamnosyltransferase family protein  26.35 
 
 
331 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0852562  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0371  rhamnosyltransferase II  26.35 
 
 
331 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110599  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2097  rhamnosyltransferase II  26.35 
 
 
331 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0099449  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1419  rhamnosyltransferase family protein  26.03 
 
 
331 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.646273  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1016  rhamnosyltransferase II  26.03 
 
 
331 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.940523  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0189  dTDP-rhamnosyl transferase rfbf protein  26.03 
 
 
331 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1990  rhamnosyltransferase II  26.03 
 
 
331 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00265591  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  28.7 
 
 
305 aa  55.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3226  glycosyl transferase family protein  27.04 
 
 
317 aa  53.5  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2651  glycosyl transferase family protein  27.94 
 
 
303 aa  53.5  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.216407  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  23.13 
 
 
314 aa  52.8  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2416  glycosyl transferase family 2  30.92 
 
 
309 aa  52  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.518239 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2615  glycosyl transferase family protein  30.65 
 
 
298 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.106045  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2685  glycosyl transferase family protein  31.49 
 
 
299 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  25.24 
 
 
298 aa  45.1  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5784  glycosyl transferase family 2  22.77 
 
 
291 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3033  glycosyl transferase family protein  24.74 
 
 
308 aa  44.3  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.244321  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6387  glycosyl transferase family 2  31.82 
 
 
340 aa  43.9  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0741751  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4474  glycosyl transferase family 2  22.95 
 
 
290 aa  43.1  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0078  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.58 
 
 
327 aa  42.7  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.780673  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0081  glycosyl transferase family 2  23.58 
 
 
340 aa  42.7  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>