79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_3275 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_3275  rhamnosyltransferase  100 
 
 
312 aa  630  1e-180  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0196034  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5093  rhamnosyltransferase  100 
 
 
312 aa  630  1e-180  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.491648  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5189  rhamnosyltransferase  97.44 
 
 
312 aa  613  1e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.46583  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0560  rhamnosyltransferase  95.51 
 
 
312 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4505  rhamnosyltransferase  87.82 
 
 
312 aa  535  1e-151  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.661015  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5030  rhamnosyltransferase  88.46 
 
 
312 aa  532  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.990279  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0371  rhamnosyltransferase II  65.81 
 
 
331 aa  401  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110599  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2097  rhamnosyltransferase II  65.81 
 
 
331 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0099449  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0720  rhamnosyltransferase II  65.81 
 
 
331 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000325438  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0923  rhamnosyltransferase family protein  65.81 
 
 
331 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0852562  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0462  rhamnosyltransferase II  65.81 
 
 
331 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.103528  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1829  rhamnosyltransferase  65.81 
 
 
331 aa  401  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0728  rhamnosyltransferase  65.81 
 
 
331 aa  401  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0459  rhamnosyltransferase family protein  65.81 
 
 
331 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1419  rhamnosyltransferase family protein  65.5 
 
 
331 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.646273  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1917  rhamnosyltransferase II  64.98 
 
 
335 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0281332  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1990  rhamnosyltransferase II  65.5 
 
 
331 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00265591  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1016  rhamnosyltransferase II  65.5 
 
 
331 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.940523  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0814  rhamnosyltransferase  64.98 
 
 
335 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0467732  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0189  dTDP-rhamnosyl transferase rfbf protein  65.5 
 
 
331 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1877  rhamnosyltransferase family protein  65.35 
 
 
321 aa  394  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.303567  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1079  rhamnosyltransferase family protein  65.35 
 
 
321 aa  394  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0415995  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49760  rhamnosyltransferase 2  48.36 
 
 
325 aa  260  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6405  rhamnosyltransferase  40.69 
 
 
294 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6236  rhamnosyltransferase  40.69 
 
 
294 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240243  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6638  rhamnosyltransferase  40.69 
 
 
294 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.204482  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0687  dTDP-rhamnosyl transferase rfbf protein  38.16 
 
 
309 aa  192  5e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3397  rhamnosyltransferase  40.41 
 
 
294 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.385877  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0882  rhamnosyltransferase  33.33 
 
 
298 aa  114  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0633  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.88 
 
 
287 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2315  rhamnosyltransferase  31.21 
 
 
303 aa  102  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.10741 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3054  glycosyltransferase-like protein  28.23 
 
 
303 aa  98.2  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4930  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.66 
 
 
289 aa  94.7  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.356982 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8185  glycosyl transferase family 2  26.46 
 
 
301 aa  88.6  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8183  glycosyl transferase family 2  26.35 
 
 
295 aa  85.1  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.123553  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3205  rhamnosyltransferase  27.18 
 
 
288 aa  82  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.363372  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03053  Rhamnosyltransferase  26.85 
 
 
292 aa  81.3  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.753306  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0629  rhamnosyltransferase  27.21 
 
 
308 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0875  rhamnosyltransferase  29.96 
 
 
286 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0393  rhamnosyltransferase  29.96 
 
 
286 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2177  rhamnosyltransferase  28.67 
 
 
323 aa  80.1  0.00000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0846  rhamnosyltransferase  29.15 
 
 
299 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0700283 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0541  rhamnosyltransferase  30.07 
 
 
300 aa  78.6  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.524826  normal  0.174898 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0288  glycosyl transferase family protein  28.62 
 
 
329 aa  77.8  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2996  rhamnosyltransferase  27.05 
 
 
321 aa  75.1  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.230677  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0964  glycosyl transferase family protein  23.96 
 
 
297 aa  75.5  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.281177  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2416  glycosyl transferase family 2  25.65 
 
 
309 aa  70.9  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.518239 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8190  glycosyl transferase family 2  25.84 
 
 
307 aa  68.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5332  glycosyl transferase family protein  28.05 
 
 
321 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.010432  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2565  glycosyl transferase family 2  29.66 
 
 
322 aa  64.7  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1610  glycosyl transferase family protein  24.82 
 
 
295 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.151878  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3502  rhamnosyltransferase  31.58 
 
 
301 aa  62.8  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.099616 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2138  glycosyl transferase family 2  22.22 
 
 
311 aa  61.6  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2685  glycosyl transferase family protein  27.24 
 
 
299 aa  62  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5218  rhamnosyltransferase  30.16 
 
 
305 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5951  rhamnosyltransferase  29.3 
 
 
302 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0831298  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3720  putative glycosyl transferase  25.37 
 
 
302 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1578  rhamnosyltransferase  27.92 
 
 
318 aa  59.3  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.700972 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4734  glycosyl transferase family protein  29.83 
 
 
294 aa  59.3  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1200  WbwY  24.43 
 
 
315 aa  58.2  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.771047  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3302  rhamnosyltransferase  29.77 
 
 
301 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.512041 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3625  rhamnosyltransferase  29.77 
 
 
309 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.896499  normal  0.372836 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2651  glycosyl transferase family protein  25.32 
 
 
303 aa  57.8  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.216407  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1148  glycosyltransferase  22.11 
 
 
293 aa  57  0.0000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000022742  hitchhiker  0.00000000318064 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1411  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.71 
 
 
282 aa  50.8  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0139  glycosyl transferase family protein  24.09 
 
 
319 aa  49.3  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412068  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3181  glycosyl transferase family 2  27.16 
 
 
345 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.255598  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2933  family 2 glycosyl transferase  25.37 
 
 
284 aa  46.6  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.593138  normal  0.360179 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4025  glycosyl transferase family protein  27.35 
 
 
346 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5057  glycosyl transferase family protein  24.81 
 
 
470 aa  45.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0256  glycosyl transferase family 2  25.75 
 
 
279 aa  43.9  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1565  glycosyl transferase family 2  34.55 
 
 
970 aa  43.9  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000603283  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3033  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
308 aa  43.9  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.244321  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  26.24 
 
 
300 aa  43.9  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3185  glycosyl transferase family protein  15.7 
 
 
297 aa  43.9  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2264  glycosyl transferase family 2  26.11 
 
 
270 aa  42.7  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.503819  normal  0.135779 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5877  glycosyl transferase family protein  27.43 
 
 
303 aa  42.7  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.191547  normal  0.690247 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1694  glycosyl transferase family protein  24.05 
 
 
340 aa  42.4  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.128471  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1400  glycosyl transferase family protein  24.64 
 
 
306 aa  42.4  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>