More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1650 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_1650  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
679 aa  1402    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4940  glycosyl transferase family protein  30.13 
 
 
336 aa  78.6  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  24.26 
 
 
320 aa  72.8  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  28.07 
 
 
1644 aa  72  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  28.07 
 
 
1644 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  26.55 
 
 
371 aa  70.9  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2410  glycosyl transferase, group 1  30.97 
 
 
368 aa  69.7  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0502  glycosyl transferase family 2  29.05 
 
 
355 aa  69.3  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.925562  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  29.21 
 
 
283 aa  68.9  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2447  glycosyl transferase family protein  30.54 
 
 
343 aa  67.8  0.0000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.83328  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1755  glycosyl transferase group 1  29.61 
 
 
365 aa  67  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0890  a-glycosyltransferase  30.71 
 
 
420 aa  66.6  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0247924  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  29.15 
 
 
836 aa  66.6  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  27.96 
 
 
838 aa  66.6  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4007  glycosyl transferase, group 1  31.25 
 
 
390 aa  66.2  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.308231  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  27.05 
 
 
624 aa  65.5  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4047  glycosyl transferase group 1  24.19 
 
 
422 aa  65.5  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  30.22 
 
 
525 aa  65.5  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0907  glycosyl transferase family protein  26.47 
 
 
415 aa  65.5  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00249013  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5261  glycosyl transferase group 1  28.51 
 
 
323 aa  65.1  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.756426  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  28.45 
 
 
360 aa  64.3  0.000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0288  glycosyl transferase family protein  24.49 
 
 
709 aa  64.3  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0772  glycosyl transferase family protein  24.49 
 
 
709 aa  64.3  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2408  glycosyl transferase family 2  22.43 
 
 
1334 aa  64.3  0.000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  30.28 
 
 
412 aa  63.9  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  28.19 
 
 
841 aa  63.9  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1581  glycosyl transferase, group 1  33.85 
 
 
359 aa  63.9  0.000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1041  glycosyl transferase, group 1  26.61 
 
 
420 aa  63.9  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000238759  normal  0.0144782 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  26.48 
 
 
679 aa  63.5  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  28.3 
 
 
1435 aa  63.5  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2999  glycosyl transferase family 2  24.51 
 
 
988 aa  63.2  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  29.88 
 
 
340 aa  63.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2342  glycosyl transferase family protein  29.44 
 
 
270 aa  62.8  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3344  glycosyl transferase family protein  26.3 
 
 
274 aa  62.8  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.27907 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0077  glycosyl transferase family protein  30.49 
 
 
287 aa  62.8  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1503  glycosyl transferase family 2  27.94 
 
 
733 aa  63.2  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  26.94 
 
 
401 aa  62.4  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0883  glycosyl transferase family 2  22.96 
 
 
723 aa  62.4  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1299  glycosyl transferase family protein  30.32 
 
 
470 aa  62.4  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0628268 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  25.32 
 
 
340 aa  62  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5057  glycosyl transferase family protein  29.79 
 
 
470 aa  61.6  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0028  LPS glycosyltransferase  38.36 
 
 
373 aa  61.6  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000218534  hitchhiker  0.00835571 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1780  glycosyl transferase group 1  32.8 
 
 
412 aa  61.2  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2021  glycosyl transferase group 1  34.11 
 
 
312 aa  61.6  0.00000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0243957  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3344  glycosyl transferase, group 1  27.62 
 
 
384 aa  61.2  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3595  glycosyl transferase family 2  29.2 
 
 
331 aa  61.2  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3096  glycosyl transferase, group 1  34.09 
 
 
439 aa  61.2  0.00000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.332935  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2281  glycosyl transferase family 2  29.06 
 
 
282 aa  61.2  0.00000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.733627  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1065  Glycosyltransferase-like protein  31.51 
 
 
311 aa  61.2  0.00000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  37.21 
 
 
376 aa  61.2  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0691  glycosyl transferase, group 1  27.37 
 
 
377 aa  61.2  0.00000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  31.03 
 
 
355 aa  60.8  0.00000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0841  glycosyl transferase family 2  26.17 
 
 
337 aa  60.8  0.00000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4280  hypothetical protein  30.62 
 
 
1171 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1454  glycosyl transferase group 1  32.35 
 
 
374 aa  60.1  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0515255  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0991  glycosyl transferase group 1  24.56 
 
 
346 aa  60.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00704021  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0773  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
457 aa  60.5  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0010  glycosyl transferase, group 1  27.73 
 
 
467 aa  60.5  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.785418  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2016  glycosyl transferase family protein  24.89 
 
 
322 aa  60.5  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.12313  normal  0.993196 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0799  glycosyl transferase, group 1  28.1 
 
 
378 aa  60.1  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4786  glycosyl transferase group 1  24.17 
 
 
414 aa  59.3  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0735512 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1818  glycosyl transferase family protein  32.43 
 
 
335 aa  59.3  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0546  glycosyl transferase  25.94 
 
 
348 aa  59.7  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483878  normal  0.249879 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.36 
 
 
407 aa  59.7  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1294  glycosyl transferase  27.82 
 
 
379 aa  59.3  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3336  glycosyl transferase family protein  28.86 
 
 
1268 aa  59.7  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0620  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.14 
 
 
610 aa  58.9  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  32.48 
 
 
370 aa  58.9  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3142  glycosyl transferase family 2  26.67 
 
 
430 aa  58.9  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1565  glycosyl transferase family 2  20.32 
 
 
970 aa  58.9  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000603283  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4958  glycosyl transferase group 1  32 
 
 
419 aa  59.3  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3812  glycosyl transferase family 2  27.92 
 
 
307 aa  58.9  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0558  glycosyl transferase family 2  26.61 
 
 
279 aa  58.5  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.863042  normal  0.0344397 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4889  glycosyl transferase family 2  27.92 
 
 
307 aa  58.9  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0764718 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0757  glycosyl transferase family protein  28 
 
 
358 aa  58.9  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4524  glycosyl transferase family protein  27.12 
 
 
308 aa  58.9  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500037  normal  0.110607 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3017  glycosyl transferase group 1  30.28 
 
 
305 aa  58.5  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0580  glycosyl transferase, group 1  28.37 
 
 
417 aa  58.5  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3953  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 
374 aa  58.5  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0511  glycosyl transferase group 1  28.1 
 
 
381 aa  58.2  0.0000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  30.83 
 
 
414 aa  57.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1529  glycosyl transferase family 2  25.22 
 
 
748 aa  58.2  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0012  glycosyl transferase group 1  29.73 
 
 
458 aa  57.8  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1316  glycosyl transferase  22.1 
 
 
358 aa  57.8  0.0000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.255761  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0474  Glycosyltransferase-like protein  28.04 
 
 
310 aa  57.4  0.0000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.288189  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1130  glycosyl transferase group 1  27.86 
 
 
357 aa  57.4  0.0000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1744  glycosyl transferase, group 1  31.3 
 
 
343 aa  57.4  0.0000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  24.88 
 
 
528 aa  57.4  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  25.53 
 
 
2401 aa  57  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0610  glycosyl transferase group 1  36.11 
 
 
367 aa  56.6  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0358  glycosyl transferase group 1  26.15 
 
 
310 aa  56.6  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0154826  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  28.21 
 
 
426 aa  56.6  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2138  glycosyl transferase family 2  24.54 
 
 
311 aa  57  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4105  glycosyl transferase family 2  29.19 
 
 
317 aa  57  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.852576  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0591  glycosyl transferase, group 1  40.22 
 
 
373 aa  57  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.42077 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2305  glycosyl transferase family 2  26.61 
 
 
291 aa  57  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.064621 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12393  Glycosyl transferase, group 1  25.49 
 
 
336 aa  57  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4734  glycosyl transferase family protein  26.89 
 
 
294 aa  57  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0690  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 
385 aa  57  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.945195  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0411  glycosyl transferase group 1  29.31 
 
 
370 aa  55.8  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.482672  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>