More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3190 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3190  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
314 aa  622  1e-177  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.035048  hitchhiker  0.000201325 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0786  glycosyl transferase family protein  49.83 
 
 
345 aa  287  1e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0460061  normal  0.237559 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3947  glycosyltransferases-like  49.82 
 
 
303 aa  285  5e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.721107 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0566  glycosyltransferase-like  50.34 
 
 
327 aa  272  6e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.418965  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0372  glycosyl transferase family 2  41.81 
 
 
317 aa  219  5e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5481  glycosyl transferase family protein  32.76 
 
 
310 aa  106  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4524  glycosyl transferase family protein  30.72 
 
 
308 aa  102  7e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500037  normal  0.110607 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  24.38 
 
 
294 aa  95.1  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2949  glycosyl transferase family protein  28.69 
 
 
299 aa  95.1  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0842  hypothetical protein  23.62 
 
 
297 aa  94  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  25.97 
 
 
298 aa  93.2  5e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1388  glycosyl transferase family protein  29.39 
 
 
324 aa  92.8  6e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0619  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.45 
 
 
311 aa  92  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773869  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3990  glycosyl transferase family protein  29.01 
 
 
304 aa  92  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.965976 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0817  hypothetical protein  25.65 
 
 
297 aa  91.3  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  28.06 
 
 
312 aa  87  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1949  glycosyl transferase family protein  28.32 
 
 
308 aa  86.3  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.535237 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2391  glycosyl transferase family protein  39.87 
 
 
282 aa  85.9  7e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.337746  normal  0.474802 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5349  glycosyl transferase family protein  31.4 
 
 
314 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  28.35 
 
 
311 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  29 
 
 
360 aa  83.6  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0840  hypothetical protein  24.26 
 
 
296 aa  83.2  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4474  glycosyl transferase family 2  26.6 
 
 
290 aa  82.4  0.000000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0220  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
705 aa  82  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  31.3 
 
 
340 aa  82.4  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1063  glycosyl transferase family 2  30.66 
 
 
305 aa  80.9  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.862808  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3119  glycosyl transferase family protein  30.9 
 
 
282 aa  80.9  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  28.05 
 
 
340 aa  80.5  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  29.3 
 
 
329 aa  80.9  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4940  glycosyl transferase family protein  32.89 
 
 
336 aa  80.1  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  30.9 
 
 
299 aa  80.1  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4145  glycosyl transferase family protein  28.08 
 
 
334 aa  78.6  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.417391 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  27.04 
 
 
324 aa  77.8  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1273  glycosyl transferase family protein  27.84 
 
 
307 aa  77.8  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1576  glycosyl transferase family protein  28.33 
 
 
313 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  33.19 
 
 
401 aa  78.2  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3344  glycosyl transferase family protein  30.45 
 
 
274 aa  77.8  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.27907 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4703  glycosyl transferase family 2  27.97 
 
 
334 aa  76.6  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.261222  normal  0.175733 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2593  glycosyl transferase family protein  25.71 
 
 
333 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2407  glycosyl transferase family protein  28.83 
 
 
312 aa  75.9  0.0000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.116461  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4452  glycosyl transferase family 2  29.07 
 
 
320 aa  75.9  0.0000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07585  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.15 
 
 
379 aa  75.5  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.547919  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2344  glycosyl transferase family 2  31.22 
 
 
301 aa  75.1  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.415521  hitchhiker  0.0000247035 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0628  glycosyl transferase family protein  26.19 
 
 
306 aa  74.7  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3501  glycosyl transferase family 2  35.29 
 
 
310 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.222757  normal  0.064344 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3135  glycosyl transferase, putative  29.56 
 
 
318 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331017  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  27.35 
 
 
324 aa  73.9  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3624  glycosyl transferase family 2  34.62 
 
 
319 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.519026 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1044  b-glycosyltransferase  25.44 
 
 
652 aa  73.9  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00623044  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5877  glycosyl transferase family protein  30.51 
 
 
303 aa  73.9  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.191547  normal  0.690247 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2720  glycosyl transferase family protein  28.36 
 
 
318 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372811  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2579  glycosyl transferase family protein  29.56 
 
 
318 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  29.05 
 
 
841 aa  73.6  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1007  glycosyl transferase family protein  24.38 
 
 
336 aa  73.6  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0077  glycosyl transferase family protein  27.18 
 
 
287 aa  73.2  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3226  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
317 aa  73.2  0.000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4741  glycosyl transferase family protein  23.67 
 
 
308 aa  73.2  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  28.37 
 
 
1077 aa  73.2  0.000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0503  glycosyl transferase family protein  33.01 
 
 
290 aa  72.8  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0779995  normal  0.962073 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2355  glycosyltransferase  29.82 
 
 
320 aa  72.8  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1854  glycosyl transferase family 2  31.87 
 
 
307 aa  72  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4234  glycosyl transferase family protein  26.82 
 
 
310 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0220827  hitchhiker  0.000823038 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4989  glycosyl transferase family protein  21.29 
 
 
387 aa  71.6  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  26.22 
 
 
313 aa  71.2  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  26.83 
 
 
293 aa  70.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2933  family 2 glycosyl transferase  32.35 
 
 
284 aa  71.6  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.593138  normal  0.360179 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  32.87 
 
 
1340 aa  71.6  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3301  glycosyl transferase family protein  35.19 
 
 
319 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1213  glycosyl transferase family protein  27.84 
 
 
683 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2910  glycosyl transferase family protein  25.55 
 
 
318 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5292  glycosyl transferase family 2  23.55 
 
 
327 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6344  glycosyl transferase family 2  29.92 
 
 
822 aa  70.1  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0187449  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2729  glycosyl transferase family protein  30.19 
 
 
298 aa  70.5  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1773  glycosyl transferase family protein  29.49 
 
 
303 aa  70.5  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.314835  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1840  glycosyl transferase family 2  25.23 
 
 
324 aa  70.5  0.00000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.939946  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02692  glycosyl transferase  33.03 
 
 
279 aa  70.5  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  27.73 
 
 
283 aa  69.7  0.00000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  29.76 
 
 
838 aa  69.7  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2016  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 
322 aa  69.7  0.00000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.12313  normal  0.993196 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1320  glycosyl transferase family protein  32.86 
 
 
296 aa  69.7  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1337  glycosyl transferase family protein  32.86 
 
 
296 aa  69.7  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1356  glycosyl transferase family protein  32.86 
 
 
296 aa  69.7  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00877043  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1298  glycosyl transferase family protein  25.76 
 
 
289 aa  68.9  0.00000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  29.03 
 
 
306 aa  69.3  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2934  glycosyl transferase family 2  29.13 
 
 
378 aa  68.9  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607022  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  30.81 
 
 
841 aa  67.8  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0546  glycosyl transferase  30.09 
 
 
348 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483878  normal  0.249879 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  28.26 
 
 
836 aa  67.8  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1341  glycosyl transferase family 2  29.78 
 
 
272 aa  67.8  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000344524  normal  0.888688 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  28.66 
 
 
311 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1579  glycosyl transferase family protein  34.46 
 
 
318 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4605  glycosyl transferase family protein  25.93 
 
 
318 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.151832  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3771  glycosyl transferase family 2  23.77 
 
 
327 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.322166  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0736  glycosyl transferase family protein  30.31 
 
 
326 aa  67.4  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.59773 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0185  glycosyl transferase family 2  24.88 
 
 
305 aa  67.8  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0197048  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  25.56 
 
 
1435 aa  67  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1013  glycosyl transferase family 2  23.18 
 
 
334 aa  66.2  0.0000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302426  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0256  glycosyl transferase family 2  29.05 
 
 
334 aa  66.2  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0188043  normal  0.110004 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4735  glycosyl transferase family protein  28.14 
 
 
291 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.27688  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3719  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
327 aa  66.2  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>