More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0484 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0484  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 301 aa  606  9.999999999999999e-173  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.68216 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0353  glycosyl transferase family 2  36.49 
 
 		 354 aa  75.1  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  30.04 
 
 		 1120 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5020  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.9 
 
 		 390 aa  74.3  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.971161  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1530  glycosyltransferase  26.79 
 
 		 694 aa  70.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1816  glycosyl transferase family 2  31.07 
 
 		 333 aa  70.5  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0259  glycosyl transferase family protein  37.82 
 
 		 658 aa  68.9  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01024  predicted glycosyl transferase  37.25 
 
 		 441 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2621  glycosyl transferase family 2  37.25 
 
 		 441 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.252252  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1651  glycosyl transferase family protein  36.29 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  35.54 
 
 		 403 aa  67.8  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1264  N-glycosyltransferase  37.25 
 
 		 412 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.498109 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1142  N-glycosyltransferase  37.25 
 
 		 441 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01031  hypothetical protein  37.25 
 
 		 441 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1137  N-glycosyltransferase  37.25 
 
 		 441 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0308707  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2574  N-glycosyltransferase  33.33 
 
 		 412 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0472996 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  24.58 
 
 		 752 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3399  glycosyl transferase, group 1  25.78 
 
 		 379 aa  68.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05330  Glycosyl transferase, family 2  28.99 
 
 		 383 aa  67.8  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0200039  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4777  glycosyl transferase family 2  28.4 
 
 		 393 aa  66.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.340207 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2293  N-glycosyltransferase  32.8 
 
 		 412 aa  66.6  0.0000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00369291  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  26.98 
 
 		 1115 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0149  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  26.25 
 
 		 397 aa  65.9  0.0000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.15168  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  27.44 
 
 		 872 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3181  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 318 aa  65.5  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2368  glycosyl transferase family protein  33.88 
 
 		 378 aa  65.1  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2690  N-glycosyltransferase  33.61 
 
 		 399 aa  65.1  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.769195  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2747  N-glycosyltransferase  33.61 
 
 		 399 aa  65.1  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2718  N-glycosyltransferase  30.17 
 
 		 418 aa  65.5  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0472  glycosyl transferase family protein  24.39 
 
 		 365 aa  65.5  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1438  glycosyl transferase family 2  37.25 
 
 		 213 aa  64.7  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.192606  normal  0.0852028 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  26.98 
 
 		 927 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  26.98 
 
 		 1115 aa  64.3  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  26.98 
 
 		 1119 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  31.08 
 
 		 1118 aa  64.7  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  26.98 
 
 		 1115 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4841  N-glycosyltransferase  32.5 
 
 		 425 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3764  N-glycosyltransferase  32.5 
 
 		 425 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.142501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  32.5 
 
 		 428 aa  63.9  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4484  N-glycosyltransferase  33.33 
 
 		 423 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.230285  normal  0.930554 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10838  putative glycosyltransferase  32.23 
 
 		 480 aa  63.2  0.000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0787082  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1549  glycosyl transferase family protein  38 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1593  glycosyl transferase family protein  35.25 
 
 		 425 aa  62.8  0.000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.901855  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  28.3 
 
 		 1124 aa  62.4  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04326  N-glycosyltransferase  29.37 
 
 		 417 aa  62.4  0.000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.780445  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3877  glycosyl transferase family 2  24.53 
 
 		 393 aa  62  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.148656  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0288  N-glycosyltransferase  32.54 
 
 		 424 aa  62  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.393224  normal  0.0606217 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2496  glycosyltransferase  30.23 
 
 		 313 aa  62.4  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00712188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  26.15 
 
 		 1115 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1385  glycosyl transferase family 2  31.71 
 
 		 319 aa  62  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3583  glycosyl transferase family protein  24.29 
 
 		 395 aa  62  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0179  N-glycosyltransferase  32.54 
 
 		 451 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.574055  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3947  glycosyl transferase family 2  36.36 
 
 		 445 aa  61.2  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3996  N-glycosyltransferase  31.67 
 
 		 423 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.706651  normal  0.0922124 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3513  N-glycosyltransferase  31.67 
 
 		 423 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1880  glycosyl transferase family 2  25.44 
 
 		 325 aa  60.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00309208 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23431  glycosyl transferase family protein  29.46 
 
 		 342 aa  60.8  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1942  N-glycosyltransferase  31.67 
 
 		 423 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3690  glycosyl transferase family 2  31.15 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.349905  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1005  glycosyl transferase family protein  25.98 
 
 		 344 aa  60.5  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3862  glycosyl transferase family 2  23.3 
 
 		 403 aa  60.1  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.245073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 		 374 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1375  glycosyl transferase family 2  31.4 
 
 		 433 aa  60.5  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3421  N-glycosyltransferase  32.5 
 
 		 423 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.543844  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2470  glycosyl transferase family 2  30.29 
 
 		 801 aa  59.7  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4264  N-glycosyltransferase  32.5 
 
 		 423 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.219891  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1578  glycosyl transferase family 2  41.67 
 
 		 336 aa  60.1  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.854379999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4102  N-glycosyltransferase  32.5 
 
 		 423 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0468214  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17011  glycosyl transferase family protein  38.54 
 
 		 320 aa  59.7  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.553457  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1890  glycosyl transferase family protein  36.84 
 
 		 443 aa  59.7  0.00000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0404  glycosyl transferase family 2  27.64 
 
 		 320 aa  59.7  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0210127 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0228  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.64 
 
 		 320 aa  59.7  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.421511  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2016  glycosyl transferase family protein  29.33 
 
 		 378 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1041  glycosyl transferase family protein  26.02 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0213116 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1777  glycosyl transferase family 2  27.18 
 
 		 802 aa  59.3  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1807  glycosyl transferase family 2  32.2 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0930  glycosyl transferase family protein  27.69 
 
 		 351 aa  59.3  0.00000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.569667  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3117  glycosyl transferase family 2  30.4 
 
 		 315 aa  59.3  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.199374 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2008  glycosyl transferase family protein  25.34 
 
 		 379 aa  58.9  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2639  glycosyl transferase family protein  32.52 
 
 		 375 aa  58.5  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4840  hyaluronan synthase  30.58 
 
 		 478 aa  58.5  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.55692  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1742  glycosyltransferase  25.43 
 
 		 281 aa  58.5  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00465779  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2239  N-glycosyltransferase  32.5 
 
 		 444 aa  58.5  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.423629  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0506  glycosyl transferase  29.01 
 
 		 332 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641026  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  34.96 
 
 		 1099 aa  58.2  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2143  N-glycosyltransferase  32.5 
 
 		 444 aa  58.5  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.382592  normal  0.0135691 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2129  N-glycosyltransferase  32.5 
 
 		 444 aa  58.5  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.772993  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4608  N-glycosyltransferase  32.5 
 
 		 442 aa  58.9  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2585  glycosyl transferase family protein  32.52 
 
 		 375 aa  58.5  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1351  glycosyl transferase family protein  28.08 
 
 		 362 aa  58.5  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1980  glycosyl transferase family protein  29.69 
 
 		 323 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  32.79 
 
 		 373 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1832  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  36.04 
 
 		 327 aa  57.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1551  glycosyl transferase family 2  30.53 
 
 		 324 aa  58.2  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000748201  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1989  glycosyl transferase family protein  26.83 
 
 		 320 aa  58.2  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.151695  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1727  glycosyl transferase family 2  32.79 
 
 		 689 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.158076 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2925  N-glycosyltransferase  30.83 
 
 		 421 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.27332  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1772  putative glycosyltransferase transmembrane protein  29.69 
 
 		 347 aa  58.2  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.437602  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4287  N-glycosyltransferase  35.42 
 
 		 442 aa  58.2  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2535  glycosyl transferase family 2  32.54 
 
 		 410 aa  57.8  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>