32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5025 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5025  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 408 aa  795    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1589  glycosyl transferase family protein  35.68 
 
 		 380 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0747672  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1540  glycosyl transferase family protein  34.73 
 
 		 380 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0303814  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0071  glycosyl transferase family protein  26.23 
 
 		 393 aa  125  2e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0186  glycosyl transferase family protein  25.65 
 
 		 404 aa  123  5e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.236135  normal  0.752498 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1138  hypothetical protein  30.47 
 
 		 352 aa  73.9  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1919  glycosylase-like protein  27.62 
 
 		 1178 aa  65.5  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2964  hypothetical protein  27.68 
 
 		 410 aa  63.5  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.931605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3098  hypothetical protein  33.83 
 
 		 410 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2999  hypothetical protein  33.83 
 
 		 407 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3199  hypothetical protein  32.58 
 
 		 410 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.235198  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0184  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.03 
 
 		 249 aa  52  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0888944  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1566  cell wall membrane glycosyltransferase  28.02 
 
 		 314 aa  48.5  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.901523  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2187  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  29.64 
 
 		 319 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.442863  normal  0.431936 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1732  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  29.73 
 
 		 321 aa  46.6  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.14375  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2422  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  26.17 
 
 		 244 aa  46.2  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000393147  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0151  histidinol-phosphate phosphatase family protein  29.95 
 
 		 410 aa  45.1  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2588  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.08 
 
 		 245 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0786175 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4508  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  29.67 
 
 		 319 aa  45.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0837  glycosyl transferase family 2  26.51 
 
 		 253 aa  44.7  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0221  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  26.15 
 
 		 260 aa  44.7  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.746242  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1730  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  26.47 
 
 		 326 aa  44.3  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.645559  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1592  glycosyl transferase family protein  29.65 
 
 		 346 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4235  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  29.88 
 
 		 334 aa  43.5  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.362311 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4005  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  29.88 
 
 		 334 aa  43.5  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0113294  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4079  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  29.88 
 
 		 334 aa  43.5  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.414972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2044  glycosyl transferase family 2  26.58 
 
 		 230 aa  43.5  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.462866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5100  glycosyl transferase family 2  19.34 
 
 		 247 aa  43.1  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.764594 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0217  glycosyl transferase family protein  25.36 
 
 		 283 aa  43.1  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.860122  normal  0.275888 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2350  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.7 
 
 		 248 aa  43.1  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000669631  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0483  hypothetical protein  24.59 
 
 		 247 aa  43.1  0.01  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3630  glycosyl transferase family 2  37.61 
 
 		 386 aa  42.7  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0987324  normal  0.0592371 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>