36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1938 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1938  Levansucrase  100 
 
 
436 aa  885    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2488  glycoside hydrolase family 68  65.78 
 
 
471 aa  532  1e-150  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.266603  normal  0.590215 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4097  Beta-fructofuranosidase  49.75 
 
 
451 aa  372  1e-102  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3405  Beta-fructofuranosidase  37.68 
 
 
473 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.83791 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0964  levansucrase  37.6 
 
 
385 aa  199  5e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2103  levansucrase  34.8 
 
 
415 aa  199  7e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.962759  decreased coverage  0.00209256 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2305  levansucrase  34.49 
 
 
415 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.237725  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1453  levansucrase  34.8 
 
 
431 aa  197  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0118885  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0032  levansucrase  34.8 
 
 
431 aa  197  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.49796  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0754  levansucrase  34.57 
 
 
431 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1879  levansucrase  40.11 
 
 
377 aa  185  1.0000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4096  levansucrase  32.85 
 
 
527 aa  167  5e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0480075  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4270  levansucrase  32.85 
 
 
527 aa  167  5e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.169981  normal  0.334375 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3247  levansucrase  32.61 
 
 
527 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.36332  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0405  levansucrase  31.57 
 
 
522 aa  163  6e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2021  levansucrase  32.49 
 
 
534 aa  160  3e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00566302  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6047  levansucrase  32.54 
 
 
531 aa  160  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.0000000164133  hitchhiker  0.00000266409 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4171  levansucrase  32.61 
 
 
526 aa  160  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0733922  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3698  levansucrase  32.61 
 
 
526 aa  160  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.468514  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0616  Levansucrase  30.7 
 
 
532 aa  159  7e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.161634 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1872  levansucrase  32.84 
 
 
509 aa  159  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1010  levansucrase  32.59 
 
 
494 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.450168  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0735  levansucrase  32.59 
 
 
494 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1984  levansucrase  32.59 
 
 
494 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0714  levansucrase  32.59 
 
 
494 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0822  levansucrase  32.59 
 
 
494 aa  156  6e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2102  levansucrase precursor  32.59 
 
 
521 aa  156  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0466  levansucrase  32.59 
 
 
521 aa  156  6e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1531  Levansucrase  29.83 
 
 
584 aa  150  5e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.515752  normal  0.219322 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6116  levansucrase  30.06 
 
 
531 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.116097 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1409  hypothetical protein  27.25 
 
 
1009 aa  114  4.0000000000000004e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1410  hypothetical protein  29.59 
 
 
1025 aa  110  3e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1411  hypothetical protein  25.97 
 
 
1002 aa  97.1  6e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1363  glycosyl hydrolase family 32 protein  31.06 
 
 
331 aa  54.3  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0630715  normal  0.119414 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7054  glycosyl hydrolase family 32 protein  28.91 
 
 
347 aa  51.6  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0229  glycosyl hydrolase family 32 protein  28.29 
 
 
330 aa  49.3  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>