10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3449 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3449  hypothetical protein  100 
 
 		 491 aa  992    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00830472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2886  hypothetical protein  33.01 
 
 		 467 aa  191  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.742312 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4095  hypothetical protein  33.01 
 
 		 467 aa  191  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.375722 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0555  laminin G, domain-containing 2  30.98 
 
 		 1597 aa  53.5  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3871  laminin G, domain-containing 2  31.97 
 
 		 1159 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0201  laminin G, domain-containing 2  30.72 
 
 		 793 aa  50.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.317242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3193  hypothetical protein  36.14 
 
 		 331 aa  49.7  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2674  hypothetical protein  36.14 
 
 		 361 aa  48.5  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2244  hypothetical protein  37.84 
 
 		 132 aa  46.2  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.205917  hitchhiker  0.0000920842 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3863  laminin G, domain-containing 2  40.7 
 
 		 1708 aa  46.6  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.389258 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>