More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2678 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2678  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 		 227 aa  458  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0792  MotA/TolQ/ExbB proton channel  99.12 
 
 		 227 aa  455  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0725  protein TolQ  86.96 
 
 		 230 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.750364  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0681  protein TolQ  86.52 
 
 		 230 aa  398  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.458824  normal  0.677661 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0732  TOLQ-like transport transmembrane protein  86.09 
 
 		 230 aa  377  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.682761 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1376  tolQ protein  80 
 
 		 225 aa  360  9e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0482994  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3200  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  79.56 
 
 		 225 aa  358  4e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.949255  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3238  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  79.56 
 
 		 225 aa  358  4e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.923457  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1946  tolQ protein  79.56 
 
 		 225 aa  358  4e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2078  tolQ protein  79.56 
 
 		 225 aa  358  4e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0830  tolQ protein  79.56 
 
 		 225 aa  358  4e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2664  tolQ protein  79.56 
 
 		 225 aa  358  4e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3253  tolQ protein  80.27 
 
 		 262 aa  358  4e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2584  protein TolQ  79.11 
 
 		 225 aa  347  1e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.922054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0697  protein TolQ  78.67 
 
 		 225 aa  345  4e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.772794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0680  MotA/TolQ/ExbB proton channel  78.67 
 
 		 242 aa  345  4e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646362  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3892  MotA/TolQ/ExbB proton channel  78.22 
 
 		 246 aa  344  7e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0320  MotA/TolQ/ExbB proton channel  78.51 
 
 		 225 aa  343  8.999999999999999e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0772  protein TolQ  78.51 
 
 		 225 aa  343  8.999999999999999e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.265235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0803  MotA/TolQ/ExbB proton channel  78.51 
 
 		 225 aa  343  8.999999999999999e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424281  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0762  protein TolQ  80.44 
 
 		 225 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167492  normal  0.258035 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2452  protein TolQ  81.61 
 
 		 225 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3917  biopolymer MotA/TolQ/ExbB proton channel family transporter  80.44 
 
 		 225 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.22506  normal  0.159351 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4056  MotA/TolQ/ExbB proton channel  71.11 
 
 		 225 aa  326  2.0000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0785  protein TolQ  70.54 
 
 		 222 aa  313  9.999999999999999e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0555571  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2717  MotA/TolQ/ExbB proton channel  66.37 
 
 		 228 aa  301  5.000000000000001e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.169266  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2954  transmembrane protein/ biopolymer transport  67.12 
 
 		 227 aa  294  7e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0172322  normal  0.721905 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0278  MotA/TolQ/ExbB proton channel  68.47 
 
 		 218 aa  290  2e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.145562  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0306  protein TolQ  68.16 
 
 		 218 aa  289  2e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0846201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2342  MotA/TolQ/ExbB proton channel  64.6 
 
 		 224 aa  287  7e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.348836  normal  0.105576 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2209  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  62.11 
 
 		 231 aa  279  2e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00714084 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2227  MotA/TolQ/ExbB proton channel  64.09 
 
 		 233 aa  278  4e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260682  hitchhiker  0.000349255 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2922  MotA/TolQ/ExbB proton channel  62.9 
 
 		 230 aa  277  7e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2941  protein TolQ  62.9 
 
 		 236 aa  274  7e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1157  MotA/TolQ/ExbB proton channel  63.35 
 
 		 230 aa  268  7e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.550239  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2672  MotA/TolQ/ExbB proton channel  63.35 
 
 		 230 aa  268  7e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.866778  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2771  MotA/TolQ/ExbB proton channel  64.09 
 
 		 233 aa  262  2e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.978169 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2463  protein TolQ  60.27 
 
 		 234 aa  263  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0263661  normal  0.458025 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2261  protein TolQ  64.09 
 
 		 233 aa  262  2e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.267713  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2890  MotA/TolQ/ExbB proton channel  61.54 
 
 		 230 aa  261  4e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4794  MotA/TolQ/ExbB proton channel  63.64 
 
 		 235 aa  260  1e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.108923  normal  0.0322253 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3115  protein TolQ  61.09 
 
 		 240 aa  258  7e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.168396  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0245  MotA/TolQ/ExbB proton channel  57.73 
 
 		 235 aa  253  1.0000000000000001e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2232  TolQ protein  56.88 
 
 		 228 aa  241  3.9999999999999997e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1226  tolQ protein  55.66 
 
 		 225 aa  239  2e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.369592  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0563  protein TolQ  55.71 
 
 		 230 aa  238  8e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.533269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2214  MotA/TolQ/ExbB proton channel  55.61 
 
 		 232 aa  237  9e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0142  MotA/TolQ/ExbB proton channel  56.56 
 
 		 225 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1274  MotA/TolQ/ExbB proton channel  55.3 
 
 		 231 aa  230  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232758  normal  0.304845 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1895  TolQ protein, inner membrane component  52.04 
 
 		 228 aa  229  3e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2734  protein TolQ  52.29 
 
 		 229 aa  228  4e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.252045  hitchhiker  0.000106629 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2371  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.83 
 
 		 228 aa  227  1e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00211275  normal  0.155674 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2541  protein TolQ  50.92 
 
 		 228 aa  226  2e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000245733  hitchhiker  0.00000309411 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1782  protein TolQ  50.92 
 
 		 228 aa  226  2e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000921899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1739  Tol-Pal system TolQ  50.92 
 
 		 228 aa  226  2e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000243293  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4539  TolQ protein  52.21 
 
 		 231 aa  226  3e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51750  TolQ protein  52.21 
 
 		 231 aa  226  3e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.438505  hitchhiker  0.0000223597 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1728  tolQ protein  50.45 
 
 		 228 aa  225  4e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2532  peptidase A8, signal peptidase II  53.64 
 
 		 231 aa  225  4e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00489789  normal  0.411252 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2534  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.38 
 
 		 228 aa  225  4e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101898  normal  0.114902 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.38 
 
 		 228 aa  225  4e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000858501  normal  0.237078 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.46 
 
 		 228 aa  224  7e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000915639  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1604  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.38 
 
 		 228 aa  224  8e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00156809  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1219  biopolymer transport protein TolQ  52.94 
 
 		 231 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.712744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2191  Tol-Pal system TolQ  52.07 
 
 		 226 aa  223  2e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000779627  normal  0.358656 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3975  tolQ protein  52.49 
 
 		 231 aa  223  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0234616  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1412  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.49 
 
 		 231 aa  223  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0108204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4405  MotA/TolQ/ExbB proton channel  54.46 
 
 		 221 aa  223  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0344768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1248  Tol-Pal system, TolQ  52.94 
 
 		 231 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.216384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3996  protein TolQ  52.94 
 
 		 231 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4199  protein TolQ  52.94 
 
 		 231 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.40323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.92 
 
 		 229 aa  223  2e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00757308  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1854  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.92 
 
 		 229 aa  221  4.9999999999999996e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0235502  normal  0.794171 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1391  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.46 
 
 		 229 aa  221  4.9999999999999996e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000787618  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01607  hypothetical protein  51.13 
 
 		 232 aa  221  6e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1524  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.46 
 
 		 229 aa  221  7e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0123133  normal  0.884869 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2751  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  51.38 
 
 		 228 aa  221  8e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02687  tolQ protein  54.34 
 
 		 229 aa  220  9.999999999999999e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000858548  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0895  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.62 
 
 		 229 aa  219  3e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000627927  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2567  Tol-Pal system TolQ  50 
 
 		 229 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576197  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1432  tolQ protein  52.02 
 
 		 227 aa  218  5e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000136252  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1153  colicin uptake protein TolQ  50.46 
 
 		 228 aa  218  7e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1235  colicin uptake protein TolQ  51.15 
 
 		 227 aa  218  7.999999999999999e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0719257  normal  0.246715 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2905  colicin uptake protein TolQ  50.46 
 
 		 228 aa  216  2e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.045905  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1394  colicin uptake protein TolQ  50.46 
 
 		 228 aa  216  2e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00123539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2871  colicin uptake protein TolQ  50.46 
 
 		 228 aa  216  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018196  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1702  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.07 
 
 		 229 aa  216  2.9999999999999998e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0354123  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1246  colicin uptake protein TolQ  49.54 
 
 		 228 aa  215  4e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0152271  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0724  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.36 
 
 		 227 aa  214  9e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.49682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1276  colicin uptake protein TolQ  50.23 
 
 		 224 aa  213  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000244479  hitchhiker  0.000166082 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3090  colicin uptake protein TolQ  49.54 
 
 		 228 aa  214  9.999999999999999e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0237739  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2942  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.15 
 
 		 236 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000153109  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0413  TolQ  49.77 
 
 		 237 aa  213  1.9999999999999998e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0635098  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0064  TolQ protein  50 
 
 		 233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0296877  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1761  TolQ protein  49.77 
 
 		 237 aa  213  1.9999999999999998e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2959  colicin uptake protein TolQ  50.23 
 
 		 225 aa  213  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0410151  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0065  protein TolQ  50 
 
 		 233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.566643  normal  0.905632 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36670  TolQ proton channel  53.92 
 
 		 231 aa  211  7e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0994349  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0533  protein TolQ  51.58 
 
 		 225 aa  208  5e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.331397  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0760  colicin uptake protein TolQ  50.92 
 
 		 230 aa  206  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000115881  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>