58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0510 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0510  glycoside hydrolase family 43  100 
 
 		 456 aa  910    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0180422  hitchhiker  0.00320544 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1729  glycoside hydrolase family 43  39.89 
 
 		 472 aa  247  3e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.101805  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0015  alpha-L-arabinofuranosidase B  28.04 
 
 		 707 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2809  ATPase  29.36 
 
 		 789 aa  129  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153749  decreased coverage  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1623  glycoside hydrolase family 43  26.82 
 
 		 804 aa  127  4.0000000000000003e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0299424  normal  0.680345 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2732  glycoside hydrolase family 43  30.03 
 
 		 315 aa  124  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1976  glycoside hydrolase family protein  26.89 
 
 		 1121 aa  124  4e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00565193  hitchhiker  0.00420486 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0637  glycoside hydrolase family protein  27.58 
 
 		 471 aa  123  6e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000622549  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1999  glycoside hydrolase family protein  26.77 
 
 		 1121 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000101187  decreased coverage  0.0000000170847 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0662  glycoside hydrolase family protein  27.75 
 
 		 471 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000191922  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2047  glycoside hydrolase family protein  27.25 
 
 		 1112 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000114958  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2086  beta-xylosidase-like protein  26.51 
 
 		 1121 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00280414  decreased coverage  0.0000000469917 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1543  beta-xylosidase  28.07 
 
 		 531 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000200892  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3292  glycoside hydrolase family 43  28.93 
 
 		 488 aa  113  8.000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.223704  hitchhiker  0.00299224 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2813  glycoside hydrolase family 43  31.9 
 
 		 331 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257715  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1622  glycoside hydrolase family 43  27.53 
 
 		 703 aa  110  4.0000000000000004e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.372812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1393  immunoglobulin I-set domain-containing protein  28.69 
 
 		 810 aa  109  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0639  glycoside hydrolase family protein  25.55 
 
 		 475 aa  109  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000370471  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0664  glycoside hydrolase family protein  25.55 
 
 		 476 aa  108  3e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29390  beta-xylosidase  28.12 
 
 		 494 aa  105  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.838648  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0786  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  27.3 
 
 		 346 aa  105  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141301  normal  0.447167 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3750  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  29.01 
 
 		 319 aa  104  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00407758  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2201  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  30.21 
 
 		 343 aa  103  6e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1390  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  27.89 
 
 		 341 aa  99.8  8e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal  0.664348 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2728  hypothetical protein  25.71 
 
 		 848 aa  99.4  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2051  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  27.57 
 
 		 357 aa  97.8  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0989  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  33.74 
 
 		 334 aa  96.7  8e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0127699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2156  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  27.99 
 
 		 352 aa  95.9  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000116592  hitchhiker  0.00999646 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2082  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  27.62 
 
 		 356 aa  95.1  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000230744  hitchhiker  0.000000189943 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3317  Beta-xylosidase-like  26.15 
 
 		 1174 aa  94.7  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00018095  hitchhiker  0.000000702951 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04520  beta-xylosidase  29.38 
 
 		 491 aa  94.4  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.130696  normal  0.0670778 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1980  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  27.33 
 
 		 355 aa  93.2  8e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000532018  hitchhiker  0.000349844 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1995  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  27.03 
 
 		 355 aa  93.2  9e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000026265  hitchhiker  0.0000968585 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0516  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  29.38 
 
 		 366 aa  91.7  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000112186  decreased coverage  0.000226611 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2161  glycoside hydrolase family protein  24.67 
 
 		 1143 aa  91.3  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000526501  hitchhiker  0.0000457644 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3403  glycoside hydrolase family 43  27.54 
 
 		 357 aa  90.5  6e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000194853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  26.09 
 
 		 537 aa  83.2  0.000000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4703  glycoside hydrolase family 43  26.13 
 
 		 341 aa  83.2  0.000000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.184013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0078  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  28.27 
 
 		 379 aa  82.4  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.144884  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1542  beta-xylosidase  25.97 
 
 		 581 aa  82  0.00000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0179  cellulose-binding family II  30.2 
 
 		 598 aa  81.6  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318302 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  27.33 
 
 		 699 aa  82  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  26.79 
 
 		 510 aa  78.6  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03044  Endo-arabinanase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFU2]  28.68 
 
 		 386 aa  78.2  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4284  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  25.46 
 
 		 327 aa  78.2  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1014  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  26.32 
 
 		 472 aa  71.2  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  25 
 
 		 503 aa  66.6  0.0000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08007  Endo-alpha-1,5-arabinanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AUM3]  26.95 
 
 		 320 aa  65.5  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.766445 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0473  glycoside hydrolase family 43  26.42 
 
 		 829 aa  65.5  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658009  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02534  endoarabinanase (Eurofung)  25.29 
 
 		 380 aa  60.8  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0507  glycoside hydrolase family 43  25.33 
 
 		 337 aa  57  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.412329 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6081  glycoside hydrolase family 43  26.09 
 
 		 480 aa  53.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06352  Endo-alpha-1,5-L-arabinanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AZC8]  24.38 
 
 		 400 aa  50.1  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.605603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  23.81 
 
 		 315 aa  49.3  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  25.82 
 
 		 304 aa  47  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0753  glycoside hydrolase family protein  24.26 
 
 		 465 aa  46.6  0.0009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  29.25 
 
 		 524 aa  44.7  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0700  glycoside hydrolase family 43  26.94 
 
 		 522 aa  44.7  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>