77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6081 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6081  glycoside hydrolase family 43  100 
 
 		 480 aa  977    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2732  glycoside hydrolase family 43  35.79 
 
 		 315 aa  145  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2813  glycoside hydrolase family 43  34.27 
 
 		 331 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257715  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0516  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  34.84 
 
 		 366 aa  132  2.0000000000000002e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000112186  decreased coverage  0.000226611 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04520  beta-xylosidase  32.18 
 
 		 491 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.130696  normal  0.0670778 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2201  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  35.12 
 
 		 343 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2082  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  29.39 
 
 		 356 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000230744  hitchhiker  0.000000189943 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4284  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  29.32 
 
 		 327 aa  121  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1980  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  29.39 
 
 		 355 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000532018  hitchhiker  0.000349844 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3750  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  31.72 
 
 		 319 aa  120  4.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00407758  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1390  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  29.41 
 
 		 341 aa  120  4.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal  0.664348 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2156  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  29.61 
 
 		 352 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000116592  hitchhiker  0.00999646 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1995  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  29.39 
 
 		 355 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000026265  hitchhiker  0.0000968585 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0179  cellulose-binding family II  34.85 
 
 		 598 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318302 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2051  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  30.26 
 
 		 357 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0786  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  28.48 
 
 		 346 aa  112  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141301  normal  0.447167 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0989  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  34.35 
 
 		 334 aa  106  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0127699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0078  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  31 
 
 		 379 aa  99  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.144884  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3403  glycoside hydrolase family 43  29.32 
 
 		 357 aa  97.4  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000194853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1014  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  30.3 
 
 		 472 aa  90.9  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  25.88 
 
 		 503 aa  87.4  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1729  glycoside hydrolase family 43  28.75 
 
 		 472 aa  81.3  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.101805  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4703  glycoside hydrolase family 43  25 
 
 		 341 aa  80.9  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.184013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  24.61 
 
 		 537 aa  75.9  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  23.68 
 
 		 510 aa  73.9  0.000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1976  glycoside hydrolase family protein  27.62 
 
 		 1121 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00565193  hitchhiker  0.00420486 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  27.78 
 
 		 699 aa  73.2  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1999  glycoside hydrolase family protein  27.62 
 
 		 1121 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000101187  decreased coverage  0.0000000170847 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2086  beta-xylosidase-like protein  27.33 
 
 		 1121 aa  72  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00280414  decreased coverage  0.0000000469917 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1543  beta-xylosidase  25.49 
 
 		 531 aa  72  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000200892  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03044  Endo-arabinanase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFU2]  27.32 
 
 		 386 aa  70.9  0.00000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2047  glycoside hydrolase family protein  26.98 
 
 		 1112 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000114958  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0473  glycoside hydrolase family 43  29.91 
 
 		 829 aa  69.7  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0662  glycoside hydrolase family protein  29.09 
 
 		 471 aa  65.1  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000191922  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0737  glycoside hydrolase family protein  24.08 
 
 		 345 aa  64.7  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612706  normal  0.340405 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08007  Endo-alpha-1,5-arabinanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AUM3]  28.48 
 
 		 320 aa  63.2  0.000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.766445 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2809  ATPase  28.23 
 
 		 789 aa  63.5  0.000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153749  decreased coverage  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0637  glycoside hydrolase family protein  30 
 
 		 471 aa  60.8  0.00000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000622549  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29390  beta-xylosidase  38.39 
 
 		 494 aa  60.1  0.00000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.838648  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1393  immunoglobulin I-set domain-containing protein  25.08 
 
 		 810 aa  59.7  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3438  glycoside hydrolase family 43  27.1 
 
 		 519 aa  58.9  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990127  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3317  Beta-xylosidase-like  33.58 
 
 		 1174 aa  57.4  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00018095  hitchhiker  0.000000702951 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2161  glycoside hydrolase family protein  29.59 
 
 		 1143 aa  57  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000526501  hitchhiker  0.0000457644 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0510  glycoside hydrolase family 43  24.71 
 
 		 456 aa  57  0.0000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0180422  hitchhiker  0.00320544 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3048  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.5 
 
 		 515 aa  56.2  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0608814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4289  glycoside hydrolase family protein  29.27 
 
 		 572 aa  55.8  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.786059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03855  xylosidase; arabinosidase  30.43 
 
 		 556 aa  55.1  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02534  endoarabinanase (Eurofung)  28.46 
 
 		 380 aa  55.1  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0639  glycoside hydrolase family protein  31.58 
 
 		 475 aa  55.1  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000370471  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06352  Endo-alpha-1,5-L-arabinanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AZC8]  29.27 
 
 		 400 aa  54.7  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.605603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0664  glycoside hydrolase family protein  31.58 
 
 		 476 aa  53.9  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3292  glycoside hydrolase family 43  25.29 
 
 		 488 aa  53.9  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.223704  hitchhiker  0.00299224 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1542  beta-xylosidase  30 
 
 		 581 aa  53.1  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0015  alpha-L-arabinofuranosidase B  26.61 
 
 		 707 aa  52.8  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3351  glycoside hydrolase family 43  29.61 
 
 		 522 aa  52.8  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1423  Xylan 1,4-beta-xylosidase  26.27 
 
 		 558 aa  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.423704 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0700  glycoside hydrolase family 43  28.57 
 
 		 522 aa  51.6  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20520  beta-xylosidase  26.59 
 
 		 542 aa  51.6  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129044  normal  0.254652 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1623  glycoside hydrolase family 43  33.33 
 
 		 804 aa  50.8  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0299424  normal  0.680345 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0935  glycoside hydrolase family 43  28.57 
 
 		 522 aa  51.2  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2728  hypothetical protein  26.19 
 
 		 848 aa  50.8  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1622  glycoside hydrolase family 43  33.91 
 
 		 703 aa  50.4  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.372812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1150  glycoside hydrolase family 43  26.53 
 
 		 560 aa  48.1  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1616  alpha-L-arabinofuranosidase  31.15 
 
 		 550 aa  46.6  0.0009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6044  glycoside hydrolase family 43  23.83 
 
 		 501 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.845022  normal  0.0554344 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0501  glycoside hydrolase family 43  29.09 
 
 		 525 aa  46.2  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0289  xylan 1,4-beta-xylosidase  28.74 
 
 		 532 aa  46.2  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000021727  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2632  glycoside hydrolase family protein  25.6 
 
 		 543 aa  46.2  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0211688  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2114  glycoside hydrolase family 43  31.33 
 
 		 518 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.554254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0507  glycoside hydrolase family 43  23.86 
 
 		 337 aa  44.7  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.412329 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3109  glycoside hydrolase family protein  30.83 
 
 		 644 aa  44.7  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3334  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.27 
 
 		 536 aa  44.7  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.783434  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  28.7 
 
 		 345 aa  44.3  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4681  glycoside hydrolase family protein  26.14 
 
 		 492 aa  44.3  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.026787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3228  glycoside hydrolase family protein  28.8 
 
 		 563 aa  43.9  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00674596  normal  0.0120766 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0430  glycoside hydrolase family 43  26.91 
 
 		 497 aa  43.5  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.710686 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2318  alpha-N-arabinofuranosidase  26.77 
 
 		 512 aa  43.5  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.249416 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>