82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0078 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0078  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  100 
 
 		 379 aa  761    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.144884  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2201  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  44.63 
 
 		 343 aa  199  9e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2732  glycoside hydrolase family 43  41 
 
 		 315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2813  glycoside hydrolase family 43  41.95 
 
 		 331 aa  186  4e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257715  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0179  cellulose-binding family II  39.26 
 
 		 598 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318302 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4284  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  37.46 
 
 		 327 aa  183  5.0000000000000004e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2156  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  35.29 
 
 		 352 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000116592  hitchhiker  0.00999646 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3750  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  41.12 
 
 		 319 aa  181  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00407758  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1995  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  32.71 
 
 		 355 aa  177  3e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000026265  hitchhiker  0.0000968585 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0989  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  47.23 
 
 		 334 aa  175  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0127699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2051  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  36.93 
 
 		 357 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1980  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  36.16 
 
 		 355 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000532018  hitchhiker  0.000349844 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2082  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  36.16 
 
 		 356 aa  171  1e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000230744  hitchhiker  0.000000189943 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0786  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  35.5 
 
 		 346 aa  170  4e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141301  normal  0.447167 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1390  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  37.7 
 
 		 341 aa  166  8e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal  0.664348 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0516  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  38.44 
 
 		 366 aa  164  3e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000112186  decreased coverage  0.000226611 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04520  beta-xylosidase  37.88 
 
 		 491 aa  161  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.130696  normal  0.0670778 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1014  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  36.86 
 
 		 472 aa  149  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194163  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02534  endoarabinanase (Eurofung)  34.23 
 
 		 380 aa  130  4.0000000000000003e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08007  Endo-alpha-1,5-arabinanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AUM3]  32.57 
 
 		 320 aa  121  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.766445 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1729  glycoside hydrolase family 43  29.92 
 
 		 472 aa  119  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.101805  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06352  Endo-alpha-1,5-L-arabinanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AZC8]  28.15 
 
 		 400 aa  117  3e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.605603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  31.88 
 
 		 537 aa  108  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4703  glycoside hydrolase family 43  30.45 
 
 		 341 aa  108  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.184013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  32.84 
 
 		 699 aa  105  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3403  glycoside hydrolase family 43  28.9 
 
 		 357 aa  101  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000194853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6081  glycoside hydrolase family 43  31 
 
 		 480 aa  98.6  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03044  Endo-arabinanase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFU2]  28.62 
 
 		 386 aa  96.7  6e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  30.8 
 
 		 510 aa  95.1  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0473  glycoside hydrolase family 43  31.4 
 
 		 829 aa  90.9  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6044  glycoside hydrolase family 43  27.68 
 
 		 501 aa  85.1  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.845022  normal  0.0554344 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0510  glycoside hydrolase family 43  28.27 
 
 		 456 aa  82.4  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0180422  hitchhiker  0.00320544 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  27.37 
 
 		 503 aa  82.8  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  28.11 
 
 		 524 aa  75.9  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  27.3 
 
 		 522 aa  73.6  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0737  glycoside hydrolase family protein  29.38 
 
 		 345 aa  71.2  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612706  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0637  glycoside hydrolase family protein  27.74 
 
 		 471 aa  68.6  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000622549  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0662  glycoside hydrolase family protein  28.43 
 
 		 471 aa  66.6  0.0000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000191922  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1622  glycoside hydrolase family 43  32.83 
 
 		 703 aa  66.2  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.372812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1999  glycoside hydrolase family protein  27.52 
 
 		 1121 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000101187  decreased coverage  0.0000000170847 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1623  glycoside hydrolase family 43  32.63 
 
 		 804 aa  65.1  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0299424  normal  0.680345 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1976  glycoside hydrolase family protein  28.53 
 
 		 1121 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00565193  hitchhiker  0.00420486 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3292  glycoside hydrolase family 43  31.61 
 
 		 488 aa  63.2  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.223704  hitchhiker  0.00299224 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0664  glycoside hydrolase family protein  31.16 
 
 		 476 aa  62  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  26.44 
 
 		 306 aa  61.2  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2086  beta-xylosidase-like protein  27.52 
 
 		 1121 aa  60.1  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00280414  decreased coverage  0.0000000469917 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4087  glycoside hydrolase family 43  29.14 
 
 		 357 aa  60.1  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2698  glycoside hydrolase family 43  26.05 
 
 		 369 aa  58.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.898004  normal  0.338928 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  24.78 
 
 		 345 aa  57.8  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2809  ATPase  25.55 
 
 		 789 aa  57.8  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153749  decreased coverage  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1393  immunoglobulin I-set domain-containing protein  32.63 
 
 		 810 aa  57.4  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0639  glycoside hydrolase family protein  29.29 
 
 		 475 aa  55.8  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000370471  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1543  beta-xylosidase  24.43 
 
 		 531 aa  52.8  0.000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000200892  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0507  glycoside hydrolase family 43  26.4 
 
 		 337 aa  52.4  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.412329 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  24.37 
 
 		 495 aa  52.8  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2047  glycoside hydrolase family protein  27.22 
 
 		 1112 aa  52  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000114958  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1542  beta-xylosidase  25.18 
 
 		 581 aa  51.2  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2161  glycoside hydrolase family protein  27.82 
 
 		 1143 aa  50.1  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000526501  hitchhiker  0.0000457644 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  26.65 
 
 		 304 aa  49.7  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4511  glycoside hydrolase family protein  26.42 
 
 		 341 aa  49.3  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0015  alpha-L-arabinofuranosidase B  24.61 
 
 		 707 aa  48.1  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1982  glycoside hydrolase family protein  24.9 
 
 		 315 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000010784  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1992  glycoside hydrolase family protein  25.71 
 
 		 315 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000493506  unclonable  0.0000204974 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  25.51 
 
 		 472 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2837  glycoside hydrolase family 43  25.49 
 
 		 348 aa  48.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61366  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3932  glycoside hydrolase family 43  25.17 
 
 		 456 aa  47  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29390  beta-xylosidase  28.8 
 
 		 494 aa  46.2  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.838648  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0628  glycoside hydrolase family 43  26.58 
 
 		 505 aa  45.4  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2022  glycoside hydrolase family 43  26.83 
 
 		 334 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21180  beta-xylosidase  30.27 
 
 		 526 aa  45.4  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.166078 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0430  glycoside hydrolase family 43  26.61 
 
 		 497 aa  45.1  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.710686 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01459  xylosidase; arabinosidase  25.14 
 
 		 527 aa  45.1  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.928055  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2069  glycoside hydrolase family protein  24.49 
 
 		 315 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000027007  hitchhiker  0.0000035019 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6022  glycoside hydrolase family 43  25.42 
 
 		 319 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6730  glycoside hydrolase family 43  24.61 
 
 		 323 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  normal  0.920031 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2384  glycoside hydrolase family 43  25.47 
 
 		 330 aa  44.3  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0193  glycoside hydrolase family 43  25.3 
 
 		 324 aa  44.3  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00680352  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  25.11 
 
 		 487 aa  44.7  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2822  Glycosyl hydrolase family 32 domain-containing protein  39.71 
 
 		 673 aa  43.1  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2529  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.83 
 
 		 355 aa  43.1  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0997912 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2027  glycoside hydrolase family protein  20.47 
 
 		 325 aa  43.1  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2722  glycoside hydrolase family protein  31.03 
 
 		 310 aa  42.7  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123508  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>