38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6626 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6626  parallel beta-helix repeat protein  100 
 
 		 1011 aa  2023    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0442384  normal  0.141702 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7222  hypothetical protein  39.46 
 
 		 839 aa  340  8e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  33.22 
 
 		 801 aa  232  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0539  hypothetical protein  31.56 
 
 		 648 aa  226  1e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.280042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5089  Parallel beta-helix repeat protein  29.47 
 
 		 791 aa  204  8e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.46946 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5098  hypothetical protein  29.21 
 
 		 788 aa  192  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.381891 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4874  Ricin B lectin  39.53 
 
 		 1049 aa  174  9e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.524665  normal  0.633916 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2405  hypothetical protein  27.54 
 
 		 722 aa  168  5.9999999999999996e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.55716  normal  0.421428 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5426  hypothetical protein  28.59 
 
 		 563 aa  164  7e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4114  hypothetical protein  24.34 
 
 		 832 aa  156  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0478518  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6726  hypothetical protein  28.54 
 
 		 580 aa  149  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.474731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1656  Carbohydrate binding family 6  25.54 
 
 		 951 aa  144  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00148801  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  25.21 
 
 		 965 aa  144  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2736  hypothetical protein  25.68 
 
 		 627 aa  129  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00161414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2776  hypothetical protein  24.34 
 
 		 838 aa  125  5e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0993  Carbohydrate-binding family 9  23.42 
 
 		 2286 aa  100  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.938361  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2607  hypothetical protein  31.6 
 
 		 755 aa  93.2  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.459804 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3593  hypothetical protein  31.8 
 
 		 723 aa  90.5  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.27604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1130  PDZ/DHR/GLGF domain protein  23.94 
 
 		 789 aa  85.1  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.453504  normal  0.447933 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  40.18 
 
 		 1013 aa  70.9  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3458  hypothetical protein  27.43 
 
 		 649 aa  68.2  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0527  hypothetical protein  26.52 
 
 		 480 aa  67.4  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0252239 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4475  hypothetical protein  35.16 
 
 		 1121 aa  63.9  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.161774 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6426  hypothetical protein  23.65 
 
 		 708 aa  54.3  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2913  hypothetical protein  24.23 
 
 		 752 aa  54.7  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.706776  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1082  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.09 
 
 		 517 aa  53.5  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.286531 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4312  hypothetical protein  25.11 
 
 		 1413 aa  51.6  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.319357  normal  0.568612 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6231  hypothetical protein  23.79 
 
 		 709 aa  51.6  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.126959 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2668  hypothetical protein  21.05 
 
 		 677 aa  51.6  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1016  hypothetical protein  22.92 
 
 		 513 aa  50.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4311  hypothetical protein  28.29 
 
 		 1405 aa  50.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.861205  normal  0.589522 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3712  Beta-galactosidase  28.83 
 
 		 1392 aa  48.5  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173046  normal  0.0203648 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1843  FucA  27.64 
 
 		 750 aa  48.1  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0468  protein of unknown function DUF1565  36.45 
 
 		 653 aa  47.8  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.672167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2130  calx-beta domain-containing protein  26.92 
 
 		 932 aa  47.4  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.538147  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0112  hypothetical protein  22.61 
 
 		 1024 aa  46.6  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6193  glycoside hydrolase family 43  28.89 
 
 		 502 aa  45.8  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1237  hypothetical protein  36.71 
 
 		 689 aa  44.7  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.157954 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>