28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5426 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5426  hypothetical protein  100 
 
 		 563 aa  1125    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0539  hypothetical protein  38.69 
 
 		 648 aa  328  1.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.280042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7222  hypothetical protein  33.64 
 
 		 839 aa  222  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5089  Parallel beta-helix repeat protein  33.27 
 
 		 791 aa  206  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.46946 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5098  hypothetical protein  33.46 
 
 		 788 aa  194  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.381891 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6626  parallel beta-helix repeat protein  29.01 
 
 		 1011 aa  179  9e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0442384  normal  0.141702 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2405  hypothetical protein  28.4 
 
 		 722 aa  139  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.55716  normal  0.421428 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2736  hypothetical protein  26.05 
 
 		 627 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00161414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2776  hypothetical protein  24.23 
 
 		 838 aa  126  8.000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4114  hypothetical protein  22.95 
 
 		 832 aa  120  7e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0478518  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  26.09 
 
 		 801 aa  114  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6726  hypothetical protein  27.02 
 
 		 580 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.474731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1656  Carbohydrate binding family 6  22.81 
 
 		 951 aa  99.8  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00148801  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4874  Ricin B lectin  28.73 
 
 		 1049 aa  81.3  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.524665  normal  0.633916 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6231  hypothetical protein  23.2 
 
 		 709 aa  80.1  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.126959 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6426  hypothetical protein  23.13 
 
 		 708 aa  79  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  22.3 
 
 		 965 aa  78.2  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1130  PDZ/DHR/GLGF domain protein  23.91 
 
 		 789 aa  65.9  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.453504  normal  0.447933 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4475  hypothetical protein  24.41 
 
 		 1121 aa  62.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.161774 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2913  hypothetical protein  22.26 
 
 		 752 aa  61.2  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.706776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0112  hypothetical protein  32.98 
 
 		 1024 aa  58.2  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292658  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2668  hypothetical protein  21.92 
 
 		 677 aa  58.2  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1237  hypothetical protein  42.53 
 
 		 689 aa  57.8  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.157954 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0993  Carbohydrate-binding family 9  24.27 
 
 		 2286 aa  56.6  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.938361  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0468  protein of unknown function DUF1565  36.36 
 
 		 653 aa  50.1  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.672167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3056  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  47.17 
 
 		 694 aa  48.9  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.630514  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2604  Fibronectin type III domain protein  22.29 
 
 		 1302 aa  46.6  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.178054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0233  putative outer membrane protein  28.87 
 
 		 638 aa  45.8  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.317467  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>