13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1016 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1016  hypothetical protein  100 
 
 		 513 aa  1023    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0527  hypothetical protein  43.6 
 
 		 480 aa  288  2e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0252239 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  46.09 
 
 		 830 aa  62  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4336  alpha amylase catalytic region  50.77 
 
 		 914 aa  51.2  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4505  PT repeat-containing protein  46.09 
 
 		 453 aa  49.3  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6626  parallel beta-helix repeat protein  22.6 
 
 		 1011 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0442384  normal  0.141702 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4475  hypothetical protein  30.51 
 
 		 1121 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.161774 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7673  protein kinase  43.82 
 
 		 572 aa  45.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.683245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4874  Ricin B lectin  30.48 
 
 		 1049 aa  44.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.524665  normal  0.633916 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  42.2 
 
 		 1394 aa  44.3  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1203  beta-Ig-H3/fasciclin  47.06 
 
 		 778 aa  43.9  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0966614  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45682  predicted protein  43.21 
 
 		 633 aa  43.5  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0710  hypothetical protein  26.04 
 
 		 295 aa  43.5  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0907707  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>