64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2530 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013526  Tter_2530  glycoside hydrolase family 39  100 
 
 		 864 aa  1763    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2597  hypothetical protein  31.54 
 
 		 264 aa  115  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.152526  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1873  alpha-1,2-mannosidase  31.72 
 
 		 1075 aa  90.9  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3322  alpha-1,2-mannosidase  25.09 
 
 		 1089 aa  79  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0532336  normal  0.277705 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1978  Xylan 1,4-beta-xylosidase  32.72 
 
 		 512 aa  75.9  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.727016  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33180  beta-xylosidase  33.33 
 
 		 520 aa  75.1  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0737494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3132  xylan 1,4-beta-xylosidase  33.11 
 
 		 530 aa  74.3  0.000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.297531 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4569  alpha-1,2-mannosidase  31.52 
 
 		 1465 aa  70.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0820  Xylan 1,4-beta-xylosidase  38.64 
 
 		 550 aa  69.7  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2398  Xylan 1,4-beta-xylosidase  30.54 
 
 		 519 aa  68.9  0.0000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.274955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3822  Xylan 1,4-beta-xylosidase  33.12 
 
 		 518 aa  68.6  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163293  normal  0.112071 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1259  glycoside hydrolase family 39  24.29 
 
 		 501 aa  68.2  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4439  Alpha-galactosidase  31.01 
 
 		 727 aa  66.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.093 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0776  glycoside hydrolase family protein  23.13 
 
 		 523 aa  65.1  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0170  Xylan 1,4-beta-xylosidase  26.74 
 
 		 611 aa  64.7  0.000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.268815  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4651  Beta-glucosidase  27.68 
 
 		 1548 aa  64.3  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00279613  normal  0.760952 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0114  glycoside hydrolase family 39  37.14 
 
 		 544 aa  63.9  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.747279  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0370  Xylan 1,4-beta-xylosidase  29.94 
 
 		 509 aa  63.9  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.809464  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2663  Xylan 1,4-beta-xylosidase  29.94 
 
 		 510 aa  63.2  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4444  lipolytic protein G-D-S-L family  29.57 
 
 		 794 aa  63.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0624872  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0184  Xylan 1,4-beta-xylosidase  31.86 
 
 		 501 aa  61.6  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0695  glycoside hydrolase family protein  26.14 
 
 		 466 aa  61.2  0.00000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.251112  normal  0.0214921 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4883  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.09 
 
 		 1212 aa  59.7  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0885799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2705  glycoside hydrolase family 39  28.05 
 
 		 503 aa  58.5  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6291  hypothetical protein  28.57 
 
 		 195 aa  57.4  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0944  hypothetical protein  25.56 
 
 		 718 aa  56.6  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5221  glycoside hydrolase family 3 domain protein  25.81 
 
 		 1357 aa  56.6  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0332695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  27.27 
 
 		 778 aa  56.6  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2645  mannosyl-glycoproteinendo-beta-N- acetylglucosaminidase  29.05 
 
 		 512 aa  56.2  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.708855  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1539  glycoside hydrolase family 39  27.78 
 
 		 578 aa  55.8  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.262725 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0187  glycoside hydrolase family 39  30.17 
 
 		 388 aa  55.1  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3934  glycoside hydrolase family 39  25.88 
 
 		 576 aa  55.1  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.346873 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2997  Xylan 1,4-beta-xylosidase  34.21 
 
 		 514 aa  54.7  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.864666 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0775  lipolytic protein G-D-S-L family  28.02 
 
 		 646 aa  54.3  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.812985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1991  Alpha-1,2-mannosidase, putative  31.4 
 
 		 961 aa  52.8  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.280076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7193  glycoside hydrolase family 39  33.33 
 
 		 548 aa  52.8  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0114061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2109  Carbohydrate-binding family 9  28 
 
 		 1276 aa  51.6  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000203571  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2001  hypothetical protein  34.62 
 
 		 596 aa  51.6  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.021099  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3952  glycoside hydrolase family 39  31.34 
 
 		 542 aa  50.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3134  glycoside hydrolase family protein  28.98 
 
 		 477 aa  50.8  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1297  glycoside hydrolase family 39  23.59 
 
 		 523 aa  50.4  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1040  hypothetical protein  28.04 
 
 		 614 aa  49.7  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.367897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5219  hypothetical protein  26.03 
 
 		 1176 aa  50.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6408  hypothetical protein  26.51 
 
 		 1375 aa  49.7  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.178715 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4606  hypothetical protein  29.52 
 
 		 584 aa  48.1  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000237555  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5268  glycoside hydrolase family 39  32.91 
 
 		 561 aa  47.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1926  alpha-1,2-mannosidase family protein  28.93 
 
 		 955 aa  46.2  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1678  alpha-1,2-mannosidase family protein  28.93 
 
 		 955 aa  46.6  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0315  putative alpha-1,2-mannosidase  28.93 
 
 		 986 aa  46.6  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0790  hypothetical protein  26.73 
 
 		 460 aa  46.6  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2204  alpha-1,2-mannosidase family protein  28.93 
 
 		 986 aa  46.2  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3764  hypothetical protein  26.09 
 
 		 605 aa  46.2  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0226  putative alpha-1,2-mannosidase  28.93 
 
 		 986 aa  46.2  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1228  alpha-1,2-mannosidase family protein  28.93 
 
 		 986 aa  46.2  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0941  alpha-1,2-mannosidase family protein  28.93 
 
 		 986 aa  46.2  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4305  hypothetical protein  31.73 
 
 		 445 aa  45.1  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1362  glycoside hydrolase family protein  26.23 
 
 		 557 aa  45.1  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2650  agarase  29.73 
 
 		 787 aa  45.1  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000351829  normal  0.0319277 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6399  glycoside hydrolase family 5  25.48 
 
 		 415 aa  44.7  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.337804 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1344  hypothetical protein  27.89 
 
 		 873 aa  44.7  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.173048  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1092  PA14 domain protein  26.59 
 
 		 613 aa  44.3  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0228  alpha-1,2-mannosidase family protein  28.1 
 
 		 964 aa  44.7  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3849  alpha-1,2-mannosidase  27.16 
 
 		 1084 aa  44.3  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157867  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2529  Carbohydrate-binding family 9  24.89 
 
 		 1141 aa  44.3  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>