32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0114 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_0820  Xylan 1,4-beta-xylosidase  68.58 
 
 		 550 aa  738    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0114  glycoside hydrolase family 39  100 
 
 		 544 aa  1112    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.747279  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7193  glycoside hydrolase family 39  42.03 
 
 		 548 aa  413  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0114061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1297  glycoside hydrolase family 39  38.74 
 
 		 523 aa  355  8.999999999999999e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0776  glycoside hydrolase family protein  33.58 
 
 		 523 aa  334  3e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2705  glycoside hydrolase family 39  35.7 
 
 		 503 aa  323  7e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1259  glycoside hydrolase family 39  32.7 
 
 		 501 aa  308  2.0000000000000002e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3134  glycoside hydrolase family protein  34.29 
 
 		 477 aa  297  4e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33180  beta-xylosidase  34.65 
 
 		 520 aa  289  8e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0737494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3132  xylan 1,4-beta-xylosidase  34.59 
 
 		 530 aa  287  2.9999999999999996e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.297531 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0184  Xylan 1,4-beta-xylosidase  30.41 
 
 		 501 aa  284  3.0000000000000004e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0187  glycoside hydrolase family 39  38.39 
 
 		 388 aa  278  1e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2997  Xylan 1,4-beta-xylosidase  33.86 
 
 		 514 aa  269  8e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.864666 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3822  Xylan 1,4-beta-xylosidase  33.02 
 
 		 518 aa  269  1e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163293  normal  0.112071 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1978  Xylan 1,4-beta-xylosidase  33.79 
 
 		 512 aa  264  4e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.727016  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0370  Xylan 1,4-beta-xylosidase  33.6 
 
 		 509 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.809464  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2663  Xylan 1,4-beta-xylosidase  33.6 
 
 		 510 aa  254  3e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2398  Xylan 1,4-beta-xylosidase  31.98 
 
 		 519 aa  248  3e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.274955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0170  Xylan 1,4-beta-xylosidase  34.57 
 
 		 611 aa  190  5e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.268815  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1539  glycoside hydrolase family 39  25.25 
 
 		 578 aa  127  4.0000000000000003e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.262725 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3934  glycoside hydrolase family 39  25.21 
 
 		 576 aa  124  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.346873 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5268  glycoside hydrolase family 39  26.05 
 
 		 561 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1416  glycoside hydrolase family 39  24.69 
 
 		 557 aa  122  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.336596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5150  glycoside hydrolase family 39  25.27 
 
 		 566 aa  119  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0964315  hitchhiker  0.00110099 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3952  glycoside hydrolase family 39  24.38 
 
 		 542 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1362  glycoside hydrolase family protein  25.48 
 
 		 557 aa  110  5e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2530  glycoside hydrolase family 39  37.14 
 
 		 864 aa  63.9  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0695  glycoside hydrolase family protein  23.97 
 
 		 466 aa  62.8  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.251112  normal  0.0214921 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4606  hypothetical protein  24.93 
 
 		 584 aa  47  0.0009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000237555  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2529  Carbohydrate-binding family 9  45.31 
 
 		 1141 aa  46.6  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1432  AraC family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 686 aa  46.6  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00438113  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1698  AraC family transcriptional regulator  23.15 
 
 		 686 aa  46.2  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000348751  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>