77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0775 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0775  lipolytic protein G-D-S-L family  100 
 
 
646 aa  1278    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.812985  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4444  lipolytic protein G-D-S-L family  38.6 
 
 
794 aa  374  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0624872  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14350  lysophospholipase L1-like esterase  40.97 
 
 
407 aa  228  4e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2328  lipolytic protein G-D-S-L family  40.68 
 
 
429 aa  223  7e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.403637  normal  0.694344 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2481  GDSL family lipase  36.75 
 
 
450 aa  221  3e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2664  GDSL family lipase  37.28 
 
 
423 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.670463  decreased coverage  0.0000514586 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5218  lipolytic protein G-D-S-L family  37.6 
 
 
542 aa  214  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3984  lipolytic protein G-D-S-L family  37.76 
 
 
430 aa  211  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.767273  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0964  lipolytic enzyme, G-D-S-L  34.99 
 
 
407 aa  209  1e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.263974  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2556  lipolytic protein G-D-S-L family  34.76 
 
 
414 aa  204  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1831  GDSL family lipase  35.24 
 
 
418 aa  201  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0423469 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3096  lipase/acylhydrolase, putative  35.71 
 
 
428 aa  200  7.999999999999999e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  unclonable  0.0000000000338841  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20820  Lipolytic enzyme, G-D-S-L domain protein  38.42 
 
 
451 aa  198  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.6463  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2571  lipase/acylhydrolase, putative  37.93 
 
 
425 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000716305  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2776  lipolytic protein G-D-S-L family  39.15 
 
 
487 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.19649  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3539  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  37.93 
 
 
425 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00000245982  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1986  putative lipase/acylhydrolase  37.93 
 
 
425 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000018938  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3110  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  37.93 
 
 
483 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  unclonable  0.000000000002324  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0013  lipolytic enzyme, G-D-S-L  37.93 
 
 
483 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000198  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1244  lipolytic protein G-D-S-L family  36.64 
 
 
404 aa  198  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0961  GDSL family lipase  36.66 
 
 
439 aa  197  4.0000000000000005e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.270574 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0006  lipase/acylhydrolase, putative  37.67 
 
 
425 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000023586  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3835  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  36.6 
 
 
425 aa  196  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00947114  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2273  lipolytic protein G-D-S-L family  35.15 
 
 
420 aa  196  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4089  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23690  putative secreted protein  36.91 
 
 
442 aa  193  9e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00903335 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3482  lipolytic protein G-D-S-L family  35.78 
 
 
409 aa  192  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1245  lipolytic protein G-D-S-L family  37.53 
 
 
414 aa  190  5.999999999999999e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4719  lipolytic protein G-D-S-L family  34.45 
 
 
407 aa  189  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2856  GDSL family lipase  34.29 
 
 
452 aa  189  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000379569  hitchhiker  0.00852131 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0259  GDSL family lipase  36.65 
 
 
423 aa  187  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000511681  normal  0.138993 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2528  GDSL family lipase  35.84 
 
 
437 aa  187  4e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.744163 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7004  GDSL family lipase  34.55 
 
 
416 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953505  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0250  GDSL family lipase  35.64 
 
 
421 aa  185  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000480307  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1595  lipolytic protein G-D-S-L family  35.36 
 
 
418 aa  183  9.000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1567  GDSL-like lipase/acylhydrolase family protein  34.34 
 
 
422 aa  180  7e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.130924  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0311  GDSL family lipase  37.08 
 
 
421 aa  177  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000971594  hitchhiker  0.00755719 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0331  GDSL family lipase  37.08 
 
 
421 aa  177  4e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000381329  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0233  GDSL family lipase  34.06 
 
 
421 aa  177  4e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000340097  hitchhiker  0.00372665 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2775  lipolytic enzyme, G-D-S-L  37.08 
 
 
421 aa  177  4e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000857041  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3061  GDSL family lipase  33.74 
 
 
415 aa  176  9.999999999999999e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.827157  normal  0.011325 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6408  hypothetical protein  28.35 
 
 
1375 aa  175  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.178715 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2832  lipolytic protein G-D-S-L family  35.15 
 
 
396 aa  175  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000255461  decreased coverage  0.0000190518 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2643  lipolytic protein G-D-S-L family  33.7 
 
 
377 aa  172  1e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.624519  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3430  lipolytic protein  36.55 
 
 
423 aa  169  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.00000000013234  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3660  lipolytic protein G-D-S-L family  34.75 
 
 
422 aa  166  9e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000531698  hitchhiker  0.0000015866 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0297  lipase/acylhydrolase  34.95 
 
 
423 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223769  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3879  GDSL family lipase  28.95 
 
 
414 aa  158  3e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4791  lipolytic protein G-D-S-L family  33.1 
 
 
422 aa  157  7e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4331  hypothetical protein  37.72 
 
 
326 aa  154  5e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.46242  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3774  lipolytic enzyme, G-D-S-L  34.5 
 
 
384 aa  154  5e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.0000000000241856  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09287  extracellular GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00820)  31.13 
 
 
425 aa  147  8.000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.879656 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2070  lipolytic protein G-D-S-L family  30.33 
 
 
395 aa  143  9e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.397214  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0237  hypothetical protein  24.26 
 
 
376 aa  130  8.000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3614  lipolytic protein G-D-S-L family  39.09 
 
 
220 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0768739  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4569  alpha-1,2-mannosidase  36.32 
 
 
1465 aa  98.2  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2838  lipolytic protein G-D-S-L family  27.32 
 
 
399 aa  91.3  5e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.902078  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4651  Beta-glucosidase  30.43 
 
 
1548 aa  76.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00279613  normal  0.760952 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  29.73 
 
 
778 aa  73.6  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4883  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.63 
 
 
1212 aa  70.5  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0885799  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5219  hypothetical protein  30.26 
 
 
1176 aa  70.5  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4439  Alpha-galactosidase  29.11 
 
 
727 aa  64.7  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.093 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2530  glycoside hydrolase family 39  28.02 
 
 
864 aa  54.7  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1991  Alpha-1,2-mannosidase, putative  30.59 
 
 
961 aa  53.5  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.280076  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3849  alpha-1,2-mannosidase  31.82 
 
 
1084 aa  52.4  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157867  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5221  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.42 
 
 
1357 aa  50.4  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0332695  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2645  mannosyl-glycoproteinendo-beta-N- acetylglucosaminidase  31.72 
 
 
512 aa  50.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.708855  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0228  alpha-1,2-mannosidase family protein  29.65 
 
 
964 aa  49.3  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1678  alpha-1,2-mannosidase family protein  29.07 
 
 
955 aa  48.1  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0315  putative alpha-1,2-mannosidase  29.07 
 
 
986 aa  48.1  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1926  alpha-1,2-mannosidase family protein  29.07 
 
 
955 aa  48.1  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0941  alpha-1,2-mannosidase family protein  29.07 
 
 
986 aa  47.8  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2204  alpha-1,2-mannosidase family protein  29.07 
 
 
986 aa  47.8  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0226  putative alpha-1,2-mannosidase  29.07 
 
 
986 aa  47.8  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1228  alpha-1,2-mannosidase family protein  29.07 
 
 
986 aa  47.8  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0394  GDSL family lipase  27.18 
 
 
204 aa  47  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00216683  hitchhiker  0.0000338179 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3322  alpha-1,2-mannosidase  24.21 
 
 
1089 aa  45.4  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0532336  normal  0.277705 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1873  alpha-1,2-mannosidase  29.95 
 
 
1075 aa  44.7  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>