29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0695 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_0695  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 466 aa  976    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.251112  normal  0.0214921 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2705  glycoside hydrolase family 39  28.29 
 
 		 503 aa  93.2  9e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33180  beta-xylosidase  27.67 
 
 		 520 aa  92.8  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0737494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1259  glycoside hydrolase family 39  24.24 
 
 		 501 aa  86.7  9e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2398  Xylan 1,4-beta-xylosidase  24.05 
 
 		 519 aa  81.6  0.00000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.274955  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0184  Xylan 1,4-beta-xylosidase  28.3 
 
 		 501 aa  79  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1539  glycoside hydrolase family 39  31.61 
 
 		 578 aa  77.4  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.262725 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2997  Xylan 1,4-beta-xylosidase  26.07 
 
 		 514 aa  75.9  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.864666 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1978  Xylan 1,4-beta-xylosidase  25.3 
 
 		 512 aa  75.1  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.727016  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3822  Xylan 1,4-beta-xylosidase  24.02 
 
 		 518 aa  73.9  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163293  normal  0.112071 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0776  glycoside hydrolase family protein  23.44 
 
 		 523 aa  71.2  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0370  Xylan 1,4-beta-xylosidase  25.2 
 
 		 509 aa  70.9  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.809464  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2663  Xylan 1,4-beta-xylosidase  25.2 
 
 		 510 aa  70.5  0.00000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7193  glycoside hydrolase family 39  24.45 
 
 		 548 aa  68.6  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0114061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3952  glycoside hydrolase family 39  33.33 
 
 		 542 aa  68.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1297  glycoside hydrolase family 39  21.22 
 
 		 523 aa  65.1  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0114  glycoside hydrolase family 39  23.97 
 
 		 544 aa  63.2  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.747279  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3132  xylan 1,4-beta-xylosidase  25.85 
 
 		 530 aa  63.2  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.297531 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2530  glycoside hydrolase family 39  26.14 
 
 		 864 aa  61.6  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3934  glycoside hydrolase family 39  28.8 
 
 		 576 aa  60.5  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.346873 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0170  Xylan 1,4-beta-xylosidase  24.36 
 
 		 611 aa  58.2  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.268815  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5268  glycoside hydrolase family 39  30.33 
 
 		 561 aa  57.4  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3134  glycoside hydrolase family protein  25.53 
 
 		 477 aa  54.3  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0820  Xylan 1,4-beta-xylosidase  23.58 
 
 		 550 aa  53.9  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5150  glycoside hydrolase family 39  23.26 
 
 		 566 aa  51.6  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0964315  hitchhiker  0.00110099 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0187  glycoside hydrolase family 39  22.93 
 
 		 388 aa  51.6  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1416  glycoside hydrolase family 39  32.61 
 
 		 557 aa  45.8  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.336596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0717  glycosyl hydrolase 53 protein  25.68 
 
 		 534 aa  44.7  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4282  Beta-xylosidase-like protein  23.66 
 
 		 444 aa  43.5  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.296007  hitchhiker  0.00752766 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>