30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3134 on replicon NC_009467
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009467  Acry_3134  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 477 aa  996    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0187  glycoside hydrolase family 39  52.69 
 
 		 388 aa  394  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1297  glycoside hydrolase family 39  36.55 
 
 		 523 aa  322  9.999999999999999e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0776  glycoside hydrolase family protein  43.07 
 
 		 523 aa  301  1e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3132  xylan 1,4-beta-xylosidase  36.55 
 
 		 530 aa  299  6e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.297531 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2705  glycoside hydrolase family 39  36.34 
 
 		 503 aa  299  7e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0184  Xylan 1,4-beta-xylosidase  34.96 
 
 		 501 aa  298  2e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0820  Xylan 1,4-beta-xylosidase  35.53 
 
 		 550 aa  295  1e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2997  Xylan 1,4-beta-xylosidase  34.63 
 
 		 514 aa  281  2e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.864666 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1259  glycoside hydrolase family 39  35.89 
 
 		 501 aa  280  4e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0114  glycoside hydrolase family 39  34.29 
 
 		 544 aa  279  1e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.747279  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33180  beta-xylosidase  35.86 
 
 		 520 aa  278  2e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0737494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7193  glycoside hydrolase family 39  31.48 
 
 		 548 aa  276  4e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0114061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1978  Xylan 1,4-beta-xylosidase  36.29 
 
 		 512 aa  276  5e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.727016  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3822  Xylan 1,4-beta-xylosidase  36.02 
 
 		 518 aa  265  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163293  normal  0.112071 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0370  Xylan 1,4-beta-xylosidase  35.19 
 
 		 509 aa  251  2e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.809464  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2663  Xylan 1,4-beta-xylosidase  35.19 
 
 		 510 aa  251  2e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2398  Xylan 1,4-beta-xylosidase  35.25 
 
 		 519 aa  241  2.9999999999999997e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.274955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0170  Xylan 1,4-beta-xylosidase  34.1 
 
 		 611 aa  228  1e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.268815  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5268  glycoside hydrolase family 39  24.04 
 
 		 561 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1539  glycoside hydrolase family 39  26.87 
 
 		 578 aa  129  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.262725 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3934  glycoside hydrolase family 39  24.25 
 
 		 576 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.346873 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1416  glycoside hydrolase family 39  23.18 
 
 		 557 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.336596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1362  glycoside hydrolase family protein  25.16 
 
 		 557 aa  110  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5150  glycoside hydrolase family 39  24.06 
 
 		 566 aa  108  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0964315  hitchhiker  0.00110099 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3952  glycoside hydrolase family 39  24.19 
 
 		 542 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0695  glycoside hydrolase family protein  25.53 
 
 		 466 aa  54.3  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.251112  normal  0.0214921 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2530  glycoside hydrolase family 39  28.98 
 
 		 864 aa  50.8  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2759  glycoside hydrolase family protein  25.12 
 
 		 437 aa  45.8  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1931  hypothetical protein  25 
 
 		 429 aa  43.9  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00823138  normal  0.409118 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>