28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1416 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5150  glycoside hydrolase family 39  54.83 
 
 		 566 aa  635    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0964315  hitchhiker  0.00110099 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3934  glycoside hydrolase family 39  58.92 
 
 		 576 aa  673    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.346873 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1416  glycoside hydrolase family 39  100 
 
 		 557 aa  1169    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.336596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5268  glycoside hydrolase family 39  55.36 
 
 		 561 aa  652    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1362  glycoside hydrolase family protein  50.27 
 
 		 557 aa  578  1.0000000000000001e-163  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3952  glycoside hydrolase family 39  47.03 
 
 		 542 aa  538  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1539  glycoside hydrolase family 39  31.28 
 
 		 578 aa  280  4e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.262725 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0776  glycoside hydrolase family protein  25.65 
 
 		 523 aa  154  2.9999999999999998e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2705  glycoside hydrolase family 39  24.75 
 
 		 503 aa  144  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0184  Xylan 1,4-beta-xylosidase  26.56 
 
 		 501 aa  139  8.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33180  beta-xylosidase  26.26 
 
 		 520 aa  139  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0737494  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0187  glycoside hydrolase family 39  25.99 
 
 		 388 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1297  glycoside hydrolase family 39  23.08 
 
 		 523 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1259  glycoside hydrolase family 39  23.52 
 
 		 501 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2663  Xylan 1,4-beta-xylosidase  25.58 
 
 		 510 aa  124  3e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0370  Xylan 1,4-beta-xylosidase  25.58 
 
 		 509 aa  125  3e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.809464  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2398  Xylan 1,4-beta-xylosidase  26.42 
 
 		 519 aa  124  3e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.274955  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2997  Xylan 1,4-beta-xylosidase  24.68 
 
 		 514 aa  124  4e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.864666 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1978  Xylan 1,4-beta-xylosidase  24.31 
 
 		 512 aa  120  9e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.727016  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3132  xylan 1,4-beta-xylosidase  24.2 
 
 		 530 aa  119  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.297531 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3134  glycoside hydrolase family protein  23.18 
 
 		 477 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0114  glycoside hydrolase family 39  24.69 
 
 		 544 aa  114  6e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.747279  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0170  Xylan 1,4-beta-xylosidase  26.96 
 
 		 611 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.268815  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7193  glycoside hydrolase family 39  23.11 
 
 		 548 aa  109  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0114061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3822  Xylan 1,4-beta-xylosidase  21.86 
 
 		 518 aa  97.1  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163293  normal  0.112071 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0820  Xylan 1,4-beta-xylosidase  32.88 
 
 		 550 aa  92  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0695  glycoside hydrolase family protein  32.61 
 
 		 466 aa  45.8  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.251112  normal  0.0214921 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3494  hypothetical protein  33.33 
 
 		 494 aa  44.7  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00694857  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>