31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0776 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0776  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 523 aa  1085    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1297  glycoside hydrolase family 39  48.18 
 
 		 523 aa  522  1e-147  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3132  xylan 1,4-beta-xylosidase  41.73 
 
 		 530 aa  420  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.297531 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0187  glycoside hydrolase family 39  45.66 
 
 		 388 aa  335  2e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0184  Xylan 1,4-beta-xylosidase  36.74 
 
 		 501 aa  332  8e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2705  glycoside hydrolase family 39  43.82 
 
 		 503 aa  327  4.0000000000000003e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1259  glycoside hydrolase family 39  35.87 
 
 		 501 aa  326  6e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0820  Xylan 1,4-beta-xylosidase  35.28 
 
 		 550 aa  320  3e-86  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2997  Xylan 1,4-beta-xylosidase  34.01 
 
 		 514 aa  313  3.9999999999999997e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.864666 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3822  Xylan 1,4-beta-xylosidase  34.51 
 
 		 518 aa  312  7.999999999999999e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163293  normal  0.112071 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0114  glycoside hydrolase family 39  33.58 
 
 		 544 aa  310  5.9999999999999995e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.747279  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1978  Xylan 1,4-beta-xylosidase  35.1 
 
 		 512 aa  307  3e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.727016  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33180  beta-xylosidase  33.33 
 
 		 520 aa  306  4.0000000000000004e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0737494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3134  glycoside hydrolase family protein  43.07 
 
 		 477 aa  301  1e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0370  Xylan 1,4-beta-xylosidase  32.51 
 
 		 509 aa  271  2.9999999999999997e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.809464  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2663  Xylan 1,4-beta-xylosidase  32.51 
 
 		 510 aa  270  7e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7193  glycoside hydrolase family 39  33.79 
 
 		 548 aa  263  6e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0114061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2398  Xylan 1,4-beta-xylosidase  30.72 
 
 		 519 aa  258  2e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.274955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0170  Xylan 1,4-beta-xylosidase  31.38 
 
 		 611 aa  204  3e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.268815  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1416  glycoside hydrolase family 39  25.65 
 
 		 557 aa  154  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.336596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3934  glycoside hydrolase family 39  26.49 
 
 		 576 aa  152  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.346873 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5268  glycoside hydrolase family 39  24.23 
 
 		 561 aa  140  4.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1539  glycoside hydrolase family 39  26.02 
 
 		 578 aa  138  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.262725 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5150  glycoside hydrolase family 39  36.79 
 
 		 566 aa  137  6.0000000000000005e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0964315  hitchhiker  0.00110099 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1362  glycoside hydrolase family protein  23.28 
 
 		 557 aa  125  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3952  glycoside hydrolase family 39  23.69 
 
 		 542 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0695  glycoside hydrolase family protein  25.1 
 
 		 466 aa  69.7  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.251112  normal  0.0214921 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2530  glycoside hydrolase family 39  23.13 
 
 		 864 aa  65.1  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1432  AraC family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 686 aa  49.7  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00438113  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1698  AraC family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 686 aa  48.1  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000348751  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4282  Beta-xylosidase-like protein  25.4 
 
 		 444 aa  43.9  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.296007  hitchhiker  0.00752766 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>