28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3952 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3952  glycoside hydrolase family 39  100 
 
 		 542 aa  1124    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3934  glycoside hydrolase family 39  49.07 
 
 		 576 aa  573  1.0000000000000001e-162  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.346873 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5268  glycoside hydrolase family 39  47.67 
 
 		 561 aa  545  1e-154  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1416  glycoside hydrolase family 39  47.03 
 
 		 557 aa  538  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.336596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5150  glycoside hydrolase family 39  45.69 
 
 		 566 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0964315  hitchhiker  0.00110099 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1362  glycoside hydrolase family protein  46.57 
 
 		 557 aa  501  1e-140  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1539  glycoside hydrolase family 39  35.91 
 
 		 578 aa  326  8.000000000000001e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.262725 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0184  Xylan 1,4-beta-xylosidase  26.75 
 
 		 501 aa  151  4e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2705  glycoside hydrolase family 39  24.44 
 
 		 503 aa  141  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33180  beta-xylosidase  26.34 
 
 		 520 aa  140  7e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0737494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0370  Xylan 1,4-beta-xylosidase  24.52 
 
 		 509 aa  133  6.999999999999999e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.809464  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2663  Xylan 1,4-beta-xylosidase  24.52 
 
 		 510 aa  132  2.0000000000000002e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1259  glycoside hydrolase family 39  23.94 
 
 		 501 aa  130  8.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0170  Xylan 1,4-beta-xylosidase  25.78 
 
 		 611 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.268815  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2997  Xylan 1,4-beta-xylosidase  23.82 
 
 		 514 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.864666 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3822  Xylan 1,4-beta-xylosidase  23.34 
 
 		 518 aa  118  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163293  normal  0.112071 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2398  Xylan 1,4-beta-xylosidase  23.96 
 
 		 519 aa  117  6e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.274955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1297  glycoside hydrolase family 39  22.27 
 
 		 523 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3132  xylan 1,4-beta-xylosidase  24.43 
 
 		 530 aa  115  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.297531 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0776  glycoside hydrolase family protein  23.69 
 
 		 523 aa  114  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0114  glycoside hydrolase family 39  24.38 
 
 		 544 aa  110  7.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.747279  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3134  glycoside hydrolase family protein  24.19 
 
 		 477 aa  108  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1978  Xylan 1,4-beta-xylosidase  23.93 
 
 		 512 aa  107  7e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.727016  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0820  Xylan 1,4-beta-xylosidase  22.83 
 
 		 550 aa  106  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0187  glycoside hydrolase family 39  24.63 
 
 		 388 aa  101  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7193  glycoside hydrolase family 39  26.61 
 
 		 548 aa  98.6  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0114061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0695  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 		 466 aa  68.2  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.251112  normal  0.0214921 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2530  glycoside hydrolase family 39  31.34 
 
 		 864 aa  50.4  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>