30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0370 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2663  Xylan 1,4-beta-xylosidase  99.21 
 
 
510 aa  1033    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0370  Xylan 1,4-beta-xylosidase  100 
 
 
509 aa  1040    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.809464  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33180  beta-xylosidase  63.42 
 
 
520 aa  657    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0737494  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1978  Xylan 1,4-beta-xylosidase  59.84 
 
 
512 aa  617  1e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.727016  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3822  Xylan 1,4-beta-xylosidase  59.21 
 
 
518 aa  601  1.0000000000000001e-171  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163293  normal  0.112071 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2997  Xylan 1,4-beta-xylosidase  59.41 
 
 
514 aa  596  1e-169  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.864666 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2398  Xylan 1,4-beta-xylosidase  56.92 
 
 
519 aa  574  1.0000000000000001e-162  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.274955  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2705  glycoside hydrolase family 39  44.79 
 
 
503 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1259  glycoside hydrolase family 39  43.44 
 
 
501 aa  442  1e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0184  Xylan 1,4-beta-xylosidase  41.21 
 
 
501 aa  420  1e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3132  xylan 1,4-beta-xylosidase  34.27 
 
 
530 aa  279  9e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.297531 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1297  glycoside hydrolase family 39  32.79 
 
 
523 aa  279  9e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0187  glycoside hydrolase family 39  39.17 
 
 
388 aa  273  7e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0776  glycoside hydrolase family protein  32.51 
 
 
523 aa  271  2.9999999999999997e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3134  glycoside hydrolase family protein  35.19 
 
 
477 aa  251  3e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7193  glycoside hydrolase family 39  31.66 
 
 
548 aa  240  4e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0114061  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0820  Xylan 1,4-beta-xylosidase  32.94 
 
 
550 aa  239  6.999999999999999e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0114  glycoside hydrolase family 39  33.6 
 
 
544 aa  236  5.0000000000000005e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.747279  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0170  Xylan 1,4-beta-xylosidase  35.26 
 
 
611 aa  190  5.999999999999999e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.268815  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3934  glycoside hydrolase family 39  26.06 
 
 
576 aa  147  6e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.346873 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3952  glycoside hydrolase family 39  24.52 
 
 
542 aa  133  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1539  glycoside hydrolase family 39  27.6 
 
 
578 aa  130  8.000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.262725 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5268  glycoside hydrolase family 39  26.16 
 
 
561 aa  126  9e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1416  glycoside hydrolase family 39  25.58 
 
 
557 aa  125  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.336596  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5150  glycoside hydrolase family 39  23.95 
 
 
566 aa  119  9e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0964315  hitchhiker  0.00110099 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1362  glycoside hydrolase family protein  24.89 
 
 
557 aa  110  5e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0695  glycoside hydrolase family protein  25.2 
 
 
466 aa  70.9  0.00000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.251112  normal  0.0214921 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2530  glycoside hydrolase family 39  29.94 
 
 
864 aa  63.9  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1698  AraC family transcriptional regulator  23.96 
 
 
686 aa  62  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000348751  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1432  AraC family transcriptional regulator  23.47 
 
 
686 aa  60.5  0.00000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00438113  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>