31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1297 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1297  glycoside hydrolase family 39  100 
 
 		 523 aa  1099    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0776  glycoside hydrolase family protein  48.18 
 
 		 523 aa  522  1e-147  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3132  xylan 1,4-beta-xylosidase  39.02 
 
 		 530 aa  390  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.297531 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0820  Xylan 1,4-beta-xylosidase  39.07 
 
 		 550 aa  348  1e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2705  glycoside hydrolase family 39  39.46 
 
 		 503 aa  332  1e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0114  glycoside hydrolase family 39  38.74 
 
 		 544 aa  328  2.0000000000000001e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.747279  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1259  glycoside hydrolase family 39  36.36 
 
 		 501 aa  325  1e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3134  glycoside hydrolase family protein  36.55 
 
 		 477 aa  322  9.999999999999999e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0187  glycoside hydrolase family 39  42.09 
 
 		 388 aa  315  1.9999999999999998e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0184  Xylan 1,4-beta-xylosidase  35.5 
 
 		 501 aa  314  2.9999999999999996e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1978  Xylan 1,4-beta-xylosidase  35.95 
 
 		 512 aa  312  7.999999999999999e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.727016  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33180  beta-xylosidase  34.67 
 
 		 520 aa  307  4.0000000000000004e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0737494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7193  glycoside hydrolase family 39  35.12 
 
 		 548 aa  300  5e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0114061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3822  Xylan 1,4-beta-xylosidase  34.76 
 
 		 518 aa  295  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163293  normal  0.112071 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2997  Xylan 1,4-beta-xylosidase  33.47 
 
 		 514 aa  293  6e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.864666 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2663  Xylan 1,4-beta-xylosidase  32.79 
 
 		 510 aa  280  5e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0370  Xylan 1,4-beta-xylosidase  32.79 
 
 		 509 aa  279  9e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.809464  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2398  Xylan 1,4-beta-xylosidase  30.74 
 
 		 519 aa  254  3e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.274955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0170  Xylan 1,4-beta-xylosidase  28.92 
 
 		 611 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.268815  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1416  glycoside hydrolase family 39  23.08 
 
 		 557 aa  129  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.336596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5268  glycoside hydrolase family 39  22.76 
 
 		 561 aa  127  6e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3934  glycoside hydrolase family 39  23.4 
 
 		 576 aa  124  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.346873 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1539  glycoside hydrolase family 39  23.83 
 
 		 578 aa  117  6.9999999999999995e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.262725 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3952  glycoside hydrolase family 39  22.27 
 
 		 542 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1362  glycoside hydrolase family protein  22.22 
 
 		 557 aa  112  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5150  glycoside hydrolase family 39  26.59 
 
 		 566 aa  106  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0964315  hitchhiker  0.00110099 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0695  glycoside hydrolase family protein  22.73 
 
 		 466 aa  64.7  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.251112  normal  0.0214921 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1432  AraC family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 686 aa  54.3  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00438113  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1698  AraC family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 686 aa  52.8  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000348751  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2530  glycoside hydrolase family 39  23.59 
 
 		 864 aa  50.4  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3044  hypothetical protein  35.29 
 
 		 369 aa  44.3  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.139878  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>