33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5268 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3934  glycoside hydrolase family 39  63.94 
 
 		 576 aa  744    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.346873 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1416  glycoside hydrolase family 39  55.36 
 
 		 557 aa  652    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.336596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5150  glycoside hydrolase family 39  73.74 
 
 		 566 aa  845    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0964315  hitchhiker  0.00110099 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5268  glycoside hydrolase family 39  100 
 
 		 561 aa  1170    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1362  glycoside hydrolase family protein  51.6 
 
 		 557 aa  597  1e-169  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3952  glycoside hydrolase family 39  47.67 
 
 		 542 aa  545  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1539  glycoside hydrolase family 39  34.46 
 
 		 578 aa  320  3.9999999999999996e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.262725 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2705  glycoside hydrolase family 39  28.35 
 
 		 503 aa  174  5e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0184  Xylan 1,4-beta-xylosidase  27.81 
 
 		 501 aa  169  1e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1259  glycoside hydrolase family 39  25.86 
 
 		 501 aa  151  3e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0776  glycoside hydrolase family protein  24.23 
 
 		 523 aa  140  4.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2997  Xylan 1,4-beta-xylosidase  26.02 
 
 		 514 aa  137  6.0000000000000005e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.864666 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33180  beta-xylosidase  25.64 
 
 		 520 aa  133  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0737494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3134  glycoside hydrolase family protein  24.04 
 
 		 477 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1297  glycoside hydrolase family 39  22.76 
 
 		 523 aa  127  7e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0370  Xylan 1,4-beta-xylosidase  26.16 
 
 		 509 aa  126  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.809464  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2663  Xylan 1,4-beta-xylosidase  25.47 
 
 		 510 aa  125  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3132  xylan 1,4-beta-xylosidase  25.59 
 
 		 530 aa  120  4.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.297531 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0187  glycoside hydrolase family 39  27.94 
 
 		 388 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1978  Xylan 1,4-beta-xylosidase  26.4 
 
 		 512 aa  117  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.727016  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0114  glycoside hydrolase family 39  25.81 
 
 		 544 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.747279  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0170  Xylan 1,4-beta-xylosidase  29.78 
 
 		 611 aa  114  5e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.268815  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2398  Xylan 1,4-beta-xylosidase  25.32 
 
 		 519 aa  112  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.274955  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0820  Xylan 1,4-beta-xylosidase  25.1 
 
 		 550 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3822  Xylan 1,4-beta-xylosidase  23.81 
 
 		 518 aa  111  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163293  normal  0.112071 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7193  glycoside hydrolase family 39  23.05 
 
 		 548 aa  103  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0114061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0695  glycoside hydrolase family protein  30.33 
 
 		 466 aa  57  0.0000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.251112  normal  0.0214921 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3494  hypothetical protein  33.33 
 
 		 494 aa  54.7  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00694857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2530  glycoside hydrolase family 39  32.91 
 
 		 864 aa  47.8  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2529  Carbohydrate-binding family 9  38.24 
 
 		 1141 aa  47.4  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3764  hypothetical protein  29.32 
 
 		 605 aa  44.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4299  hypothetical protein  36.36 
 
 		 662 aa  43.5  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3044  hypothetical protein  47.06 
 
 		 369 aa  43.5  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.139878  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>