33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7193 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_7193  glycoside hydrolase family 39  100 
 
 		 548 aa  1140    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0114061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0114  glycoside hydrolase family 39  42.03 
 
 		 544 aa  399  9.999999999999999e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.747279  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0820  Xylan 1,4-beta-xylosidase  38.66 
 
 		 550 aa  388  1e-106  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1297  glycoside hydrolase family 39  35.12 
 
 		 523 aa  300  5e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1259  glycoside hydrolase family 39  32.25 
 
 		 501 aa  281  2e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3134  glycoside hydrolase family protein  31.48 
 
 		 477 aa  276  5e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2705  glycoside hydrolase family 39  32.17 
 
 		 503 aa  276  5e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0776  glycoside hydrolase family protein  33.79 
 
 		 523 aa  263  6e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0184  Xylan 1,4-beta-xylosidase  30.25 
 
 		 501 aa  262  2e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3132  xylan 1,4-beta-xylosidase  31.94 
 
 		 530 aa  258  2e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.297531 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0187  glycoside hydrolase family 39  36.83 
 
 		 388 aa  248  2e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33180  beta-xylosidase  31.74 
 
 		 520 aa  243  5e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0737494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2663  Xylan 1,4-beta-xylosidase  31.58 
 
 		 510 aa  241  2e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0370  Xylan 1,4-beta-xylosidase  31.66 
 
 		 509 aa  240  4e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.809464  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2997  Xylan 1,4-beta-xylosidase  29.57 
 
 		 514 aa  228  2e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.864666 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2398  Xylan 1,4-beta-xylosidase  31.06 
 
 		 519 aa  227  5.0000000000000005e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.274955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3822  Xylan 1,4-beta-xylosidase  29.52 
 
 		 518 aa  221  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163293  normal  0.112071 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1978  Xylan 1,4-beta-xylosidase  30.93 
 
 		 512 aa  218  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.727016  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0170  Xylan 1,4-beta-xylosidase  30.68 
 
 		 611 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.268815  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1539  glycoside hydrolase family 39  27.68 
 
 		 578 aa  115  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.262725 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1362  glycoside hydrolase family protein  27.27 
 
 		 557 aa  110  6e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1416  glycoside hydrolase family 39  23.11 
 
 		 557 aa  109  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.336596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5268  glycoside hydrolase family 39  23.05 
 
 		 561 aa  103  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3934  glycoside hydrolase family 39  33.82 
 
 		 576 aa  103  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.346873 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3952  glycoside hydrolase family 39  26.61 
 
 		 542 aa  98.6  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5150  glycoside hydrolase family 39  33.33 
 
 		 566 aa  94.4  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0964315  hitchhiker  0.00110099 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0695  glycoside hydrolase family protein  24.45 
 
 		 466 aa  68.6  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.251112  normal  0.0214921 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2530  glycoside hydrolase family 39  33.33 
 
 		 864 aa  52.8  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1432  AraC family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 686 aa  51.6  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00438113  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1698  AraC family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 686 aa  51.6  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000348751  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2001  hypothetical protein  25.38 
 
 		 596 aa  50.1  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.021099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4606  hypothetical protein  24.85 
 
 		 584 aa  47.8  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000237555  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2759  glycoside hydrolase family protein  23.38 
 
 		 437 aa  43.9  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>