33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0187 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_0187  glycoside hydrolase family 39  100 
 
 		 388 aa  805    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3134  glycoside hydrolase family protein  52.69 
 
 		 477 aa  394  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0776  glycoside hydrolase family protein  45.66 
 
 		 523 aa  335  1e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1297  glycoside hydrolase family 39  42.09 
 
 		 523 aa  315  9.999999999999999e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3132  xylan 1,4-beta-xylosidase  39.66 
 
 		 530 aa  275  7e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.297531 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2705  glycoside hydrolase family 39  40.06 
 
 		 503 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2663  Xylan 1,4-beta-xylosidase  39.17 
 
 		 510 aa  273  5.000000000000001e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0370  Xylan 1,4-beta-xylosidase  39.17 
 
 		 509 aa  273  5.000000000000001e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.809464  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3822  Xylan 1,4-beta-xylosidase  38.36 
 
 		 518 aa  270  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163293  normal  0.112071 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0820  Xylan 1,4-beta-xylosidase  37.82 
 
 		 550 aa  269  5.9999999999999995e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33180  beta-xylosidase  38.21 
 
 		 520 aa  268  1e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0737494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1259  glycoside hydrolase family 39  38.97 
 
 		 501 aa  266  2.9999999999999995e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1978  Xylan 1,4-beta-xylosidase  39.01 
 
 		 512 aa  264  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.727016  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0184  Xylan 1,4-beta-xylosidase  39.06 
 
 		 501 aa  261  1e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2997  Xylan 1,4-beta-xylosidase  38.23 
 
 		 514 aa  258  1e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.864666 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0114  glycoside hydrolase family 39  38.39 
 
 		 544 aa  256  6e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.747279  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2398  Xylan 1,4-beta-xylosidase  35.57 
 
 		 519 aa  252  8.000000000000001e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.274955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7193  glycoside hydrolase family 39  36.83 
 
 		 548 aa  248  1e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0114061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0170  Xylan 1,4-beta-xylosidase  34.39 
 
 		 611 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.268815  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1416  glycoside hydrolase family 39  25.99 
 
 		 557 aa  129  8.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.336596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5268  glycoside hydrolase family 39  27.94 
 
 		 561 aa  119  9e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5150  glycoside hydrolase family 39  26.32 
 
 		 566 aa  118  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0964315  hitchhiker  0.00110099 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3934  glycoside hydrolase family 39  26.26 
 
 		 576 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.346873 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3952  glycoside hydrolase family 39  24.63 
 
 		 542 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1539  glycoside hydrolase family 39  25.14 
 
 		 578 aa  101  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.262725 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1362  glycoside hydrolase family protein  32 
 
 		 557 aa  101  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2530  glycoside hydrolase family 39  30.17 
 
 		 864 aa  55.1  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0695  glycoside hydrolase family protein  22.93 
 
 		 466 aa  52  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.251112  normal  0.0214921 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1040  hypothetical protein  27.39 
 
 		 614 aa  47.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.367897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4299  hypothetical protein  24.23 
 
 		 662 aa  45.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1931  hypothetical protein  23.51 
 
 		 429 aa  45.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00823138  normal  0.409118 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3601  hypothetical protein  25.27 
 
 		 465 aa  44.7  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.801511  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0790  hypothetical protein  24.38 
 
 		 460 aa  44.7  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>