35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2705 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2705  glycoside hydrolase family 39  100 
 
 		 503 aa  1043    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0184  Xylan 1,4-beta-xylosidase  60.66 
 
 		 501 aa  654    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1259  glycoside hydrolase family 39  62.28 
 
 		 501 aa  677    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2997  Xylan 1,4-beta-xylosidase  50 
 
 		 514 aa  517  1.0000000000000001e-145  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.864666 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33180  beta-xylosidase  49.71 
 
 		 520 aa  510  1e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0737494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3822  Xylan 1,4-beta-xylosidase  49.18 
 
 		 518 aa  505  9.999999999999999e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163293  normal  0.112071 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1978  Xylan 1,4-beta-xylosidase  47.21 
 
 		 512 aa  485  1e-136  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.727016  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2398  Xylan 1,4-beta-xylosidase  44.98 
 
 		 519 aa  457  1e-127  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.274955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2663  Xylan 1,4-beta-xylosidase  44.79 
 
 		 510 aa  449  1e-125  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0370  Xylan 1,4-beta-xylosidase  44.79 
 
 		 509 aa  447  1.0000000000000001e-124  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.809464  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1297  glycoside hydrolase family 39  39.46 
 
 		 523 aa  332  9e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0776  glycoside hydrolase family protein  43.82 
 
 		 523 aa  327  4.0000000000000003e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0114  glycoside hydrolase family 39  35.7 
 
 		 544 aa  306  4.0000000000000004e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.747279  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3134  glycoside hydrolase family protein  36.34 
 
 		 477 aa  299  8e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0820  Xylan 1,4-beta-xylosidase  34.09 
 
 		 550 aa  289  8e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3132  xylan 1,4-beta-xylosidase  33.73 
 
 		 530 aa  284  3.0000000000000004e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.297531 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7193  glycoside hydrolase family 39  32.17 
 
 		 548 aa  276  4e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0114061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0187  glycoside hydrolase family 39  40.06 
 
 		 388 aa  274  3e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0170  Xylan 1,4-beta-xylosidase  35.99 
 
 		 611 aa  200  6e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.268815  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5268  glycoside hydrolase family 39  28.35 
 
 		 561 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5150  glycoside hydrolase family 39  28.06 
 
 		 566 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0964315  hitchhiker  0.00110099 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3934  glycoside hydrolase family 39  26.13 
 
 		 576 aa  154  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.346873 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1539  glycoside hydrolase family 39  26.28 
 
 		 578 aa  149  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.262725 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1416  glycoside hydrolase family 39  24.75 
 
 		 557 aa  144  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.336596  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3952  glycoside hydrolase family 39  24.44 
 
 		 542 aa  141  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1362  glycoside hydrolase family protein  25.25 
 
 		 557 aa  136  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0695  glycoside hydrolase family protein  28.29 
 
 		 466 aa  93.6  8e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.251112  normal  0.0214921 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2530  glycoside hydrolase family 39  28.05 
 
 		 864 aa  58.5  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2109  Carbohydrate-binding family 9  26.92 
 
 		 1276 aa  53.9  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000203571  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1432  AraC family transcriptional regulator  22.68 
 
 		 686 aa  52.8  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00438113  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1698  AraC family transcriptional regulator  22.63 
 
 		 686 aa  53.1  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000348751  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6399  glycoside hydrolase family 5  27.91 
 
 		 415 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.337804 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2607  hypothetical protein  25 
 
 		 755 aa  48.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.459804 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0356  hypothetical protein  28.91 
 
 		 369 aa  47.4  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000129825  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0790  hypothetical protein  23.86 
 
 		 460 aa  45.8  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>