32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3934 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3934  glycoside hydrolase family 39  100 
 
 		 576 aa  1195    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.346873 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1416  glycoside hydrolase family 39  58.92 
 
 		 557 aa  673    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.336596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5268  glycoside hydrolase family 39  63.94 
 
 		 561 aa  744    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5150  glycoside hydrolase family 39  62.01 
 
 		 566 aa  729    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0964315  hitchhiker  0.00110099 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1362  glycoside hydrolase family protein  55.47 
 
 		 557 aa  630  1e-179  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3952  glycoside hydrolase family 39  49.07 
 
 		 542 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1539  glycoside hydrolase family 39  34.31 
 
 		 578 aa  321  1.9999999999999998e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.262725 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0184  Xylan 1,4-beta-xylosidase  28.69 
 
 		 501 aa  169  1e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1259  glycoside hydrolase family 39  27.25 
 
 		 501 aa  158  3e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2705  glycoside hydrolase family 39  26.13 
 
 		 503 aa  154  4e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0776  glycoside hydrolase family protein  26.49 
 
 		 523 aa  152  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0370  Xylan 1,4-beta-xylosidase  26.06 
 
 		 509 aa  147  6e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.809464  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2663  Xylan 1,4-beta-xylosidase  26.06 
 
 		 510 aa  145  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2997  Xylan 1,4-beta-xylosidase  26.35 
 
 		 514 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.864666 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2398  Xylan 1,4-beta-xylosidase  28.12 
 
 		 519 aa  133  1.0000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.274955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3132  xylan 1,4-beta-xylosidase  28.02 
 
 		 530 aa  132  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.297531 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33180  beta-xylosidase  27.05 
 
 		 520 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0737494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1297  glycoside hydrolase family 39  23.4 
 
 		 523 aa  124  4e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3134  glycoside hydrolase family protein  24.25 
 
 		 477 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0170  Xylan 1,4-beta-xylosidase  26.8 
 
 		 611 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.268815  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0114  glycoside hydrolase family 39  25.21 
 
 		 544 aa  119  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.747279  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0187  glycoside hydrolase family 39  26.26 
 
 		 388 aa  118  3.9999999999999997e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1978  Xylan 1,4-beta-xylosidase  23.71 
 
 		 512 aa  115  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.727016  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0820  Xylan 1,4-beta-xylosidase  24.84 
 
 		 550 aa  110  8.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3822  Xylan 1,4-beta-xylosidase  23.21 
 
 		 518 aa  108  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163293  normal  0.112071 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7193  glycoside hydrolase family 39  33.82 
 
 		 548 aa  103  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0114061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0695  glycoside hydrolase family protein  28.65 
 
 		 466 aa  60.1  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.251112  normal  0.0214921 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2530  glycoside hydrolase family 39  25.88 
 
 		 864 aa  55.1  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1040  hypothetical protein  27.9 
 
 		 614 aa  47  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.367897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6399  glycoside hydrolase family 5  37.33 
 
 		 415 aa  45.8  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.337804 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3764  hypothetical protein  29.21 
 
 		 605 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3494  hypothetical protein  29.9 
 
 		 494 aa  45.8  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00694857  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>