16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2650 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2650  agarase  100 
 
 		 787 aa  1615    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000351829  normal  0.0319277 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1904  agarase  46.98 
 
 		 688 aa  616  1e-175  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.407826  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2341  agarase  39.78 
 
 		 1171 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.384937  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2655  agarase  29.89 
 
 		 1335 aa  288  4e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0452542  normal  0.27666 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0839  Ig-like, group 2  29.71 
 
 		 983 aa  182  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1299  hypothetical protein  39.29 
 
 		 195 aa  69.7  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2914  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  34.81 
 
 		 1035 aa  65.9  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1383  FeS assembly protein SufD  28.03 
 
 		 162 aa  64.3  0.000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000313587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0097  hypothetical protein  36.76 
 
 		 225 aa  59.7  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000943879  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0050  hypothetical protein  27.13 
 
 		 528 aa  58.9  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.606675  normal  0.906839 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1646  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 341 aa  58.2  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.651021  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2598  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.65 
 
 		 691 aa  56.2  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0582843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2747  hypothetical protein  34.31 
 
 		 140 aa  56.6  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.751258  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3186  hypothetical protein  36.54 
 
 		 255 aa  51.6  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000364284  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1076  hypothetical protein  37.11 
 
 		 256 aa  51.2  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  4.83756e-35 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2530  glycoside hydrolase family 39  29.73 
 
 		 864 aa  45.4  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>