24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0839 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0839  Ig-like, group 2  100 
 
 		 983 aa  2029    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1904  agarase  26.66 
 
 		 688 aa  189  3e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.407826  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2650  agarase  29.71 
 
 		 787 aa  182  2.9999999999999997e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000351829  normal  0.0319277 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2341  agarase  26.54 
 
 		 1171 aa  170  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.384937  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2655  agarase  27.93 
 
 		 1335 aa  112  5e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0452542  normal  0.27666 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18640  calcineurin-like phosphoesterase  38.78 
 
 		 1732 aa  60.1  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.993356 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  30.17 
 
 		 2638 aa  56.6  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  30.11 
 
 		 1821 aa  54.7  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0685  Ig domain protein group 2 domain protein  25.95 
 
 		 437 aa  54.7  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  27.08 
 
 		 1009 aa  53.1  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4476  Ig domain protein group 2 domain protein  32.89 
 
 		 570 aa  53.9  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3203  Ig domain-containing protein  24.59 
 
 		 981 aa  52.4  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3484  Ig domain protein group 2 domain protein  34.86 
 
 		 526 aa  51.6  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0056  Ig-like, group 2  32.56 
 
 		 4630 aa  50.8  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1962  Ig domain protein group 2 domain protein  33.73 
 
 		 556 aa  50.1  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577426  normal  0.0531798 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2364  S-layer domain protein  37.7 
 
 		 1421 aa  49.7  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00153299  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3488  Ig domain protein group 2 domain protein  36.84 
 
 		 428 aa  47.4  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0080  Ig-like domain-containing protein  31.76 
 
 		 220 aa  47  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2500  Ig domain-containing protein  34.78 
 
 		 1300 aa  46.6  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1966  hypothetical protein  32.95 
 
 		 524 aa  46.6  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4979  Carbohydrate-binding family 9  29.79 
 
 		 1418 aa  46.6  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.502529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0948  Ig domain-containing protein  28.1 
 
 		 129 aa  46.2  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000631459  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2198  phage tail protein  37.35 
 
 		 306 aa  45.4  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2120  Ig domain protein group 2 domain protein  32.5 
 
 		 1831 aa  45.1  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>