24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0944 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0944  hypothetical protein  100 
 
 
718 aa  1469    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0361  hypothetical protein  31.77 
 
 
480 aa  158  3e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1533  hypothetical protein  28.78 
 
 
424 aa  125  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1730  hypothetical protein  28.78 
 
 
424 aa  125  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000064452 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1640  hypothetical protein  28.78 
 
 
424 aa  125  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3891  hypothetical protein  25.96 
 
 
703 aa  91.3  6e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1200  hypothetical protein  28.7 
 
 
348 aa  88.6  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1622  hypothetical protein  27.02 
 
 
360 aa  67.4  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.681183  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2270  hypothetical protein  22.88 
 
 
672 aa  65.5  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.417256  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5603  glycosyltransferase  22.25 
 
 
364 aa  64.3  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.183412  normal  0.950929 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3115  hypothetical protein  25.23 
 
 
337 aa  62  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1455  glycosyl transferase group 1  24.15 
 
 
759 aa  59.3  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.402299  normal  0.663839 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7536  glycosyl transferase group 1  41.79 
 
 
762 aa  57.8  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961442  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2530  glycoside hydrolase family 39  25.56 
 
 
864 aa  56.6  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4312  glycosyl transferase, group 1  24.5 
 
 
756 aa  56.2  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49569  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0783  glycosyltransferase  27.85 
 
 
404 aa  54.7  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.482662  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1363  glycosyl transferase group 1  27.63 
 
 
774 aa  54.7  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.744845  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5161  glycosyl transferase group 1  23.51 
 
 
747 aa  53.1  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.510872  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0865  glycosyl transferase, group 1  24.13 
 
 
763 aa  50.1  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.926448  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5409  glycosyl hydrolase family 88  40.98 
 
 
376 aa  48.9  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000034973  normal  0.118478 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2506  glycosyl transferase group 1  32.58 
 
 
774 aa  48.1  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5215  putative glycosyltransferase  34.51 
 
 
340 aa  47.8  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.191261  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1053  putative glycosyltransferase  40.91 
 
 
340 aa  47.4  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1785  hypothetical protein  23.81 
 
 
349 aa  45.4  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>