29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3891 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3891  hypothetical protein  100 
 
 
703 aa  1392    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2270  hypothetical protein  50.92 
 
 
672 aa  552  1e-155  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.417256  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0361  hypothetical protein  33 
 
 
480 aa  157  4e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1640  hypothetical protein  27.5 
 
 
424 aa  117  8.999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1533  hypothetical protein  27.5 
 
 
424 aa  117  8.999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1730  hypothetical protein  27.5 
 
 
424 aa  117  8.999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000064452 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0944  hypothetical protein  25.96 
 
 
718 aa  90.9  7e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1200  hypothetical protein  23.24 
 
 
348 aa  70.5  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4312  glycosyl transferase, group 1  23.31 
 
 
756 aa  65.1  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49569  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5161  glycosyl transferase group 1  21.47 
 
 
747 aa  59.3  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.510872  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0284  glycosyl transferase group 1  24.46 
 
 
780 aa  59.7  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1455  glycosyl transferase group 1  22.34 
 
 
759 aa  56.6  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.402299  normal  0.663839 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1363  glycosyl transferase group 1  51.02 
 
 
774 aa  57  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.744845  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5603  glycosyltransferase  25.76 
 
 
364 aa  53.5  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.183412  normal  0.950929 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1622  hypothetical protein  50 
 
 
360 aa  53.1  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.681183  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5215  putative glycosyltransferase  42.86 
 
 
340 aa  52  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.191261  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1241  hypothetical protein  26.48 
 
 
371 aa  49.7  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0783  glycosyltransferase  35.29 
 
 
404 aa  49.3  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.482662  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3440  mannosyltransferase  29.32 
 
 
348 aa  47.4  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.106882  normal  0.942853 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5324  glycosyltransferase  38.24 
 
 
759 aa  47.4  0.0009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1162  glycosyl transferase group 1  26.7 
 
 
790 aa  47.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0361  hypothetical protein  48.89 
 
 
378 aa  46.2  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1236  glycosyl transferase group 1  27.86 
 
 
765 aa  45.8  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0543  hypothetical protein  54.35 
 
 
338 aa  46.2  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.539162  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1449  glycosyl transferase  21.81 
 
 
353 aa  45.4  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0865  glycosyl transferase, group 1  41.82 
 
 
763 aa  45.8  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.926448  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1053  putative glycosyltransferase  47.92 
 
 
340 aa  45.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3138  glycosyltransferase (group I)  32 
 
 
797 aa  45.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.150629  normal  0.748341 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3115  hypothetical protein  25.17 
 
 
337 aa  44.7  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>