36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_3115 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_3115  hypothetical protein  100 
 
 		 337 aa  699    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1449  glycosyl transferase  53.85 
 
 		 353 aa  395  1e-109  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1785  hypothetical protein  53.2 
 
 		 349 aa  390  1e-107  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1622  hypothetical protein  42.94 
 
 		 360 aa  306  5.0000000000000004e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.681183  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1455  glycosyl transferase group 1  42.25 
 
 		 759 aa  273  3e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.402299  normal  0.663839 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5161  glycosyl transferase group 1  38.74 
 
 		 747 aa  261  2e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.510872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1363  glycosyl transferase group 1  39.82 
 
 		 774 aa  252  8.000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.744845  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5603  glycosyltransferase  40.06 
 
 		 364 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.183412  normal  0.950929 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0865  glycosyl transferase, group 1  37.35 
 
 		 763 aa  238  2e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.926448  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0284  glycosyl transferase group 1  37.57 
 
 		 780 aa  230  2e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1241  hypothetical protein  38.53 
 
 		 371 aa  225  1e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1162  glycosyl transferase group 1  36.07 
 
 		 790 aa  224  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1236  glycosyl transferase group 1  35.48 
 
 		 765 aa  220  3e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0361  hypothetical protein  35.16 
 
 		 378 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5324  glycosyltransferase  37.32 
 
 		 759 aa  211  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2577  glycosyl transferase, group 1  35.5 
 
 		 767 aa  209  5e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.161849  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1917  hypothetical protein  35.38 
 
 		 339 aa  208  1e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0783  glycosyltransferase  33.33 
 
 		 404 aa  206  3e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.482662  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3138  glycosyltransferase (group I)  31.92 
 
 		 797 aa  202  9e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.150629  normal  0.748341 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4312  glycosyl transferase, group 1  35.19 
 
 		 756 aa  193  4e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49569  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1060  glycosyl transferase group 1  34.62 
 
 		 789 aa  187  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126752 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0740  glycosyl transferase, group 1  33.13 
 
 		 823 aa  177  3e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0925  glycosyl transferase, group 1  33.43 
 
 		 761 aa  171  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.259199  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0543  hypothetical protein  29.91 
 
 		 338 aa  157  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.539162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3440  mannosyltransferase  29.79 
 
 		 348 aa  145  8.000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.106882  normal  0.942853 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7536  glycosyl transferase group 1  29.83 
 
 		 762 aa  144  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961442  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1965  hypothetical protein  29.54 
 
 		 367 aa  138  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2506  glycosyl transferase group 1  28.49 
 
 		 774 aa  138  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5215  putative glycosyltransferase  27.41 
 
 		 340 aa  126  6e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.191261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1053  putative glycosyltransferase  29.04 
 
 		 340 aa  125  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3375  glycosyl transferase  28.97 
 
 		 351 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000640117  hitchhiker  0.00216931 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0361  hypothetical protein  24.19 
 
 		 480 aa  70.1  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3542  hypothetical protein  25.97 
 
 		 357 aa  68.9  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000965679  normal  0.103099 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0944  hypothetical protein  25.23 
 
 		 718 aa  62  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1200  hypothetical protein  24.75 
 
 		 348 aa  56.6  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3891  hypothetical protein  25.17 
 
 		 703 aa  44.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>