More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5161 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_5161  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
747 aa  1547    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.510872  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1455  glycosyl transferase group 1  53.37 
 
 
759 aa  836    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.402299  normal  0.663839 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1363  glycosyl transferase group 1  42.72 
 
 
774 aa  618  1e-175  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.744845  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0865  glycosyl transferase, group 1  41.89 
 
 
763 aa  614  9.999999999999999e-175  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.926448  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1236  glycosyl transferase group 1  41.32 
 
 
765 aa  580  1e-164  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1162  glycosyl transferase group 1  41.43 
 
 
790 aa  567  1e-160  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3138  glycosyltransferase (group I)  39.52 
 
 
797 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.150629  normal  0.748341 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0284  glycosyl transferase group 1  38.8 
 
 
780 aa  544  1e-153  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1060  glycosyl transferase group 1  38.26 
 
 
789 aa  525  1e-147  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126752 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5324  glycosyltransferase  38.19 
 
 
759 aa  512  1e-144  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0925  glycosyl transferase, group 1  39.18 
 
 
761 aa  513  1e-144  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.259199  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0740  glycosyl transferase, group 1  38.24 
 
 
823 aa  499  1e-140  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2577  glycosyl transferase, group 1  37.36 
 
 
767 aa  461  9.999999999999999e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.161849  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7536  glycosyl transferase group 1  33.55 
 
 
762 aa  388  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961442  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2506  glycosyl transferase group 1  32.18 
 
 
774 aa  388  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4312  glycosyl transferase, group 1  31.68 
 
 
756 aa  376  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49569  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1450  glycosyl transferase group 1  41.87 
 
 
411 aa  316  9e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.925912  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1623  glycosyl transferase group 1  38.7 
 
 
386 aa  310  6.999999999999999e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0932889  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5603  glycosyltransferase  41.33 
 
 
364 aa  302  2e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.183412  normal  0.950929 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1916  glycosyltransferase  39.02 
 
 
390 aa  297  4e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1786  glycosyl transferase, group 1  39.63 
 
 
391 aa  296  7e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3114  glycosyl transferase, group 1  39.78 
 
 
391 aa  294  4e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1785  hypothetical protein  40.84 
 
 
349 aa  283  1e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1449  glycosyl transferase  43.32 
 
 
353 aa  277  4e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0360  glycosyl transferase group 1  36.68 
 
 
405 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1240  glycosyl transferase group 1  36.63 
 
 
395 aa  270  5e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1622  hypothetical protein  39.59 
 
 
360 aa  268  2e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.681183  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3115  hypothetical protein  38.74 
 
 
337 aa  261  5.0000000000000005e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0782  glycosyl transferase group 1  34.47 
 
 
397 aa  258  4e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215442  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3438  glycosyl transferase group 1  34.46 
 
 
416 aa  238  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.908331 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5602  glycosyl transferase group 1  35.29 
 
 
399 aa  221  5e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115159  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7428  glycosyl transferase group 1  33.95 
 
 
388 aa  208  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.223976  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0361  hypothetical protein  34.38 
 
 
378 aa  207  7e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5224  glycosyl transferase, group 1  31.03 
 
 
393 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1241  hypothetical protein  36.09 
 
 
371 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5289  glycosyl transferase group 1  33.6 
 
 
405 aa  197  5.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213842  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5216  glycosyl transferase, group 1  30.67 
 
 
392 aa  192  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.088872  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3376  glycosyl transferase group 1  32.05 
 
 
399 aa  191  5e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000624508  hitchhiker  0.000924483 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1052  glycosyl transferase, group 1  31.4 
 
 
371 aa  189  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1042  glycosyl transferase, group 1  29.29 
 
 
378 aa  188  3e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0783  glycosyltransferase  32.23 
 
 
404 aa  187  8e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.482662  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0542  glycosyl transferase group 1  31.46 
 
 
414 aa  176  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0790  glycosyl transferase, group 1  34.58 
 
 
393 aa  175  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0785  glycosyl transferase, group 1  34.58 
 
 
393 aa  175  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.967061 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0804  glycosyl transferase, group 1  34.58 
 
 
393 aa  175  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.26617  normal  0.0900137 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1917  hypothetical protein  30.45 
 
 
339 aa  172  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3440  mannosyltransferase  34.38 
 
 
348 aa  171  5e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.106882  normal  0.942853 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0543  hypothetical protein  31.6 
 
 
338 aa  147  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.539162  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3375  glycosyl transferase  31.79 
 
 
351 aa  144  8e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000640117  hitchhiker  0.00216931 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1965  hypothetical protein  30.99 
 
 
367 aa  140  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1053  putative glycosyltransferase  28.45 
 
 
340 aa  131  6e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5215  putative glycosyltransferase  28.49 
 
 
340 aa  118  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.191261  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3542  hypothetical protein  24.92 
 
 
357 aa  94  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000965679  normal  0.103099 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35680  hypothetical protein  26.74 
 
 
395 aa  87  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000110612 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3005  hypothetical protein  25.95 
 
 
395 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.036404  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1868  glycosyl transferase  22.98 
 
 
375 aa  81.3  0.00000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4283  glycosyl transferase, group 1  26.13 
 
 
396 aa  78.6  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00772283 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0582  glycosyl transferase group 1  23.14 
 
 
374 aa  72.8  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.838889  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  25.26 
 
 
383 aa  72.8  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0255  glycosyl transferase group 1  27.84 
 
 
358 aa  72.4  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  23.7 
 
 
395 aa  71.2  0.00000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2075  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
381 aa  71.2  0.00000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1096  glycosyl transferase group 1  27.54 
 
 
392 aa  71.2  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.767278  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0627  UDP-N-acetylglucosamine  24.56 
 
 
438 aa  68.9  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3533  glycosyl transferase, group 1 family protein PslF  26.7 
 
 
392 aa  68.6  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0609585  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2715  glycosyl transferase group 1  23.17 
 
 
375 aa  68.2  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21071  hypothetical protein  21.75 
 
 
1232 aa  67.8  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0029  glycosyltransferase  25.82 
 
 
392 aa  67.4  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000827208  hitchhiker  0.00854387 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  23.62 
 
 
419 aa  67.8  0.0000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3353  glycosyl transferase group 1  29.78 
 
 
381 aa  67  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.207762  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5094  glycosyl transferase group 1  23.02 
 
 
382 aa  67  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0361  hypothetical protein  23.7 
 
 
480 aa  67  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  22.55 
 
 
380 aa  67  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  29.52 
 
 
415 aa  66.2  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  24.41 
 
 
398 aa  66.6  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  21.45 
 
 
408 aa  66.6  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0821  glycosyl transferase group 1  25.75 
 
 
351 aa  65.9  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.534399  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0566  glycosyl transferase, group 1  23.08 
 
 
361 aa  65.9  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3942  glycosyl transferase group 1  24.18 
 
 
395 aa  65.1  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.484579  normal  0.520896 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3735  glycosyl transferase group 1  22.42 
 
 
355 aa  65.1  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4841  glycosyl transferase, group 1  24.65 
 
 
374 aa  65.1  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000142373  normal  0.0561788 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1200  hypothetical protein  20.39 
 
 
348 aa  65.1  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1181  glycosyl transferase group 1  22.97 
 
 
395 aa  64.7  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.192716  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2856  glycosyl transferase, group 1  23.21 
 
 
388 aa  64.3  0.000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.258995 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1730  hypothetical protein  23.23 
 
 
424 aa  63.5  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000064452 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1640  hypothetical protein  23.23 
 
 
424 aa  63.5  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1533  hypothetical protein  23.23 
 
 
424 aa  63.5  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  23.88 
 
 
672 aa  63.9  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22800  glycosyl transferase group 1  25.13 
 
 
359 aa  63.5  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3305  glycosyl transferase, group 1  22.25 
 
 
392 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0317499  normal  0.753589 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1151  glycosyl transferase group 1  22.06 
 
 
395 aa  63.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1486  glycosyl transferase group 1  24.09 
 
 
396 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  22.63 
 
 
384 aa  63.2  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1514  glycosyl transferase group 1  24.09 
 
 
396 aa  63.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.426668  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3834  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  26.13 
 
 
376 aa  62.4  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0382059 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0494  UDP-N-acetylglucosamine  24.66 
 
 
428 aa  62.4  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1977  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.74 
 
 
443 aa  62  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26927  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1287  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.74 
 
 
443 aa  62  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2262  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.74 
 
 
495 aa  61.6  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0998  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.74 
 
 
499 aa  61.6  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>