More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5289 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5289  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
405 aa  798    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213842  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7428  glycosyl transferase group 1  56.22 
 
 
388 aa  370  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.223976  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5216  glycosyl transferase, group 1  50.13 
 
 
392 aa  325  7e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.088872  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0542  glycosyl transferase group 1  49.38 
 
 
414 aa  325  1e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1052  glycosyl transferase, group 1  51.47 
 
 
371 aa  320  3e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3376  glycosyl transferase group 1  48.32 
 
 
399 aa  311  1e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000624508  hitchhiker  0.000924483 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1042  glycosyl transferase, group 1  46.51 
 
 
378 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5224  glycosyl transferase, group 1  46.76 
 
 
393 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0790  glycosyl transferase, group 1  47.11 
 
 
393 aa  296  6e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0804  glycosyl transferase, group 1  47.11 
 
 
393 aa  296  6e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.26617  normal  0.0900137 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0785  glycosyl transferase, group 1  46.56 
 
 
393 aa  295  8e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.967061 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1363  glycosyl transferase group 1  35.42 
 
 
774 aa  216  5e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.744845  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1450  glycosyl transferase group 1  30.61 
 
 
411 aa  211  1e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.925912  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1162  glycosyl transferase group 1  35.6 
 
 
790 aa  211  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5161  glycosyl transferase group 1  33.6 
 
 
747 aa  210  5e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.510872  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0865  glycosyl transferase, group 1  34.88 
 
 
763 aa  207  2e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.926448  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3114  glycosyl transferase, group 1  33.07 
 
 
391 aa  206  7e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0284  glycosyl transferase group 1  34.95 
 
 
780 aa  204  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1916  glycosyltransferase  31.33 
 
 
390 aa  204  3e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5324  glycosyltransferase  34.35 
 
 
759 aa  202  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1623  glycosyl transferase group 1  29.51 
 
 
386 aa  199  6e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0932889  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1786  glycosyl transferase, group 1  30.93 
 
 
391 aa  197  3e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1060  glycosyl transferase group 1  34.35 
 
 
789 aa  193  4e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126752 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1236  glycosyl transferase group 1  34.41 
 
 
765 aa  191  2e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3438  glycosyl transferase group 1  37.04 
 
 
416 aa  190  4e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.908331 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3138  glycosyltransferase (group I)  28.68 
 
 
797 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.150629  normal  0.748341 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2506  glycosyl transferase group 1  33.66 
 
 
774 aa  189  7e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0360  glycosyl transferase group 1  32.72 
 
 
405 aa  186  6e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0925  glycosyl transferase, group 1  34.25 
 
 
761 aa  186  9e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.259199  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0740  glycosyl transferase, group 1  33.98 
 
 
823 aa  184  3e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1240  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 
395 aa  184  3e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1455  glycosyl transferase group 1  31.79 
 
 
759 aa  184  3e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.402299  normal  0.663839 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2577  glycosyl transferase, group 1  34.25 
 
 
767 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.161849  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0782  glycosyl transferase group 1  29.19 
 
 
397 aa  163  6e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215442  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7536  glycosyl transferase group 1  32.89 
 
 
762 aa  162  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961442  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5602  glycosyl transferase group 1  27.34 
 
 
399 aa  153  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115159  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4312  glycosyl transferase, group 1  27.01 
 
 
756 aa  152  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49569  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0095  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
378 aa  85.1  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1787  glycosyl transferase group 1  30.67 
 
 
401 aa  81.3  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0817969  normal  0.0689029 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4283  glycosyl transferase, group 1  28.9 
 
 
396 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00772283 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3533  glycosyl transferase, group 1 family protein PslF  25.51 
 
 
392 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0609585  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2015  glycosyl transferase, group 1  27.37 
 
 
382 aa  77  0.0000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1080  glycosyl transferase group 1  31 
 
 
394 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.184829  normal  0.928063 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2571  glycosyl transferase group 1  36.54 
 
 
386 aa  74.7  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  32.07 
 
 
370 aa  73.9  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  23.24 
 
 
401 aa  71.2  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  30.12 
 
 
423 aa  71.6  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
379 aa  69.7  0.00000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0723  glycosyltransferase-like protein  28.08 
 
 
396 aa  69.7  0.00000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1149  glycosyl transferase group 1  31.03 
 
 
389 aa  68.2  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0582  glycosyl transferase group 1  24 
 
 
374 aa  68.2  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.838889  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  34.91 
 
 
420 aa  67.8  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2826  glycosyl transferase group 1  31.14 
 
 
414 aa  67.8  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3305  glycosyl transferase, group 1  25.76 
 
 
392 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0317499  normal  0.753589 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2777  glycosyl transferase, group 1  29.07 
 
 
382 aa  67  0.0000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  26.64 
 
 
369 aa  67  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  27.19 
 
 
672 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3942  glycosyl transferase group 1  36.81 
 
 
395 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.484579  normal  0.520896 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  29.62 
 
 
410 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3547  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  26.89 
 
 
393 aa  65.5  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  26.14 
 
 
419 aa  63.5  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2472  glycosyl transferase group 1  28.05 
 
 
419 aa  63.5  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  26.56 
 
 
435 aa  63.2  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3353  glycosyl transferase group 1  36.31 
 
 
381 aa  63.2  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.207762  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0898  hypothetical protein  32.77 
 
 
407 aa  62.4  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3213  glycosyl transferase group 1  22.57 
 
 
411 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.312231  normal  0.69629 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2715  glycosyl transferase group 1  26.24 
 
 
375 aa  62.8  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0235  glycosyl transferase group 1  26.78 
 
 
373 aa  62.8  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.118803 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2938  glycosyl transferase, group 1  37.58 
 
 
351 aa  62.8  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  23.21 
 
 
408 aa  62.4  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0869  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  26.09 
 
 
382 aa  62  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000612209  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  23.08 
 
 
427 aa  61.6  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  26.92 
 
 
439 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  26.92 
 
 
439 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  30.06 
 
 
398 aa  62  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  26.92 
 
 
439 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_002936  DET0978  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.65 
 
 
382 aa  61.2  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000355781  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  23.19 
 
 
346 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2695  glycosyl transferase group 1  31.63 
 
 
376 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6234  glycosyl transferase group 1  35.23 
 
 
366 aa  61.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130468  normal  0.465121 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1104  glycosyl transferase, group 1  31.5 
 
 
396 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0552505  hitchhiker  0.00694846 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6393  glycosyl transferase group 1  31.37 
 
 
391 aa  60.8  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.224471 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0676  glycosyl transferase, group 1  27.83 
 
 
396 aa  61.2  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.063849  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2365  glycosyl transferase group 1  23.56 
 
 
364 aa  60.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.230735  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  23.11 
 
 
348 aa  60.5  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  36.46 
 
 
376 aa  60.5  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  25.22 
 
 
396 aa  60.5  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  27.38 
 
 
517 aa  60.1  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3005  hypothetical protein  29.9 
 
 
395 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.036404  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2313  glycosyl transferase group 1  23.56 
 
 
364 aa  60.1  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5252  glycosyl transferase group 1  23.3 
 
 
436 aa  59.7  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4328  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.57 
 
 
381 aa  59.7  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00438832  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1780  mannosyltransferase, putative  24.3 
 
 
1635 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.731336  decreased coverage  0.0078788 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3865  glycosyl transferase group 1  30.48 
 
 
666 aa  59.3  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00141274 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4841  glycosyl transferase, group 1  27.43 
 
 
374 aa  59.3  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000142373  normal  0.0561788 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  29.67 
 
 
396 aa  58.9  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  27.12 
 
 
370 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1176  glycosyl transferase, group 1  29.29 
 
 
349 aa  59.3  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  28.26 
 
 
366 aa  58.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4909  group 1 glycosyl transferase  26.24 
 
 
364 aa  58.2  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>