153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4283 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_4283  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 396 aa  781    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772283 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3533  glycosyl transferase, group 1 family protein PslF  67.19 
 
 		 392 aa  483  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0609585  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3305  glycosyl transferase, group 1  67.27 
 
 		 392 aa  482  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0317499  normal  0.753589 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35680  hypothetical protein  62.89 
 
 		 395 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000110612 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3005  hypothetical protein  63.14 
 
 		 395 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.036404  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1363  glycosyl transferase group 1  26.07 
 
 		 774 aa  99  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.744845  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5224  glycosyl transferase, group 1  27.04 
 
 		 393 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1236  glycosyl transferase group 1  29.97 
 
 		 765 aa  95.9  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0360  glycosyl transferase group 1  25.98 
 
 		 405 aa  94.7  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1042  glycosyl transferase, group 1  27.41 
 
 		 378 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0925  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 761 aa  89  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.259199  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1060  glycosyl transferase group 1  24.76 
 
 		 789 aa  87.8  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126752 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5161  glycosyl transferase group 1  26.04 
 
 		 747 aa  87.4  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.510872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1240  glycosyl transferase group 1  25.25 
 
 		 395 aa  87.4  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5289  glycosyl transferase group 1  28.9 
 
 		 405 aa  83.2  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0284  glycosyl transferase group 1  24.81 
 
 		 780 aa  80.9  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1162  glycosyl transferase group 1  23.78 
 
 		 790 aa  79.7  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3138  glycosyltransferase (group I)  20.95 
 
 		 797 aa  77.8  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.150629  normal  0.748341 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1052  glycosyl transferase, group 1  25.88 
 
 		 371 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1455  glycosyl transferase group 1  21.59 
 
 		 759 aa  75.9  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.402299  normal  0.663839 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0865  glycosyl transferase, group 1  25.95 
 
 		 763 aa  75.5  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.926448  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0782  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 397 aa  72  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215442  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1786  glycosyl transferase, group 1  22.81 
 
 		 391 aa  71.6  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5324  glycosyltransferase  24.41 
 
 		 759 aa  70.1  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3376  glycosyl transferase group 1  26.96 
 
 		 399 aa  69.7  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000624508  hitchhiker  0.000924483 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5216  glycosyl transferase, group 1  23.17 
 
 		 392 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.088872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0790  glycosyl transferase, group 1  28 
 
 		 393 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0804  glycosyl transferase, group 1  28 
 
 		 393 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.26617  normal  0.0900137 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0785  glycosyl transferase, group 1  28 
 
 		 393 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.967061 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3438  glycosyl transferase group 1  23.87 
 
 		 416 aa  66.2  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.908331 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1623  glycosyl transferase group 1  20.27 
 
 		 386 aa  65.9  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0932889  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3114  glycosyl transferase, group 1  24.24 
 
 		 391 aa  65.1  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4609  glycosyl transferase, group 1  24.54 
 
 		 416 aa  64.7  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.955462  normal  0.431404 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  27.17 
 
 		 423 aa  64.7  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4841  glycosyl transferase, group 1  25.33 
 
 		 374 aa  63.9  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000142373  normal  0.0561788 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7428  glycosyl transferase group 1  26.83 
 
 		 388 aa  63.5  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.223976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2506  glycosyl transferase group 1  27.75 
 
 		 774 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1916  glycosyltransferase  20.75 
 
 		 390 aa  62  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0095  glycosyl transferase group 1  28.26 
 
 		 378 aa  59.7  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0740  glycosyl transferase, group 1  24.71 
 
 		 823 aa  59.3  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7536  glycosyl transferase group 1  29.84 
 
 		 762 aa  59.3  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961442  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1450  glycosyl transferase group 1  22.14 
 
 		 411 aa  57.8  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.925912  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2433  glycosyl transferase, group 1  25.81 
 
 		 417 aa  57  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  23.26 
 
 		 348 aa  57  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1032  glycosyl transferase group 1  25.7 
 
 		 413 aa  57.4  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4331  glycosyl transferase group 1  27.63 
 
 		 422 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0666241 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  27.34 
 
 		 400 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2407  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.64 
 
 		 385 aa  54.7  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0928502 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4312  glycosyl transferase, group 1  19.95 
 
 		 756 aa  54.3  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49569  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0610  glycosyl transferase group 1  26.92 
 
 		 404 aa  53.9  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0880164 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3169  glycosyl transferase group 1  28.71 
 
 		 409 aa  53.9  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0676  glycosyl transferase, group 1  24.38 
 
 		 396 aa  53.5  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.063849  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0250  glycosyl transferase, group 1  25.54 
 
 		 374 aa  53.5  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.430935  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  28.23 
 
 		 410 aa  53.1  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0542  glycosyl transferase group 1  26.16 
 
 		 414 aa  53.1  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6234  glycosyl transferase group 1  33.13 
 
 		 366 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130468  normal  0.465121 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 		 379 aa  52.4  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2015  glycosyl transferase, group 1  22.86 
 
 		 382 aa  52.8  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2442  glycosyl transferase, group 1  25.6 
 
 		 382 aa  52.8  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3120  glycosyl transferase, group 1  29.31 
 
 		 366 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0017817  unclonable  0.0000176244 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2306  glycosyl transferase group 1  24.11 
 
 		 379 aa  52.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.455622  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0348  glycosyl transferase group 1  22.06 
 
 		 396 aa  51.6  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212038  normal  0.421702 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  28.05 
 
 		 414 aa  52  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3397  glycosyl transferase group 1  24.17 
 
 		 381 aa  51.6  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0479669  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4271  glycosyl transferase group 1  26.45 
 
 		 422 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2285  glycosyl transferase group 1  32 
 
 		 410 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0267673  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0485  putative glycosyl transferase  22.78 
 
 		 471 aa  50.8  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3942  glycosyl transferase group 1  28.11 
 
 		 395 aa  50.4  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.484579  normal  0.520896 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4956  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 340 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  25.24 
 
 		 360 aa  50.1  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3375  glycosyl transferase group 1  27.31 
 
 		 399 aa  50.1  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.133943  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1676  glycosyl transferase, group 1  27.88 
 
 		 639 aa  49.3  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3899  glycosyl transferase group 1  28.36 
 
 		 382 aa  48.9  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  28.36 
 
 		 375 aa  48.1  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1104  glycosyl transferase, group 1  23.97 
 
 		 396 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0552505  hitchhiker  0.00694846 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  28.4 
 
 		 408 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2187  glycosyl transferase group 1  33.72 
 
 		 386 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4512  glycosyl transferase group 1  26.52 
 
 		 375 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.115065  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0256  glycosyl transferase group 1  30.56 
 
 		 415 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6430  glycosyl transferase group 1  30.88 
 
 		 366 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.706841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5602  glycosyl transferase group 1  22.95 
 
 		 399 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115159  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1846  glycosyl transferase group 1  27.5 
 
 		 415 aa  48.1  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0255  glycosyl transferase group 1  25.74 
 
 		 358 aa  48.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0359  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 410 aa  47.8  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0582  glycosyl transferase group 1  18.47 
 
 		 374 aa  47.4  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.838889  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8172  glycosyl transferase group 1  28.15 
 
 		 356 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2577  glycosyl transferase, group 1  23.87 
 
 		 767 aa  47.4  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.161849  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3418  glycosyl transferase group 1  26.5 
 
 		 378 aa  47  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000166377  hitchhiker  0.0000275934 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  24.07 
 
 		 413 aa  47  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2715  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 		 375 aa  47.4  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5249  glycosyl transferase group 1  26.13 
 
 		 386 aa  47  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4092  glycosyl transferase group 1  34.04 
 
 		 359 aa  47  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0358  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 310 aa  46.6  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0154826  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0362  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  28.11 
 
 		 598 aa  46.6  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1885  glycosyl transferase, group 1  26.32 
 
 		 389 aa  46.6  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.343299  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  30.65 
 
 		 421 aa  46.6  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2391  glycosyl transferase, group 1  22.76 
 
 		 382 aa  46.6  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.481702  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  26.34 
 
 		 386 aa  46.6  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28310  glycosyltransferase  35 
 
 		 417 aa  46.6  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0640064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0365  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.63 
 
 		 398 aa  45.8  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>